RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000324444.7

SYNE4-201, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene SYNE4, Length 1,354 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-201ENST00000324444 NR5A1Q13285 461 aa20.59■□□□□ 0.89
SYNE4-201ENST00000324444 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP20.59■□□□□ 0.89
SYNE4-201ENST00000324444 STK38Q15208 465 aa20.59■□□□□ 0.89
SYNE4-201ENST00000324444 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
SYNE4-201ENST00000324444 ANO1Q5XXA6 986 aa20.59■□□□□ 0.89
SYNE4-201ENST00000324444 FAM173BQ6P4H8 233 aa20.59■□□□□ 0.89
SYNE4-201ENST00000324444 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
SYNE4-201ENST00000324444 PSTPIP2Q9H939 334 aa20.59■□□□□ 0.89
SYNE4-201ENST00000324444 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
SYNE4-201ENST00000324444 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa20.59■□□□□ 0.89
SYNE4-201ENST00000324444 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa20.59■□□□□ 0.89
SYNE4-201ENST00000324444 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
SYNE4-201ENST00000324444 CTGFP29279 349 aa20.59■□□□□ 0.89
SYNE4-201ENST00000324444 PSMC4P43686 418 aa20.59■□□□□ 0.89
SYNE4-201ENST00000324444 COG2Q14746 738 aa20.59■□□□□ 0.89
SYNE4-201ENST00000324444 NPY5RQ15761 445 aa20.59■□□□□ 0.89
SYNE4-201ENST00000324444 SAMD3Q8N6K7 520 aa20.59■□□□□ 0.89
SYNE4-201ENST00000324444 TNFRSF25Q93038 417 aa20.59■□□□□ 0.89
SYNE4-201ENST00000324444 COA7Q96BR5 231 aa20.59■□□□□ 0.89
SYNE4-201ENST00000324444 ARMC5Q96C12 935 aa20.59■□□□□ 0.89
SYNE4-201ENST00000324444 USP28Q96RU2 1077 aa20.59■□□□□ 0.89
SYNE4-201ENST00000324444 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
SYNE4-201ENST00000324444 PNMA3Q9UL41 463 aa20.59■□□□□ 0.89
SYNE4-201ENST00000324444 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
SYNE4-201ENST00000324444 ABCB11O95342 1321 aa20.58■□□□□ 0.89
SYNE4-201ENST00000324444 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
SYNE4-201ENST00000324444 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa20.58■□□□□ 0.88
SYNE4-201ENST00000324444 GNRH1P01148 92 aa20.58■□□□□ 0.88
SYNE4-201ENST00000324444 BCRP11274 1271 aa20.58■□□□□ 0.88
SYNE4-201ENST00000324444 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
SYNE4-201ENST00000324444 NBR1Q14596 966 aa20.58■□□□□ 0.88
SYNE4-201ENST00000324444 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP20.58■□□□□ 0.88
SYNE4-201ENST00000324444 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa20.58■□□□□ 0.88
SYNE4-201ENST00000324444 TREML2Q5T2D2 321 aa20.58■□□□□ 0.88
SYNE4-201ENST00000324444 TYW1BQ6NUM6 668 aa20.58■□□□□ 0.88
SYNE4-201ENST00000324444 OXER1Q8TDS5 423 aa20.58■□□□□ 0.88
SYNE4-201ENST00000324444 SHISA4Q96DD7 197 aa20.58■□□□□ 0.88
SYNE4-201ENST00000324444 TRIM47Q96LD4 638 aa20.58■□□□□ 0.88
SYNE4-201ENST00000324444 MAF1Q9H063 256 aa20.58■□□□□ 0.88
SYNE4-201ENST00000324444 FBXO28Q9NVF7 368 aa20.58■□□□□ 0.88
SYNE4-201ENST00000324444 PCDHA6Q9UN73 950 aa20.58■□□□□ 0.88
SYNE4-201ENST00000324444 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa20.58■□□□□ 0.88
SYNE4-201ENST00000324444 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
SYNE4-201ENST00000324444 M0R2N6 131 aa20.57■□□□□ 0.88
SYNE4-201ENST00000324444 TRAK2O60296 914 aa20.57■□□□□ 0.88
SYNE4-201ENST00000324444 PPP6R2O75170 966 aa20.57■□□□□ 0.88
SYNE4-201ENST00000324444 FOSP01100 380 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
SYNE4-201ENST00000324444 ICAM1P05362 532 aa20.57■□□□□ 0.88
SYNE4-201ENST00000324444 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
SYNE4-201ENST00000324444 OAZ1P54368 228 aa20.57■□□□□ 0.88
SYNE4-201ENST00000324444 AP3B2Q13367 1082 aa20.57■□□□□ 0.88
SYNE4-201ENST00000324444 SLC39A14Q15043 492 aa20.57■□□□□ 0.88
SYNE4-201ENST00000324444 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa20.57■□□□□ 0.88
SYNE4-201ENST00000324444 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
SYNE4-201ENST00000324444 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
SYNE4-201ENST00000324444 POTEFA5A3E0 1075 aa20.56■□□□□ 0.88
SYNE4-201ENST00000324444 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
SYNE4-201ENST00000324444 KLHL40Q2TBA0 621 aa20.56■□□□□ 0.88
SYNE4-201ENST00000324444 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa20.56■□□□□ 0.88
SYNE4-201ENST00000324444 LINC00301Q8NCQ3 95 aa20.56■□□□□ 0.88
SYNE4-201ENST00000324444 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa20.56■□□□□ 0.88
SYNE4-201ENST00000324444 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
SYNE4-201ENST00000324444 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
SYNE4-201ENST00000324444 BRCA2P51587 3418 aa20.55■□□□□ 0.88
SYNE4-201ENST00000324444 SPTLC2O15270 562 aa20.55■□□□□ 0.88
SYNE4-201ENST00000324444 DSG3P32926 999 aa20.55■□□□□ 0.88
SYNE4-201ENST00000324444 MCF2L2Q86YR7 1114 aa20.55■□□□□ 0.88
SYNE4-201ENST00000324444 MB21D1Q8N884 522 aa20.55■□□□□ 0.88
SYNE4-201ENST00000324444 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF333Q96JL9 665 aa20.55■□□□□ 0.88
SYNE4-201ENST00000324444 GDPD2Q9HCC8 539 aa20.55■□□□□ 0.88
SYNE4-201ENST00000324444 SRRDQ9UH36 339 aa20.55■□□□□ 0.88
SYNE4-201ENST00000324444 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa20.55■□□□□ 0.88
SYNE4-201ENST00000324444 SMCHD1A6NHR9 2005 aa20.54■□□□□ 0.88
SYNE4-201ENST00000324444 PIK3CDO00329 1044 aa20.54■□□□□ 0.88
SYNE4-201ENST00000324444 OSBPP22059 807 aa20.54■□□□□ 0.88
SYNE4-201ENST00000324444 HOXD10P28358 340 aa20.54■□□□□ 0.88
SYNE4-201ENST00000324444 ME1P48163 572 aa20.54■□□□□ 0.88
SYNE4-201ENST00000324444 PRMT2P55345 433 aa20.54■□□□□ 0.88
SYNE4-201ENST00000324444 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
SYNE4-201ENST00000324444 TTC38Q5R3I4 469 aa20.54■□□□□ 0.88
SYNE4-201ENST00000324444 SH3TC2Q8TF17 1288 aa20.54■□□□□ 0.88
SYNE4-201ENST00000324444 EHMT1Q9H9B1 1298 aa20.54■□□□□ 0.88
SYNE4-201ENST00000324444 CCPG1Q9ULG6 757 aa20.54■□□□□ 0.88
SYNE4-201ENST00000324444 CLK2P49760 499 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
SYNE4-201ENST00000324444 FCGRTP55899 365 aa20.53■□□□□ 0.88
SYNE4-201ENST00000324444 TKFCQ3LXA3 575 aa20.53■□□□□ 0.88
SYNE4-201ENST00000324444 USH1GQ495M9 461 aa20.53■□□□□ 0.88
SYNE4-201ENST00000324444 CCDC174Q6PII3 467 aa20.53■□□□□ 0.88
SYNE4-201ENST00000324444 CLIC4Q9Y696 253 aa20.53■□□□□ 0.88
SYNE4-201ENST00000324444 SPDYE3A6NKU9 549 aa20.52■□□□□ 0.88
SYNE4-201ENST00000324444 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
SYNE4-201ENST00000324444 LAD1O00515 517 aa20.52■□□□□ 0.88
SYNE4-201ENST00000324444 VWA5AO00534 786 aa20.52■□□□□ 0.88
SYNE4-201ENST00000324444 ATP2A1O14983 1001 aa20.52■□□□□ 0.88
SYNE4-201ENST00000324444 MYCP01106 439 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
SYNE4-201ENST00000324444 ADALQ6DHV7 355 aa20.52■□□□□ 0.88
SYNE4-201ENST00000324444 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
SYNE4-201ENST00000324444 LBX2Q6XYB7 198 aa20.52■□□□□ 0.88
SYNE4-201ENST00000324444 NEK8Q86SG6 692 aa20.52■□□□□ 0.88
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