RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 MYL3P08590 195 aa9.38□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 IQCF3P0C7M6 154 aa9.38□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 BMP3P12645 472 aa9.38□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 SMPD1P17405 629 aa9.38□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 KCNA5P22460 613 aa9.38□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 STAT2P52630 851 aa9.38□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 PSMC6P62333 389 aa9.38□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
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PGGT1B-201ENST00000296642 NFRKBQ6P4R8 1299 aa9.38□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM133AQ8N9E0 248 aa9.38□□□□□ -0.91
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PGGT1B-201ENST00000296642 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa9.38□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 RNF146Q9NTX7 359 aa9.38□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 CLIP2Q9UDT6 1046 aa9.38□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 PRKAG3Q9UGI9 489 aa9.38□□□□□ -0.91
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PGGT1B-201ENST00000296642 NCK2O43639 380 aa9.37□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 ST18O60284 1047 aa9.37□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 TTLL1O95922 423 aa9.37□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 CYP2C9P11712 490 aa9.37□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 ADD2P35612 726 aa9.37□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 UBE3CQ15386 1083 aa9.37□□□□□ -0.91
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PGGT1B-201ENST00000296642 SAMD11Q96NU1 681 aa9.37□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 TRERF1Q96PN7 1200 aa9.37□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 RAD9AQ99638 391 aa9.37□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 KATNBL1Q9H079 304 aa9.37□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 PAG1Q9NWQ8 432 aa9.37□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 PNMA2Q9UL42 364 aa9.37□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 MUC6Q6W4X9 2439 aa9.37□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 GRIN2DO15399 1336 aa9.36□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa9.36□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa9.36□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 HMMRO75330 724 aa9.36□□□□□ -0.91
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PGGT1B-201ENST00000296642 KRT40Q6A162 431 aa9.36□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 CNKSR3Q6P9H4 555 aa9.36□□□□□ -0.91
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PGGT1B-201ENST00000296642 OR6J1Q8NGC5 347 aa9.36□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 GDPD5Q8WTR4 605 aa9.36□□□□□ -0.91
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PGGT1B-201ENST00000296642 WDR11Q9BZH6 1224 aa9.36□□□□□ -0.91
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PGGT1B-201ENST00000296642 GRXCR2A6NFK2 248 aa9.35□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 EPOPA6NHQ4 379 aa9.35□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 MINDY4BA8MYZ0 360 aa9.35□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM232C9JQI7 657 aa9.35□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 PRKAB2O43741 272 aa9.35□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 TSPY3P0CV98 308 aa9.35□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 TSPY8P0CW00 308 aa9.35□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 GNAT2P19087 354 aa9.35□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC1A4P43007 532 aa9.35□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 ERVK-21P61565 698 aa9.35□□□□□ -0.91
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PGGT1B-201ENST00000296642 IKBKEQ14164 716 aa9.35□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 PPP2R5BQ15173 497 aa9.35□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 NBPF20Q3BBV1 942 aa9.35□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 SBK1Q52WX2 424 aa9.35□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 CTR9Q6PD62 1173 aa9.35□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 NSMFQ6X4W1 530 aa9.35□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 RHPN1Q8TCX5 695 aa9.35□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 STAG1Q8WVM7 1258 aa9.35□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP9.35□□□□□ -0.911e-5■□□□□ 10.3
PGGT1B-201ENST00000296642 FGD4Q96M96 766 aa9.35□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 INSL6Q9Y581 213 aa9.35□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 MCM3APO60318 1980 aa9.35□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 ZBED9Q6R2W3 1325 aa9.34□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa9.34□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 SOWAHBA6NEL2 793 aa9.34□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 LPXNO60711 386 aa9.34□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 PLA2G6O60733 806 aa9.34□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 GJB5O95377 273 aa9.34□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 IL9P15248 144 aa9.34□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 SELPP16109 830 aa9.34□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 TDO2P48775 406 aa9.34□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 WDR5P61964 334 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 PDE4BQ07343 736 aa9.34□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 PDE4DQ08499 809 aa9.34□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 PTGISQ16647 500 aa9.34□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 TAPT1Q6NXT6 567 aa9.34□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 EP400NLQ6ZTU2 488 aa9.34□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
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