RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-201ENST00000284957 TUBE1Q9UJT0 475 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-201ENST00000284957 PIK3CDO00329 1044 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-201ENST00000284957 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-201ENST00000284957 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM200AQ8TCP9 573 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-201ENST00000284957 DHX58Q96C10 678 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-201ENST00000284957 SLF1Q9BQI6 1058 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-201ENST00000284957 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-201ENST00000284957 GRIN3BO60391 1043 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-201ENST00000284957 PRR29P0C7W0 189 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-201ENST00000284957 USP14P54578 494 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-201ENST00000284957 AP3B2Q13367 1082 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-201ENST00000284957 VGLL4Q14135 290 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-201ENST00000284957 LDHDQ86WU2 507 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-201ENST00000284957 AGBL1Q96MI9 1066 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-201ENST00000284957 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-201ENST00000284957 AS3MTQ9HBK9 375 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-201ENST00000284957 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-201ENST00000284957 PTPRFP10586 1907 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-201ENST00000284957 HMGCS2P54868 508 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-201ENST00000284957 STX1AQ16623 288 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-201ENST00000284957 LUZP1Q86V48 1076 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-201ENST00000284957 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-201ENST00000284957 WDR90Q96KV7 1748 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-201ENST00000284957 TANGO6Q9C0B7 1094 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-201ENST00000284957 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-201ENST00000284957 CBX8Q9HC52 389 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-201ENST00000284957 DPCR1Q3MIW9 517 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-201ENST00000284957 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-201ENST00000284957 HAS1Q92839 578 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-201ENST00000284957 WNK4Q96J92 1243 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-201ENST00000284957 C12orf42Q96LP6 360 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-201ENST00000284957 ARID3AQ99856 593 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-201ENST00000284957 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGEF1-201ENST00000284957 BIN1O00499 593 aa10.58□□□□□ -0.72
RABGEF1-201ENST00000284957 FLOT1O75955 427 aa10.58□□□□□ -0.72
RABGEF1-201ENST00000284957 ICAM1P05362 532 aa10.58□□□□□ -0.72
RABGEF1-201ENST00000284957 SLFN14P0C7P3 912 aa10.58□□□□□ -0.72
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF165P49910 485 aa10.58□□□□□ -0.72
RABGEF1-201ENST00000284957 IGSF22Q8N9C0 903 aa10.58□□□□□ -0.72
RABGEF1-201ENST00000284957 MTRQ99707 1265 aa10.58□□□□□ -0.72
RABGEF1-201ENST00000284957 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa10.58□□□□□ -0.72
RABGEF1-201ENST00000284957 TECP42680 631 aa10.58□□□□□ -0.72
RABGEF1-201ENST00000284957 USP11P51784 963 aa10.58□□□□□ -0.72
RABGEF1-201ENST00000284957 KARSQ15046 597 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
RABGEF1-201ENST00000284957 POSTNQ15063 836 aa10.58□□□□□ -0.72
RABGEF1-201ENST00000284957 CALCRLQ16602 461 aa10.58□□□□□ -0.72
RABGEF1-201ENST00000284957 UVSSAQ2YD98 709 aa10.58□□□□□ -0.72
RABGEF1-201ENST00000284957 PDXDC2PQ6P474 469 aa10.58□□□□□ -0.72
RABGEF1-201ENST00000284957 LRRC15Q8TF66 581 aa10.58□□□□□ -0.72
RABGEF1-201ENST00000284957 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa10.58□□□□□ -0.72
RABGEF1-201ENST00000284957 MBOAT7Q96N66 472 aa10.58□□□□□ -0.72
RABGEF1-201ENST00000284957 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
RABGEF1-201ENST00000284957 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa10.58□□□□□ -0.72
RABGEF1-201ENST00000284957 AP5Z1O43299 807 aa10.58□□□□□ -0.72
RABGEF1-201ENST00000284957 BMP6P22004 513 aa10.58□□□□□ -0.72
RABGEF1-201ENST00000284957 CYP3A7P24462 503 aa10.58□□□□□ -0.72
RABGEF1-201ENST00000284957 SREBF1P36956 1147 aa10.58□□□□□ -0.72
RABGEF1-201ENST00000284957 TXKP42681 527 aa10.58□□□□□ -0.72
RABGEF1-201ENST00000284957 SARSP49591 514 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
RABGEF1-201ENST00000284957 MAP3K9P80192 1104 aa10.58□□□□□ -0.72
RABGEF1-201ENST00000284957 ARHGAP4P98171 946 aa10.58□□□□□ -0.72
RABGEF1-201ENST00000284957 IQCB1Q15051 598 aa10.58□□□□□ -0.72
RABGEF1-201ENST00000284957 NT5DC1Q5TFE4 455 aa10.58□□□□□ -0.72
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM43AQ8N2R8 423 aa10.58□□□□□ -0.72
RABGEF1-201ENST00000284957 SPATA20Q8TB22 786 aa10.58□□□□□ -0.72
RABGEF1-201ENST00000284957 GJA10Q969M2 543 aa10.58□□□□□ -0.72
RABGEF1-201ENST00000284957 CDCA5Q96FF9 252 aa10.58□□□□□ -0.72
RABGEF1-201ENST00000284957 PAGE5Q96GU1 130 aa10.58□□□□□ -0.72
RABGEF1-201ENST00000284957 ANO10Q9NW15 660 aa10.58□□□□□ -0.72
RABGEF1-201ENST00000284957 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
RABGEF1-201ENST00000284957 C19orf81C9J6K1 198 aa10.57□□□□□ -0.72
RABGEF1-201ENST00000284957 CFBP00751 764 aa10.57□□□□□ -0.72
RABGEF1-201ENST00000284957 TRAF1Q13077 416 aa10.57□□□□□ -0.72
RABGEF1-201ENST00000284957 NAALADL2Q58DX5 795 aa10.57□□□□□ -0.72
RABGEF1-201ENST00000284957 ISM2Q6H9L7 571 aa10.57□□□□□ -0.72
RABGEF1-201ENST00000284957 MOB2Q70IA6 237 aa10.57□□□□□ -0.72
RABGEF1-201ENST00000284957 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
RABGEF1-201ENST00000284957 CCSER1Q9C0I3 900 aa10.57□□□□□ -0.72
RABGEF1-201ENST00000284957 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
RABGEF1-201ENST00000284957 FOSP01100 380 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
RABGEF1-201ENST00000284957 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
RABGEF1-201ENST00000284957 CLEC4DQ8WXI8 215 aa10.57□□□□□ -0.72
RABGEF1-201ENST00000284957 LENG9Q96B70 501 aa10.57□□□□□ -0.72
RABGEF1-201ENST00000284957 CCPG1Q9ULG6 757 aa10.57□□□□□ -0.72
RABGEF1-201ENST00000284957 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
RABGEF1-201ENST00000284957 ABCB11O95342 1321 aa10.57□□□□□ -0.72
RABGEF1-201ENST00000284957 SPDYE3A6NKU9 549 aa10.57□□□□□ -0.72
RABGEF1-201ENST00000284957 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
RABGEF1-201ENST00000284957 POTEIP0CG38 1075 aa10.57□□□□□ -0.72
RABGEF1-201ENST00000284957 POTEJP0CG39 1038 aa10.57□□□□□ -0.72
RABGEF1-201ENST00000284957 CASP1P29466 404 aa10.57□□□□□ -0.72
RABGEF1-201ENST00000284957 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP10.57□□□□□ -0.72
RABGEF1-201ENST00000284957 NLRP12P59046 1061 aa10.57□□□□□ -0.72
RABGEF1-201ENST00000284957 MCTP2Q6DN12 878 aa10.57□□□□□ -0.72
RABGEF1-201ENST00000284957 IQUBQ8NA54 791 aa10.57□□□□□ -0.72
RABGEF1-201ENST00000284957 PDLIM2Q96JY6 352 aa10.57□□□□□ -0.72
RABGEF1-201ENST00000284957 AK8Q96MA6 479 aa10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms