RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 VPS41P49754 854 aa23.11■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 YARSP54577 528 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 RBL2Q08999 1139 aa23.11■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 GJA10Q969M2 543 aa23.11■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 AMNQ9BXJ7 453 aa23.11■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 FAM114A2Q9NRY5 505 aa23.11■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 RNF14Q9UBS8 474 aa23.11■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 MMP1P03956 469 aa23.11■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 NSFP46459 744 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 EPHB4P54760 987 aa23.11■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 hCG_1984214I3L0E3 225 aa23.11■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 TXNDC9O14530 226 aa23.1■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 LTKP29376 864 aa23.1■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 SLC17A8Q8NDX2 589 aa23.1■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 M0QZ92 97 aa23.1■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 STK17AQ9UEE5 414 aa23.1■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 NEO1Q92859 1461 aa23.1■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 M0R2C6 588 aa23.1■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 SLC8A1P32418 973 aa23.1■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 MAP2K2P36507 400 aa23.1■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 LMNB2Q03252 620 aa23.1■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 BSPRYQ5W0U4 402 aa23.1■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 ODR4Q5SWX8 454 aa23.09■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 MLXIPQ9HAP2 919 aa23.09■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 GAP43P17677 238 aa23.09■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 NR2F2P24468 414 aa23.09■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 BFSP1Q12934 665 aa23.09■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC127Q96BQ5 260 aa23.09■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 MAN1B1Q9UKM7 699 aa23.09■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa23.09■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC151A5D8V7 595 aa23.09■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 PTK2Q05397 1052 aa23.09■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 MFAP3P55082 362 aa23.08■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 PTPROQ16827 1216 aa23.08■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 SH2D4BQ5SQS7 431 aa23.08■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC170Q8IYT3 715 aa23.08■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF148Q9UQR1 794 aa23.08■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 DLATP10515 647 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 TRIM50Q86XT4 487 aa23.08■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 RWDD2AQ9UIY3 292 aa23.08■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 LEMD3Q9Y2U8 911 aa23.08■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 KDM5CP41229 1560 aa23.08■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM232C9JQI7 657 aa23.08■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 RNF8O76064 485 aa23.08■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 NACA2Q9H009 215 aa23.08■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 HESX1Q9UBX0 185 aa23.08■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 TTLL3Q9Y4R7 772 aa23.08■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 MYL7Q01449 175 aa23.08■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 CYP4A11Q02928 519 aa23.08■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 RESTQ13127 1097 aa23.08■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 MYO1FO00160 1098 aa23.07■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 ENC1O14682 589 aa23.07■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 GABPAQ06546 454 aa23.07■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 MUM1Q2TAK8 710 aa23.07■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 VSTM4Q8IW00 320 aa23.07■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 CEP120Q8N960 986 aa23.07■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 SCYL2Q6P3W7 929 aa23.07■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 TRIM11Q96F44 468 aa23.07■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 NT5C1BQ96P26 610 aa23.07■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 ADPGKQ9BRR6 497 aa23.07■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 TTC37Q6PGP7 1564 aa23.07■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 LIFRP42702 1097 aa23.07■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 AFPP02771 609 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 LIG3P49916 1009 aa23.06■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 EEF2KMTQ96G04 330 aa23.06■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM191BP0C7N4 346 aa23.06■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 NECTIN1Q15223 517 aa23.06■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 DCAF15Q66K64 600 aa23.06■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 ARHGEF25Q86VW2 580 aa23.06■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 SIRT2Q8IXJ6 389 aa23.06■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 XDHP47989 1333 aa23.06■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 ZBED6P86452 979 aa23.06■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 POLA2Q14181 598 aa23.06■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 FLAD1Q8NFF5 587 aa23.06■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 SUN1O94901 812 aa23.05■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 ABCB5Q2M3G0 1257 aa23.05■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 KIF11P52732 1056 aa23.05■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 LRRC8CQ8TDW0 803 aa23.05■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa23.05■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 ARHGAP42A6NI28 874 aa23.05■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 SIK1P57059 783 aa23.05■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 ARHGAP4P98171 946 aa23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.7 ms