RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265339.6

UBE2B-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2B, Length 2,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-201ENST00000265339 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
UBE2B-201ENST00000265339 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
UBE2B-201ENST00000265339 PTPRFP10586 1907 aa22.99■■□□□ 1.27
UBE2B-201ENST00000265339 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa22.99■■□□□ 1.27
UBE2B-201ENST00000265339 ADAMTS3O15072 1205 aa22.99■■□□□ 1.27
UBE2B-201ENST00000265339 KRT2P35908 639 aa22.99■■□□□ 1.27
UBE2B-201ENST00000265339 HMGCS2P54868 508 aa22.99■■□□□ 1.27
UBE2B-201ENST00000265339 CCDC148Q8NFR7 591 aa22.99■■□□□ 1.27
UBE2B-201ENST00000265339 FBXO28Q9NVF7 368 aa22.99■■□□□ 1.27
UBE2B-201ENST00000265339 RSPH14Q9UHP6 348 aa22.99■■□□□ 1.27
UBE2B-201ENST00000265339 NAPAP54920 295 aa22.99■■□□□ 1.27
UBE2B-201ENST00000265339 NOSTRINQ8IVI9 506 aa22.99■■□□□ 1.27
UBE2B-201ENST00000265339 COA7Q96BR5 231 aa22.99■■□□□ 1.27
UBE2B-201ENST00000265339 PLA2G6O60733 806 aa22.98■■□□□ 1.27
UBE2B-201ENST00000265339 LRRN4CLQ8ND94 238 aa22.98■■□□□ 1.27
UBE2B-201ENST00000265339 FEM1BQ9UK73 627 aa22.98■■□□□ 1.27
UBE2B-201ENST00000265339 hCG_1984214I3L0E3 225 aa22.98■■□□□ 1.27
UBE2B-201ENST00000265339 MYSM1Q5VVJ2 828 aa22.98■■□□□ 1.27
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
UBE2B-201ENST00000265339 CHURC1Q8WUH1 139 aa22.98■■□□□ 1.27
UBE2B-201ENST00000265339 FAM160B2Q86V87 743 aa22.97■■□□□ 1.27
UBE2B-201ENST00000265339 KIFC2Q96AC6 838 aa22.97■■□□□ 1.27
UBE2B-201ENST00000265339 C12orf42Q96LP6 360 aa22.97■■□□□ 1.27
UBE2B-201ENST00000265339 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP22.97■■□□□ 1.27
UBE2B-201ENST00000265339 BRMS1Q9HCU9 246 aa22.97■■□□□ 1.27
UBE2B-201ENST00000265339 C19orf81C9J6K1 198 aa22.97■■□□□ 1.27
UBE2B-201ENST00000265339 CALML3P27482 149 aa22.97■■□□□ 1.27
UBE2B-201ENST00000265339 CCZ1BP86790 482 aa22.97■■□□□ 1.27
UBE2B-201ENST00000265339 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
UBE2B-201ENST00000265339 KRBA2Q6ZNG9 492 aa22.97■■□□□ 1.27
UBE2B-201ENST00000265339 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
UBE2B-201ENST00000265339 TNFRSF25Q93038 417 aa22.97■■□□□ 1.27
UBE2B-201ENST00000265339 ZMYND12Q9H0C1 365 aa22.97■■□□□ 1.27
UBE2B-201ENST00000265339 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
UBE2B-201ENST00000265339 PCDHA4Q9UN74 947 aa22.97■■□□□ 1.27
UBE2B-201ENST00000265339 PARP14Q460N5 1801 aa22.96■■□□□ 1.27
UBE2B-201ENST00000265339 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa22.96■■□□□ 1.27
UBE2B-201ENST00000265339 LDLRAD1Q5T700 205 aa22.96■■□□□ 1.27
UBE2B-201ENST00000265339 SYT10Q6XYQ8 523 aa22.96■■□□□ 1.27
UBE2B-201ENST00000265339 TXLNBQ8N3L3 684 aa22.96■■□□□ 1.27
UBE2B-201ENST00000265339 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
UBE2B-201ENST00000265339 OTUD5Q96G74 571 aa22.96■■□□□ 1.27
UBE2B-201ENST00000265339 TANGO6Q9C0B7 1094 aa22.96■■□□□ 1.27
UBE2B-201ENST00000265339 RASSF4Q9H2L5 321 aa22.96■■□□□ 1.27
UBE2B-201ENST00000265339 CFAP45Q9UL16 551 aa22.96■■□□□ 1.27
UBE2B-201ENST00000265339 ERO1BQ86YB8 467 aa22.96■■□□□ 1.27
UBE2B-201ENST00000265339 USP28Q96RU2 1077 aa22.96■■□□□ 1.27
UBE2B-201ENST00000265339 SPDYE5A6NIY4 337 aa22.95■■□□□ 1.26
UBE2B-201ENST00000265339 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
UBE2B-201ENST00000265339 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
UBE2B-201ENST00000265339 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
UBE2B-201ENST00000265339 BLIDQ8IZY5 108 aa22.95■■□□□ 1.26
UBE2B-201ENST00000265339 DAGLBQ8NCG7 672 aa22.95■■□□□ 1.26
UBE2B-201ENST00000265339 FAM205CA6NFA0 338 aa22.95■■□□□ 1.26
UBE2B-201ENST00000265339 TPM4P67936 248 aa22.95■■□□□ 1.26
UBE2B-201ENST00000265339 PPATQ06203 517 aa22.95■■□□□ 1.26
UBE2B-201ENST00000265339 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
UBE2B-201ENST00000265339 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa22.95■■□□□ 1.26
UBE2B-201ENST00000265339 EFCC1Q9HA90 598 aa22.95■■□□□ 1.26
UBE2B-201ENST00000265339 ESYT2A0FGR8 921 aa22.94■■□□□ 1.26
UBE2B-201ENST00000265339 SMCO2A6NFE2 343 aa22.94■■□□□ 1.26
UBE2B-201ENST00000265339 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
UBE2B-201ENST00000265339 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
UBE2B-201ENST00000265339 SH3D19Q5HYK7 790 aa22.94■■□□□ 1.26
UBE2B-201ENST00000265339 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
UBE2B-201ENST00000265339 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
UBE2B-201ENST00000265339 A0A087WWV3 80 aa22.93■■□□□ 1.26
UBE2B-201ENST00000265339 M0R2N6 131 aa22.93■■□□□ 1.26
UBE2B-201ENST00000265339 IRF6O14896 467 aa22.93■■□□□ 1.26
UBE2B-201ENST00000265339 GALNT17Q6IS24 598 aa22.93■■□□□ 1.26
UBE2B-201ENST00000265339 CHADLQ6NUI6 762 aa22.93■■□□□ 1.26
UBE2B-201ENST00000265339 PPP1R18Q6NYC8 613 aa22.93■■□□□ 1.26
UBE2B-201ENST00000265339 RASGRP4Q8TDF6 673 aa22.93■■□□□ 1.26
UBE2B-201ENST00000265339 SLF1Q9BQI6 1058 aa22.93■■□□□ 1.26
UBE2B-201ENST00000265339 TMOD4Q9NZQ9 345 aa22.93■■□□□ 1.26
UBE2B-201ENST00000265339 LOC285556D6RIA3 1793 aa22.93■■□□□ 1.26
UBE2B-201ENST00000265339 CELF2O95319 508 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
UBE2B-201ENST00000265339 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
UBE2B-201ENST00000265339 IQCB1Q15051 598 aa22.93■■□□□ 1.26
UBE2B-201ENST00000265339 C10orf67Q8IYJ2 551 aa22.93■■□□□ 1.26
UBE2B-201ENST00000265339 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa22.93■■□□□ 1.26
UBE2B-201ENST00000265339 FLOT1O75955 427 aa22.92■■□□□ 1.26
UBE2B-201ENST00000265339 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
UBE2B-201ENST00000265339 SARM1Q6SZW1 724 aa22.92■■□□□ 1.26
UBE2B-201ENST00000265339 TMCO3Q6UWJ1 677 aa22.92■■□□□ 1.26
UBE2B-201ENST00000265339 FBXO11Q86XK2 927 aa22.92■■□□□ 1.26
UBE2B-201ENST00000265339 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
UBE2B-201ENST00000265339 AMNQ9BXJ7 453 aa22.92■■□□□ 1.26
UBE2B-201ENST00000265339 L2HGDHQ9H9P8 463 aa22.92■■□□□ 1.26
UBE2B-201ENST00000265339 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
UBE2B-201ENST00000265339 C6orf50Q9HD87 102 aa22.92■■□□□ 1.26
UBE2B-201ENST00000265339 RLFQ13129 1914 aa22.92■■□□□ 1.26
UBE2B-201ENST00000265339 MUM1L1Q5H9M0 696 aa22.92■■□□□ 1.26
UBE2B-201ENST00000265339 ATL3Q6DD88 541 aa22.92■■□□□ 1.26
UBE2B-201ENST00000265339 OPTNQ96CV9 577 aa22.92■■□□□ 1.26
UBE2B-201ENST00000265339 TMX1Q9H3N1 280 aa22.92■■□□□ 1.26
UBE2B-201ENST00000265339 USH1GQ495M9 461 aa22.91■■□□□ 1.26
UBE2B-201ENST00000265339 CCDC174Q6PII3 467 aa22.91■■□□□ 1.26
UBE2B-201ENST00000265339 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.5 ms