RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256413.7

CTIF-201, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 5,750 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-201ENST00000256413 CYP27A1Q02318 531 aa17.47■□□□□ 0.39
CTIF-201ENST00000256413 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP17.47■□□□□ 0.39
CTIF-201ENST00000256413 VIPAS39Q9H9C1 493 aa17.47■□□□□ 0.39
CTIF-201ENST00000256413 C6orf229H3BNL8 230 aa17.47■□□□□ 0.39
CTIF-201ENST00000256413 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP17.47■□□□□ 0.39
CTIF-201ENST00000256413 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP17.47■□□□□ 0.395e-6■■■□□ 14.9
CTIF-201ENST00000256413 LARGE1O95461 756 aa17.47■□□□□ 0.39
CTIF-201ENST00000256413 INHBAP08476 426 aa17.47■□□□□ 0.39
CTIF-201ENST00000256413 HSPA6P17066 643 aa17.47■□□□□ 0.39
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CTIF-201ENST00000256413 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa17.47■□□□□ 0.39
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CTIF-201ENST00000256413 TOPBP1Q92547 1522 aa17.47■□□□□ 0.39
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CTIF-201ENST00000256413 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP17.47■□□□□ 0.39
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CTIF-201ENST00000256413 ASPHQ12797 758 aa17.46■□□□□ 0.39
CTIF-201ENST00000256413 MYCT1Q8N699 235 aa17.46■□□□□ 0.39
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CTIF-201ENST00000256413 BPIFA3Q9BQP9 254 aa17.46■□□□□ 0.39
CTIF-201ENST00000256413 TMEM60Q9H2L4 133 aa17.46■□□□□ 0.39
CTIF-201ENST00000256413 SLC39A2Q9NP94 309 aa17.46■□□□□ 0.39
CTIF-201ENST00000256413 RWDD2AQ9UIY3 292 aa17.46■□□□□ 0.39
CTIF-201ENST00000256413 ZNF521Q96K83 1311 aa17.46■□□□□ 0.39
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CTIF-201ENST00000256413 SMTNP53814 917 aa17.46■□□□□ 0.39
CTIF-201ENST00000256413 OTUD6AQ7L8S5 288 aa17.46■□□□□ 0.39
CTIF-201ENST00000256413 ZNF654Q8IZM8 581 aa17.46■□□□□ 0.39
CTIF-201ENST00000256413 CHMP6Q96FZ7 201 aa17.46■□□□□ 0.39
CTIF-201ENST00000256413 ZNF148Q9UQR1 794 aa17.46■□□□□ 0.39
CTIF-201ENST00000256413 USP6NLQ92738 828 aa17.46■□□□□ 0.39
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CTIF-201ENST00000256413 EEF2KMTQ96G04 330 aa17.46■□□□□ 0.39
CTIF-201ENST00000256413 EPN3Q9H201 632 aa17.46■□□□□ 0.39
CTIF-201ENST00000256413 DIAPH2O60879 1101 aa17.45■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 KRT3P12035 628 aa17.45■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP17.45■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 CYP4F22Q6NT55 531 aa17.45■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 CCDC138Q96M89 665 aa17.45■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 KIAA0232Q92628 1395 aa17.45■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 PRDM1O75626 825 aa17.45■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 PPP1R37O75864 691 aa17.45■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 TTLL7Q6ZT98 887 aa17.45■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 LMNB1P20700 586 aa17.45■□□□□ 0.38
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CTIF-201ENST00000256413 ETNK1Q9HBU6 452 aa17.45■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 IL13P35225 146 aa17.45■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 KIF11P52732 1056 aa17.45■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 DR1Q01658 176 aa17.45■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP17.45■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 NUDCD1Q96RS6 583 aa17.45■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 ANAPC5Q9UJX4 755 aa17.45■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 ABCC2Q92887 1545 aa17.45■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa17.44■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 TEX9Q8N6V9 391 aa17.44■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 DONSONQ9NYP3 566 aa17.44■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 SATB2Q9UPW6 733 aa17.44■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 ARHGEF35A5YM69 484 aa17.44■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 CCDC188H7C350 402 aa17.44■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 SH3BP5O60239 455 aa17.44■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP17.44■□□□□ 0.381e-6■■■■■ 50.9
CTIF-201ENST00000256413 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 GUCY1A3Q02108 690 aa17.44■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP17.44■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 TMEM232C9JQI7 657 aa17.44■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP17.44■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 PTGDRQ13258 359 aa17.44■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 AP1M1Q9BXS5 423 aa17.44■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa17.44■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 GOLGA8OA6NCC3 632 aa17.44■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 GOLGA8NF8WBI6 632 aa17.44■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP17.44■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 ADCY7P51828 1080 aa17.44■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 SLC12A2P55011 1212 aa17.44■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 BFSP1Q12934 665 aa17.44■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 P2RX5Q93086 422 aa17.44■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 TAF5LO75529 589 aa17.43■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 MAGEF1Q9HAY2 307 aa17.43■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 PICALMQ13492 652 aa17.43■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 MAN2A1Q16706 1144 aa17.43■□□□□ 0.38
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