RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255641.12

CSNK1G2-201, Transcript of casein kinase 1 gamma 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSNK1G2, Length 2,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1G2-201ENST00000255641 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
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CSNK1G2-201ENST00000255641 SPA17Q15506 151 aa23.62■■□□□ 1.37
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CSNK1G2-201ENST00000255641 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa23.61■■□□□ 1.37
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CSNK1G2-201ENST00000255641 KIF11P52732 1056 aa23.6■■□□□ 1.37
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CSNK1G2-201ENST00000255641 RRAGAQ7L523 313 aa23.6■■□□□ 1.37
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CSNK1G2-201ENST00000255641 EHBP1Q8NDI1 1231 aa23.6■■□□□ 1.37
CSNK1G2-201ENST00000255641 MTMR8Q96EF0 704 aa23.6■■□□□ 1.37
CSNK1G2-201ENST00000255641 RUFY1Q96T51 708 aa23.6■■□□□ 1.37
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CSNK1G2-201ENST00000255641 TSPY2A6NKD2 308 aa23.58■■□□□ 1.37
CSNK1G2-201ENST00000255641 TACC1O75410 805 aa23.58■■□□□ 1.37
CSNK1G2-201ENST00000255641 TXNRD1Q16881 649 aa23.58■■□□□ 1.37
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CSNK1G2-201ENST00000255641 LRRC53A6NM62 1247 aa23.58■■□□□ 1.36
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CSNK1G2-201ENST00000255641 RCAN1P53805 252 aa23.58■■□□□ 1.36
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CSNK1G2-201ENST00000255641 NLRC4Q9NPP4 1024 aa23.58■■□□□ 1.36
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CSNK1G2-201ENST00000255641 COL4A1P02462 1669 aa23.57■■□□□ 1.36
CSNK1G2-201ENST00000255641 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
CSNK1G2-201ENST00000255641 SLC1A4P43007 532 aa23.57■■□□□ 1.36
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CSNK1G2-201ENST00000255641 DYMQ7RTS9 669 aa23.57■■□□□ 1.36
CSNK1G2-201ENST00000255641 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa23.57■■□□□ 1.36
CSNK1G2-201ENST00000255641 STIM2Q9P246 746 aa23.57■■□□□ 1.36
CSNK1G2-201ENST00000255641 ARID5AQ03989 594 aa23.57■■□□□ 1.36
CSNK1G2-201ENST00000255641 C8orf74Q6P047 294 aa23.57■■□□□ 1.36
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CSNK1G2-201ENST00000255641 SEMA6BQ9H3T3 888 aa23.57■■□□□ 1.36
CSNK1G2-201ENST00000255641 ANO9A1A5B4 782 aa23.56■■□□□ 1.36
CSNK1G2-201ENST00000255641 RHOBTB3O94955 611 aa23.56■■□□□ 1.36
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CSNK1G2-201ENST00000255641 GUCY2DQ02846 1103 aa23.56■■□□□ 1.36
CSNK1G2-201ENST00000255641 LRRC41Q15345 812 aa23.56■■□□□ 1.36
CSNK1G2-201ENST00000255641 MMGT1Q8N4V1 131 aa23.56■■□□□ 1.36
CSNK1G2-201ENST00000255641 ANAPC4Q9UJX5 808 aa23.56■■□□□ 1.36
CSNK1G2-201ENST00000255641 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
CSNK1G2-201ENST00000255641 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP23.56■■□□□ 1.367e-7■■■□□ 14.6
CSNK1G2-201ENST00000255641 LETM2Q2VYF4 491 aa23.56■■□□□ 1.36
CSNK1G2-201ENST00000255641 AMOTL1Q8IY63 956 aa23.56■■□□□ 1.36
CSNK1G2-201ENST00000255641 SH3GL2Q99962 352 aa23.56■■□□□ 1.36
CSNK1G2-201ENST00000255641 EPB41L5Q9HCM4 733 aa23.56■■□□□ 1.36
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