RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP29.89■■■□□ 2.38
CAPNS1-201ENST00000246533 TOP1P11387 765 aaKnown RBP29.88■■■□□ 2.37
CAPNS1-201ENST00000246533 L2HGDHQ9H9P8 463 aa29.88■■■□□ 2.37
CAPNS1-201ENST00000246533 RBPJLQ9UBG7 517 aa29.88■■■□□ 2.37
CAPNS1-201ENST00000246533 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
CAPNS1-201ENST00000246533 FLOT1O75955 427 aa29.88■■■□□ 2.37
CAPNS1-201ENST00000246533 NLRP12P59046 1061 aa29.88■■■□□ 2.37
CAPNS1-201ENST00000246533 SP3Q02447 781 aa29.88■■■□□ 2.37
CAPNS1-201ENST00000246533 ARID5BQ14865 1188 aa29.88■■■□□ 2.37
CAPNS1-201ENST00000246533 KCTD1Q719H9 257 aa29.88■■■□□ 2.37
CAPNS1-201ENST00000246533 NBPF11Q86T75 865 aa29.88■■■□□ 2.37
CAPNS1-201ENST00000246533 CD99L2Q8TCZ2 262 aa29.88■■■□□ 2.37
CAPNS1-201ENST00000246533 TIGD1Q96MW7 591 aa29.88■■■□□ 2.37
CAPNS1-201ENST00000246533 UBAC1Q9BSL1 405 aa29.88■■■□□ 2.37
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM53CQ9NYF3 392 aa29.88■■■□□ 2.37
CAPNS1-201ENST00000246533 PARP14Q460N5 1801 aa29.87■■■□□ 2.37
CAPNS1-201ENST00000246533 IKBKBO14920 756 aa29.87■■■□□ 2.37
CAPNS1-201ENST00000246533 Q3C1V9 767 aa29.87■■■□□ 2.37
CAPNS1-201ENST00000246533 C8orf76Q96K31 380 aa29.87■■■□□ 2.37
CAPNS1-201ENST00000246533 BRCA2P51587 3418 aa29.87■■■□□ 2.37
CAPNS1-201ENST00000246533 FKTNO75072 461 aa29.86■■■□□ 2.37
CAPNS1-201ENST00000246533 FDPSP14324 419 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
CAPNS1-201ENST00000246533 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP29.86■■■□□ 2.37
CAPNS1-201ENST00000246533 DGKHQ86XP1 1220 aa29.86■■■□□ 2.37
CAPNS1-201ENST00000246533 ATG4CQ96DT6 458 aa29.86■■■□□ 2.37
CAPNS1-201ENST00000246533 PAGR1Q9BTK6 254 aa29.86■■■□□ 2.37
CAPNS1-201ENST00000246533 SPTLC2O15270 562 aa29.86■■■□□ 2.37
CAPNS1-201ENST00000246533 COG2Q14746 738 aa29.86■■■□□ 2.37
CAPNS1-201ENST00000246533 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa29.86■■■□□ 2.37
CAPNS1-201ENST00000246533 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
CAPNS1-201ENST00000246533 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP29.85■■■□□ 2.37
CAPNS1-201ENST00000246533 CNMDO75829 334 aa29.85■■■□□ 2.37
CAPNS1-201ENST00000246533 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP29.85■■■□□ 2.37
CAPNS1-201ENST00000246533 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa29.85■■■□□ 2.37
CAPNS1-201ENST00000246533 BTBD7Q9P203 1132 aa29.85■■■□□ 2.37
CAPNS1-201ENST00000246533 DOCK3Q8IZD9 2030 aa29.85■■■□□ 2.37
CAPNS1-201ENST00000246533 PRC1O43663 620 aa29.84■■■□□ 2.37
CAPNS1-201ENST00000246533 CMA1P23946 247 aa29.84■■■□□ 2.37
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC1A4P43007 532 aa29.84■■■□□ 2.37
CAPNS1-201ENST00000246533 NDUFA8P51970 172 aa29.84■■■□□ 2.37
CAPNS1-201ENST00000246533 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
CAPNS1-201ENST00000246533 ANKS1AQ92625 1134 aa29.84■■■□□ 2.37
CAPNS1-201ENST00000246533 DSG3P32926 999 aa29.84■■■□□ 2.37
CAPNS1-201ENST00000246533 TTBK2Q6IQ55 1244 aa29.84■■■□□ 2.37
CAPNS1-201ENST00000246533 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa29.84■■■□□ 2.37
CAPNS1-201ENST00000246533 PNMA1Q8ND90 353 aa29.84■■■□□ 2.37
CAPNS1-201ENST00000246533 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP29.84■■■□□ 2.37
CAPNS1-201ENST00000246533 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa29.84■■■□□ 2.37
CAPNS1-201ENST00000246533 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP29.83■■■□□ 2.37
CAPNS1-201ENST00000246533 BMP3P12645 472 aa29.83■■■□□ 2.37
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A1B0GVL5 298 aa29.83■■■□□ 2.37
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM232C9JQI7 657 aa29.83■■■□□ 2.37
CAPNS1-201ENST00000246533 PDHBP11177 359 aa29.83■■■□□ 2.37
CAPNS1-201ENST00000246533 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP29.83■■■□□ 2.37
CAPNS1-201ENST00000246533 KMT5BQ4FZB7 885 aa29.83■■■□□ 2.37
CAPNS1-201ENST00000246533 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP29.83■■■□□ 2.37
CAPNS1-201ENST00000246533 MYSM1Q5VVJ2 828 aa29.83■■■□□ 2.37
CAPNS1-201ENST00000246533 GMCL1Q96IK5 515 aa29.83■■■□□ 2.37
CAPNS1-201ENST00000246533 FOSBP53539 338 aa29.82■■■□□ 2.36
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CAPNS1-201ENST00000246533 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP29.81■■■□□ 2.36
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM67Q5HYA8 995 aa29.81■■■□□ 2.36
CAPNS1-201ENST00000246533 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP29.81■■■□□ 2.36
CAPNS1-201ENST00000246533 CPVLQ9H3G5 476 aa29.81■■■□□ 2.36
CAPNS1-201ENST00000246533 KAT14Q9H8E8 782 aa29.81■■■□□ 2.36
CAPNS1-201ENST00000246533 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP29.81■■■□□ 2.36
CAPNS1-201ENST00000246533 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP29.81■■■□□ 2.36
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC16A2P36021 539 aa29.81■■■□□ 2.36
CAPNS1-201ENST00000246533 NT5C2P49902 561 aa29.81■■■□□ 2.36
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM110CQ1W6H9 321 aa29.81■■■□□ 2.36
CAPNS1-201ENST00000246533 DPCR1Q3MIW9 517 aa29.81■■■□□ 2.36
CAPNS1-201ENST00000246533 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP29.81■■■□□ 2.36
CAPNS1-201ENST00000246533 KIFC2Q96AC6 838 aa29.81■■■□□ 2.36
CAPNS1-201ENST00000246533 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa29.81■■■□□ 2.36
CAPNS1-201ENST00000246533 GPCPD1Q9NPB8 672 aa29.81■■■□□ 2.36
CAPNS1-201ENST00000246533 HOXC10Q9NYD6 342 aa29.81■■■□□ 2.36
CAPNS1-201ENST00000246533 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa29.81■■■□□ 2.36
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF202O95125 648 aa29.8■■■□□ 2.36
CAPNS1-201ENST00000246533 SMC2O95347 1197 aa29.8■■■□□ 2.36
CAPNS1-201ENST00000246533 SNAP25P60880 206 aa29.8■■■□□ 2.36
CAPNS1-201ENST00000246533 GUCY1B3Q02153 619 aa29.8■■■□□ 2.36
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CAPNS1-201ENST00000246533 TRIM47Q96LD4 638 aa29.8■■■□□ 2.36
CAPNS1-201ENST00000246533 PORCNQ9H237 461 aa29.8■■■□□ 2.36
CAPNS1-201ENST00000246533 LY9Q9HBG7 655 aa29.8■■■□□ 2.36
CAPNS1-201ENST00000246533 IFNKQ9P0W0 207 aa29.8■■■□□ 2.36
CAPNS1-201ENST00000246533 ERVK-9P63128 1117 aa29.79■■■□□ 2.36
CAPNS1-201ENST00000246533 ERVK-24P63145 666 aa29.79■■■□□ 2.36
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC96Q2M329 555 aa29.79■■■□□ 2.36
CAPNS1-201ENST00000246533 ANO1Q5XXA6 986 aa29.79■■■□□ 2.36
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP29.79■■■□□ 2.36
CAPNS1-201ENST00000246533 SLF1Q9BQI6 1058 aa29.79■■■□□ 2.36
CAPNS1-201ENST00000246533 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP29.79■■■□□ 2.36
CAPNS1-201ENST00000246533 MORF4L1Q9UBU8 362 aa29.79■■■□□ 2.36
CAPNS1-201ENST00000246533 CLIC4Q9Y696 253 aa29.79■■■□□ 2.36
CAPNS1-201ENST00000246533 SNHG28P0DPA3 235 aa29.79■■■□□ 2.36
CAPNS1-201ENST00000246533 WTAPQ15007 396 aa29.79■■■□□ 2.36
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC178Q5BJE1 867 aa29.79■■■□□ 2.36
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