RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243056.4

HOXC13-201, Transcript of homeobox C13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC13, Length 2,423 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13-201ENST00000243056 CYB5R4Q7L1T6 521 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 LARGE2Q8N3Y3 721 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 ANTXR2P58335 489 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 ACCSLQ4AC99 568 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 MICALCLQ6ZW33 695 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 PODNQ7Z5L7 613 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 SENP2Q9HC62 589 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 CDC27P30260 824 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 TTMPQ5BVD1 217 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 ARMC3Q5W041 872 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 RASGRP2Q7LDG7 609 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 FUKQ8N0W3 1084 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 ACRBPQ8NEB7 543 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 NACAP1Q9BZK3 213 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 POLD4Q9HCU8 107 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 GOLGA8KD6RF30 607 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 MYO1BO43795 1136 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 PNOCQ13519 176 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 SLURP2P0DP57 97 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 MCM3P25205 808 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 RAB27AP51159 221 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 CACNB3P54284 484 aa22.1■■□□□ 1.13
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HOXC13-201ENST00000243056 ARL8AQ96BM9 186 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 PANX2Q96RD6 677 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 MYH2Q9UKX2 1941 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 GNAT2P19087 354 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 RASSF7Q02833 373 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 PPARAQ07869 468 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 PSMD2Q13200 908 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 DACT2Q5SW24 774 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 MMS19Q96T76 1030 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 MCM9Q9NXL9 1143 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 IFT88Q13099 833 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 ALX1Q15699 326 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 RTKN2Q8IZC4 609 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 SLC39A2Q9NP94 309 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.13
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HOXC13-201ENST00000243056 SPTLC2O15270 562 aa22.09■■□□□ 1.13
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HOXC13-201ENST00000243056 SPRED3Q2MJR0 410 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 TBC1D25Q3MII6 688 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
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HOXC13-201ENST00000243056 HAUS2Q9NVX0 235 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 LAMA4Q16363 1823 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa22.09■■□□□ 1.13
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HOXC13-201ENST00000243056 ZEB2O60315 1214 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 ATP1A2P50993 1020 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 PICALMQ13492 652 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 OR8K1Q8NGG5 319 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 DYNLL2Q96FJ2 89 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 CCDC114Q96M63 670 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa22.08■■□□□ 1.12
HOXC13-201ENST00000243056 USP17L3A6NCW0 530 aa22.08■■□□□ 1.12
HOXC13-201ENST00000243056 USP17L4A6NCW7 530 aa22.08■■□□□ 1.12
HOXC13-201ENST00000243056 OPLAHO14841 1288 aa22.08■■□□□ 1.12
HOXC13-201ENST00000243056 PRELPP51888 382 aa22.08■■□□□ 1.12
HOXC13-201ENST00000243056 SLC5A9Q2M3M2 681 aa22.08■■□□□ 1.12
HOXC13-201ENST00000243056 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa22.08■■□□□ 1.12
HOXC13-201ENST00000243056 USP17L1Q7RTZ2 530 aa22.08■■□□□ 1.12
HOXC13-201ENST00000243056 NCOA7Q8NI08 942 aa22.08■■□□□ 1.12
HOXC13-201ENST00000243056 KCNG4Q8TDN1 519 aa22.08■■□□□ 1.12
HOXC13-201ENST00000243056 SPON1Q9HCB6 807 aa22.08■■□□□ 1.12
HOXC13-201ENST00000243056 ZSWIM5Q9P217 1185 aa22.08■■□□□ 1.12
HOXC13-201ENST00000243056 KIF13BQ9NQT8 1826 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXC13-201ENST00000243056 BMP6P22004 513 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXC13-201ENST00000243056 RHBDL3P58872 404 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXC13-201ENST00000243056 CCT2P78371 535 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
HOXC13-201ENST00000243056 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
HOXC13-201ENST00000243056 CCDC50Q8IVM0 306 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXC13-201ENST00000243056 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
HOXC13-201ENST00000243056 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
HOXC13-201ENST00000243056 HDAC6Q9UBN7 1215 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXC13-201ENST00000243056 CD2APQ9Y5K6 639 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXC13-201ENST00000243056 DLEC1Q9Y238 1755 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXC13-201ENST00000243056 ZNF18P17022 549 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXC13-201ENST00000243056 RXRAP19793 462 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXC13-201ENST00000243056 GSTO1P78417 241 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXC13-201ENST00000243056 AKNAD1Q5T1N1 836 aa22.07■■□□□ 1.12
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