RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 RTN1Q16799 776 aa25.84■■□□□ 1.73
SYF2-201ENST00000236273 MAF1Q9H063 256 aa25.84■■□□□ 1.73
SYF2-201ENST00000236273 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
SYF2-201ENST00000236273 NRBP1Q9UHY1 535 aa25.84■■□□□ 1.73
SYF2-201ENST00000236273 NID2Q14112 1375 aa25.83■■□□□ 1.73
SYF2-201ENST00000236273 GOLGA8AA7E2F4 631 aa25.83■■□□□ 1.73
SYF2-201ENST00000236273 GOLGA8BA8MQT2 603 aa25.83■■□□□ 1.73
SYF2-201ENST00000236273 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
SYF2-201ENST00000236273 ARMCX2Q7L311 632 aa25.83■■□□□ 1.73
SYF2-201ENST00000236273 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa25.83■■□□□ 1.73
SYF2-201ENST00000236273 MORC4Q8TE76 937 aa25.83■■□□□ 1.73
SYF2-201ENST00000236273 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
SYF2-201ENST00000236273 COL20A1Q9P218 1284 aa25.83■■□□□ 1.73
SYF2-201ENST00000236273 OGDHLQ9ULD0 1010 aa25.83■■□□□ 1.73
SYF2-201ENST00000236273 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa25.82■■□□□ 1.72
SYF2-201ENST00000236273 CALML3P27482 149 aa25.82■■□□□ 1.72
SYF2-201ENST00000236273 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
SYF2-201ENST00000236273 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
SYF2-201ENST00000236273 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
SYF2-201ENST00000236273 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
SYF2-201ENST00000236273 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
SYF2-201ENST00000236273 PDRG1Q9NUG6 133 aa25.82■■□□□ 1.72
SYF2-201ENST00000236273 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
SYF2-201ENST00000236273 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa25.82■■□□□ 1.72
SYF2-201ENST00000236273 SEPT4O43236 478 aa25.81■■□□□ 1.72
SYF2-201ENST00000236273 HSD17B4P51659 736 aa25.81■■□□□ 1.72
SYF2-201ENST00000236273 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
SYF2-201ENST00000236273 TFRCP02786 760 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
SYF2-201ENST00000236273 CNGA1P29973 690 aa25.8■■□□□ 1.72
SYF2-201ENST00000236273 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP25.8■■□□□ 1.72
SYF2-201ENST00000236273 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
SYF2-201ENST00000236273 PPP2R5BQ15173 497 aa25.8■■□□□ 1.72
SYF2-201ENST00000236273 MCF2L2Q86YR7 1114 aa25.8■■□□□ 1.72
SYF2-201ENST00000236273 FRMPD3Q5JV73 1810 aa25.79■■□□□ 1.72
SYF2-201ENST00000236273 ASB14A6NK59 587 aa25.79■■□□□ 1.72
SYF2-201ENST00000236273 ACVR2BQ13705 512 aa25.79■■□□□ 1.72
SYF2-201ENST00000236273 NTRK3Q16288 839 aa25.79■■□□□ 1.72
SYF2-201ENST00000236273 TAAR1Q96RJ0 339 aa25.79■■□□□ 1.72
SYF2-201ENST00000236273 KIF2CQ99661 725 aa25.79■■□□□ 1.72
SYF2-201ENST00000236273 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa25.79■■□□□ 1.72
SYF2-201ENST00000236273 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
SYF2-201ENST00000236273 EDNRBP24530 442 aa25.78■■□□□ 1.72
SYF2-201ENST00000236273 ANO1Q5XXA6 986 aa25.78■■□□□ 1.72
SYF2-201ENST00000236273 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
SYF2-201ENST00000236273 CNPY2Q9Y2B0 182 aa25.78■■□□□ 1.72
SYF2-201ENST00000236273 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa25.77■■□□□ 1.72
SYF2-201ENST00000236273 ADCY6O43306 1168 aa25.77■■□□□ 1.72
SYF2-201ENST00000236273 CFBP00751 764 aa25.77■■□□□ 1.72
SYF2-201ENST00000236273 CAPN2P17655 700 aa25.77■■□□□ 1.72
SYF2-201ENST00000236273 TRAF1Q13077 416 aa25.77■■□□□ 1.72
SYF2-201ENST00000236273 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
SYF2-201ENST00000236273 DNERQ8NFT8 737 aa25.77■■□□□ 1.72
SYF2-201ENST00000236273 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
SYF2-201ENST00000236273 V9GY48 417 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
SYF2-201ENST00000236273 LRRC37A2A6NM11 1700 aa25.76■■□□□ 1.71
SYF2-201ENST00000236273 MSCO60682 206 aa25.76■■□□□ 1.71
SYF2-201ENST00000236273 CCT2P78371 535 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
SYF2-201ENST00000236273 TAPT1Q6NXT6 567 aa25.76■■□□□ 1.71
SYF2-201ENST00000236273 SAMD3Q8N6K7 520 aa25.76■■□□□ 1.71
SYF2-201ENST00000236273 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
SYF2-201ENST00000236273 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
SYF2-201ENST00000236273 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
SYF2-201ENST00000236273 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
SYF2-201ENST00000236273 TYW1BQ6NUM6 668 aa25.75■■□□□ 1.71
SYF2-201ENST00000236273 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
SYF2-201ENST00000236273 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
SYF2-201ENST00000236273 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa25.74■■□□□ 1.71
SYF2-201ENST00000236273 AK2P54819 239 aa25.74■■□□□ 1.71
SYF2-201ENST00000236273 CCDC144BQ3MJ40 725 aa25.74■■□□□ 1.71
SYF2-201ENST00000236273 ANKLE1Q8NAG6 615 aa25.74■■□□□ 1.71
SYF2-201ENST00000236273 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
SYF2-201ENST00000236273 PDGFCQ9NRA1 345 aa25.74■■□□□ 1.71
SYF2-201ENST00000236273 TPCN1Q9ULQ1 816 aa25.74■■□□□ 1.71
SYF2-201ENST00000236273 MEIS2O14770 477 aa25.73■■□□□ 1.71
SYF2-201ENST00000236273 AKR1A1P14550 325 aa25.73■■□□□ 1.71
SYF2-201ENST00000236273 RBM25P49756 843 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
SYF2-201ENST00000236273 PKN1Q16512 942 aa25.73■■□□□ 1.71
SYF2-201ENST00000236273 TMEM63BQ5T3F8 832 aa25.73■■□□□ 1.71
SYF2-201ENST00000236273 WWC2Q6AWC2 1192 aa25.73■■□□□ 1.71
SYF2-201ENST00000236273 EEPD1Q7L9B9 569 aa25.73■■□□□ 1.71
SYF2-201ENST00000236273 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP25.73■■□□□ 1.71
SYF2-201ENST00000236273 C22orf23Q9BZE7 217 aa25.73■■□□□ 1.71
SYF2-201ENST00000236273 FAM184BQ9ULE4 1060 aa25.73■■□□□ 1.71
SYF2-201ENST00000236273 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
SYF2-201ENST00000236273 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
SYF2-201ENST00000236273 POLR2MP0CAP2 368 aa25.72■■□□□ 1.71
SYF2-201ENST00000236273 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
SYF2-201ENST00000236273 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
SYF2-201ENST00000236273 RMDN3Q96TC7 470 aa25.72■■□□□ 1.71
SYF2-201ENST00000236273 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
SYF2-201ENST00000236273 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
SYF2-201ENST00000236273 IFNAR1P17181 557 aa25.71■■□□□ 1.71
SYF2-201ENST00000236273 NEK4P51957 841 aa25.71■■□□□ 1.71
SYF2-201ENST00000236273 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
SYF2-201ENST00000236273 PHKBQ93100 1093 aa25.71■■□□□ 1.71
SYF2-201ENST00000236273 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
SYF2-201ENST00000236273 VTA1Q9NP79 307 aa25.71■■□□□ 1.71
SYF2-201ENST00000236273 PXMP2Q9NR77 195 aa25.71■■□□□ 1.71
SYF2-201ENST00000236273 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.71
SYF2-201ENST00000236273 PIK3CDO00329 1044 aa25.7■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.9 ms