RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225308.12

SLC25A39-201, Transcript of solute carrier family 25 member 39, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC25A39, Length 1,607 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A39-201ENST00000225308 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
SLC25A39-201ENST00000225308 SOWAHBA6NEL2 793 aa25.12■■□□□ 1.61
SLC25A39-201ENST00000225308 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
SLC25A39-201ENST00000225308 MTFR1Q15390 333 aa25.12■■□□□ 1.61
SLC25A39-201ENST00000225308 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
SLC25A39-201ENST00000225308 MCF2L2Q86YR7 1114 aa25.12■■□□□ 1.61
SLC25A39-201ENST00000225308 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP25.12■■□□□ 1.61
SLC25A39-201ENST00000225308 TINF2Q9BSI4 451 aa25.12■■□□□ 1.61
SLC25A39-201ENST00000225308 MAF1Q9H063 256 aa25.12■■□□□ 1.61
SLC25A39-201ENST00000225308 MYCP01106 439 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
SLC25A39-201ENST00000225308 CALML3P27482 149 aa25.12■■□□□ 1.61
SLC25A39-201ENST00000225308 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
SLC25A39-201ENST00000225308 WWC2Q6AWC2 1192 aa25.12■■□□□ 1.61
SLC25A39-201ENST00000225308 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
SLC25A39-201ENST00000225308 CPLX1O14810 134 aa25.11■■□□□ 1.61
SLC25A39-201ENST00000225308 CFBP00751 764 aa25.11■■□□□ 1.61
SLC25A39-201ENST00000225308 HSD17B4P51659 736 aa25.11■■□□□ 1.61
SLC25A39-201ENST00000225308 UBXN2AP68543 259 aa25.11■■□□□ 1.61
SLC25A39-201ENST00000225308 MFSD14CQ5VZR4 134 aa25.11■■□□□ 1.61
SLC25A39-201ENST00000225308 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa25.11■■□□□ 1.61
SLC25A39-201ENST00000225308 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa25.11■■□□□ 1.61
SLC25A39-201ENST00000225308 COL20A1Q9P218 1284 aa25.11■■□□□ 1.61
SLC25A39-201ENST00000225308 LRRC37A2A6NM11 1700 aa25.11■■□□□ 1.61
SLC25A39-201ENST00000225308 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
SLC25A39-201ENST00000225308 PKN1Q16512 942 aa25.1■■□□□ 1.61
SLC25A39-201ENST00000225308 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
SLC25A39-201ENST00000225308 TYW1BQ6NUM6 668 aa25.1■■□□□ 1.61
SLC25A39-201ENST00000225308 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
SLC25A39-201ENST00000225308 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
SLC25A39-201ENST00000225308 GTF3C6Q969F1 213 aa25.1■■□□□ 1.61
SLC25A39-201ENST00000225308 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa25.1■■□□□ 1.61
SLC25A39-201ENST00000225308 NECAB1Q8N987 351 aa25.09■■□□□ 1.61
SLC25A39-201ENST00000225308 SLC26A6Q9BXS9 759 aa25.09■■□□□ 1.61
SLC25A39-201ENST00000225308 UNC93B1Q9H1C4 597 aa25.09■■□□□ 1.61
SLC25A39-201ENST00000225308 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
SLC25A39-201ENST00000225308 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa25.09■■□□□ 1.61
SLC25A39-201ENST00000225308 SCG2P13521 617 aa25.08■■□□□ 1.61
SLC25A39-201ENST00000225308 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
SLC25A39-201ENST00000225308 RPTORQ8N122 1335 aa25.08■■□□□ 1.61
SLC25A39-201ENST00000225308 hCG_1984214I3L0E3 225 aa25.08■■□□□ 1.6
SLC25A39-201ENST00000225308 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.6
SLC25A39-201ENST00000225308 CYBAP13498 195 aa25.08■■□□□ 1.6
SLC25A39-201ENST00000225308 CCL5P13501 91 aa25.08■■□□□ 1.6
SLC25A39-201ENST00000225308 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.6
SLC25A39-201ENST00000225308 ST3GAL1Q11201 340 aa25.08■■□□□ 1.6
SLC25A39-201ENST00000225308 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.6
SLC25A39-201ENST00000225308 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.6
SLC25A39-201ENST00000225308 BARHL2Q9NY43 387 aa25.08■■□□□ 1.6
SLC25A39-201ENST00000225308 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.6
SLC25A39-201ENST00000225308 STXBP3O00186 592 aa25.07■■□□□ 1.6
SLC25A39-201ENST00000225308 ST18O60284 1047 aa25.07■■□□□ 1.6
SLC25A39-201ENST00000225308 CTDNEP1O95476 244 aa25.07■■□□□ 1.6
SLC25A39-201ENST00000225308 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
SLC25A39-201ENST00000225308 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
SLC25A39-201ENST00000225308 ARMCX2Q7L311 632 aa25.07■■□□□ 1.6
SLC25A39-201ENST00000225308 SAMD3Q8N6K7 520 aa25.07■■□□□ 1.6
SLC25A39-201ENST00000225308 TRPV1Q8NER1 839 aa25.07■■□□□ 1.6
SLC25A39-201ENST00000225308 IL27Q8NEV9 243 aa25.07■■□□□ 1.6
SLC25A39-201ENST00000225308 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
SLC25A39-201ENST00000225308 FRMPD3Q5JV73 1810 aa25.07■■□□□ 1.6
SLC25A39-201ENST00000225308 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
SLC25A39-201ENST00000225308 TRIM22Q8IYM9 498 aa25.06■■□□□ 1.6
SLC25A39-201ENST00000225308 DNERQ8NFT8 737 aa25.06■■□□□ 1.6
SLC25A39-201ENST00000225308 RNF208Q9H0X6 261 aa25.06■■□□□ 1.6
SLC25A39-201ENST00000225308 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
SLC25A39-201ENST00000225308 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
SLC25A39-201ENST00000225308 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
SLC25A39-201ENST00000225308 MEIS2O14770 477 aa25.05■■□□□ 1.6
SLC25A39-201ENST00000225308 DTNBO60941 627 aa25.05■■□□□ 1.6
SLC25A39-201ENST00000225308 POLR2MP0CAP2 368 aa25.05■■□□□ 1.6
SLC25A39-201ENST00000225308 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
SLC25A39-201ENST00000225308 NAPAP54920 295 aa25.05■■□□□ 1.6
SLC25A39-201ENST00000225308 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
SLC25A39-201ENST00000225308 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa25.05■■□□□ 1.6
SLC25A39-201ENST00000225308 PPP1R18Q6NYC8 613 aa25.05■■□□□ 1.6
SLC25A39-201ENST00000225308 TAAR1Q96RJ0 339 aa25.05■■□□□ 1.6
SLC25A39-201ENST00000225308 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP25.05■■□□□ 1.64e-7■■■■■ 39.7
SLC25A39-201ENST00000225308 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
SLC25A39-201ENST00000225308 ASB14A6NK59 587 aa25.04■■□□□ 1.6
SLC25A39-201ENST00000225308 CCDC85CA6NKD9 419 aa25.04■■□□□ 1.6
SLC25A39-201ENST00000225308 CDKL5O76039 1030 aa25.04■■□□□ 1.6
SLC25A39-201ENST00000225308 USP17L6PQ6QN14 398 aa25.04■■□□□ 1.6
SLC25A39-201ENST00000225308 MORC4Q8TE76 937 aa25.04■■□□□ 1.6
SLC25A39-201ENST00000225308 PSTPIP2Q9H939 334 aa25.04■■□□□ 1.6
SLC25A39-201ENST00000225308 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa25.04■■□□□ 1.6
SLC25A39-201ENST00000225308 PIK3CDO00329 1044 aa25.04■■□□□ 1.6
SLC25A39-201ENST00000225308 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
SLC25A39-201ENST00000225308 SHISA4Q96DD7 197 aa25.04■■□□□ 1.6
SLC25A39-201ENST00000225308 RMDN3Q96TC7 470 aa25.04■■□□□ 1.6
SLC25A39-201ENST00000225308 KATNBL1Q9H079 304 aa25.04■■□□□ 1.6
SLC25A39-201ENST00000225308 NRBP1Q9UHY1 535 aa25.04■■□□□ 1.6
SLC25A39-201ENST00000225308 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa25.03■■□□□ 1.6
SLC25A39-201ENST00000225308 DEXIO95424 95 aa25.03■■□□□ 1.6
SLC25A39-201ENST00000225308 EDNRBP24530 442 aa25.03■■□□□ 1.6
SLC25A39-201ENST00000225308 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
SLC25A39-201ENST00000225308 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
SLC25A39-201ENST00000225308 CNPY2Q9Y2B0 182 aa25.03■■□□□ 1.6
SLC25A39-201ENST00000225308 STK36Q9NRP7 1315 aa25.03■■□□□ 1.6
SLC25A39-201ENST00000225308 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
SLC25A39-201ENST00000225308 FCHSD1Q86WN1 690 aa25.02■■□□□ 1.6
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