RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000165559.1

Ctif-201, Transcript of CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Ctif, Length 6,173 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctif-201ENSMUST00000165559 Hspa2P17156 633 aa13.14□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Gm5168Q4KL04 211 aa13.14□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Kcnv2Q8CFS6 562 aa13.14□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Dnajc25A2ALW5 357 aa13.14□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Rsbn1lD3Z0K6 821 aa13.14□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 ByslO54825 436 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Dhx37Q6NZL1 1150 aa13.14□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Rbm34Q8C5L7 375 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Pfkfb1P70266 471 aa13.14□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Eepd1Q3TGW2 569 aa13.14□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Ifit1Q64282 463 aa13.14□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Actn2Q9JI91 894 aa13.14□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Dclk1Q9JLM8 756 aa13.14□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Gm4297D3YWB7 211 aa13.14□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Eps15P42567 897 aa13.14□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Dynll1P63168 89 aa13.14□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Zbtb8osQ505B7 168 aa13.14□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 HarsQ61035 509 aa13.14□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Atp1a3Q6PIC6 1013 aa13.14□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Krit1Q6S5J6 736 aa13.14□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Nod1Q8BHB0 953 aa13.14□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Rassf2Q8BMS9 326 aa13.14□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 GlyctkQ8QZY2 523 aa13.14□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 MyocdQ8VIM5 935 aa13.14□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Bzw2Q91VK1 419 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Plcb1Q9Z1B3 1216 aa13.14□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Idh1O88844 414 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 SelpQ01102 768 aa13.14□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 RragaQ80X95 313 aa13.14□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 VmacQ8BP01 174 aa13.14□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 PpatQ8CIH9 517 aa13.14□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Atp2a1Q8R429 994 aa13.14□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Adcy3Q8VHH7 1145 aa13.14□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Tsta3P23591 321 aa13.13□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Frat1P70339 274 aa13.13□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Cxcl11Q9JHH5 100 aa13.13□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Tcp10bE9PYJ0 438 aa13.13□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Tcp10cE9Q046 482 aa13.13□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Aimp1P31230 310 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Lig1P37913 916 aa13.13□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Ttc7aQ8BGB2 858 aa13.13□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Ccdc28aQ8CEI3 192 aa13.13□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Rbm41Q8JZV4 413 aa13.13□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Trmt112Q9DCG9 125 aa13.13□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Nfat5Q9WV30 1534 aa13.13□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Pdzrn4E9PUZ9 1014 aa13.13□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Diaph1O08808 1255 aa13.13□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Kctd1Q5M956 257 aa13.13□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Kctd6Q8BNL5 237 aa13.13□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Strn3Q9ERG2 796 aa13.13□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Lipo1J3QME6 396 aa13.13□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Tsga10Q6NY15 697 aa13.13□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Cacna2d2Q6PHS9 1154 aa13.13□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Ttll1Q91V51 423 aa13.13□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Sept6Q9R1T4 434 aa13.13□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Zfyve9A2A8R0 1397 aa13.13□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Npy5rO70342 466 aa13.13□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Ccdc57Q6PHN1 1016 aa13.13□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Ppil4Q9CXG3 492 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Taf4E9QAP7 1042 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Islr2Q5RKR3 745 aa13.12□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Ccdc157Q5SPX1 718 aa13.12□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Krt14Q61781 484 aa13.12□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Atp1a2Q6PIE5 1020 aa13.12□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Armcx3Q8BHS6 379 aa13.12□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Arfgap2Q99K28 520 aa13.12□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Aldh1a1P24549 501 aa13.12□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Fkbp1aP26883 108 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Cacnb3P54285 484 aa13.12□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Stim2P83093 746 aa13.12□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Gm5169Q5M8P2 212 aa13.12□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Tor1aip2Q8BYU6 502 aa13.12□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Rapgef5Q8C0Q9 814 aa13.12□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Ankrd49Q8VE42 238 aa13.12□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Serpinb12Q9D7P9 423 aa13.12□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Popdc2Q9ES82 367 aa13.12□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Tbc1d4Q8BYJ6 1307 aa13.12□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Zc3h13E9Q784 1729 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Sh2d4bA6X942 431 aa13.12□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Ugt1a5B2RT14 529 aa13.12□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 CaluO35887 315 aa13.12□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Serpinb2P12388 415 aa13.12□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Celf1P28659 486 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Sh2d1b2Q45HK4 132 aa13.12□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 DbnlQ62418 436 aa13.12□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Q8BZJ8 459 aa13.12□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Rad51ap2G3UW63 976 aa13.12□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Syne3Q4FZC9 975 aa13.12□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Me3Q8BMF3 604 aa13.12□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Tubgcp2Q921G8 905 aa13.12□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Map7d1A2AJI0 846 aa13.11□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Btnl4A2CG29 586 aa13.11□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 C2cd5Q7TPS5 1016 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Ankfy1Q810B6 1169 aa13.11□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 IrgqQ8VIM9 583 aa13.11□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Cdca7lQ922M5 438 aa13.11□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Zfyve19Q9DAZ9 389 aa13.11□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Ddx24Q9ESV0 857 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Dnajb6O54946 365 aa13.11□□□□□ -0.31
Ctif-201ENSMUST00000165559 Trim21Q62191 470 aa13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 21.7 ms