RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000077257.11

Rxra-201, Transcript of Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rxra, Length 4,905 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rxra-201ENSMUST00000077257 Ccdc170D3YXL0 722 aa20.2■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 Aimp1P31230 310 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 Leo1Q5XJE5 667 aa20.2■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 Olfr390Q8VEZ7 311 aa20.2■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 Slain1Q68FF7 579 aa20.2■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 Iqcb1Q8BP00 598 aa20.2■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 Serpinb2P12388 415 aa20.2■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 MarsQ68FL6 902 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 Tex2Q6ZPJ0 1128 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 Cmtm5Q9D6G9 156 aa20.19■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 Cdkn1cP49919 348 aa20.19■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 Anapc5Q8BTZ4 740 aa20.19■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 Nol6Q8R5K4 1152 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 Tnni1Q9WUZ5 187 aa20.19■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 Pdzrn4E9PUZ9 1014 aa20.19■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 Tagap1P0CAX8 505 aa20.19■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 Adcy7P51829 1099 aa20.19■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 Fgfr1opQ66JX5 399 aa20.19■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 RimklbQ80WS1 387 aa20.19■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 Ccar2Q8VDP4 922 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 Kcnq5Q9JK45 933 aa20.19■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 Nr2e3Q9QXZ7 395 aa20.19■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 Btnl4A2CG29 586 aa20.19■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 Casp14O89094 257 aa20.19■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 Tor4aQ8BH02 426 aa20.19■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 Rab3il1Q8VDV3 383 aa20.19■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 Ces1fQ91WU0 561 aa20.19■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 Utp18Q5SSI6 552 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 Rab34Q64008 259 aa20.18■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 Peg10Q7TN75 958 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 Rasgrp4Q8BTM9 673 aa20.18■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 Psmd2Q8VDM4 908 aa20.18■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 1700129C05RikQ9CQ77 218 aa20.18■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 Tbc1d22bQ80VE5 505 aa20.18■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 Csrnp2Q8BGQ2 534 aa20.18■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 Rassf9Q8K342 435 aa20.18■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 Gga1Q8R0H9 635 aa20.18■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 ChkbO55229 394 aa20.18■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 Stxbp5Q8K400 1152 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 NptxrQ99J85 493 aa20.18■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 Adam7O35227 789 aa20.17■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 Meis1Q60954 390 aa20.17■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 Ipo4Q8VI75 1082 aa20.17■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 1700003F12RikA2AKE5 210 aa20.17■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 Vmn2r78K7N6U5 853 aa20.17■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 Trappc3lQ4KL14 181 aa20.17■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 Jade3Q6IE82 823 aa20.17■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 AsphQ8BSY0 741 aa20.17■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 HlcsQ920N2 722 aa20.17■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 Atp12aQ9Z1W8 1035 aa20.17■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 Krt24A1L317 512 aa20.17■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 Snd1Q78PY7 910 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 Ska2Q9CR46 120 aa20.17■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 Gm6657A0A1B0GRJ3 277 aa20.16■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 Tbc1d19Q8VDV7 526 aa20.16■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 Pcdhb12Q91Y07 789 aa20.16■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 Mageb3Q9D2H4 330 aa20.16■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 Chaf1aQ9QWF0 911 aa20.16■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 Lig4Q8BTF7 911 aa20.16■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 Tbc1d4Q8BYJ6 1307 aa20.16■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 Cyp11b2P15539 500 aa20.16■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 Rpf1Q7TND5 349 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 Lmbrd1Q8K0B2 537 aa20.16■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 Pex3Q9QXY9 372 aa20.16■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 CfhP06909 1234 aa20.16■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 D630036H23RikQ3UQD6 204 aa20.16■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 Ccdc42Q5SV66 316 aa20.16■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 Caps2Q8BUG5 550 aa20.16■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 Slc44a4Q91VA1 707 aa20.16■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 Krt34Q9D646 392 aa20.16■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 Usp42B2RQC2 1324 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 Gm3893E9Q1I1 302 aa20.15■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 Myo19Q5SV80 963 aa20.15■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 Ppp6r3Q922D4 844 aa20.15■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 Nsmce1Q9D720 266 aa20.15■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 Ugt1a5B2RT14 529 aa20.15■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 Hmgcs2P54869 508 aa20.15■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 Acot5Q6Q2Z6 421 aa20.15■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 Jakmip2D3YXK0 820 aa20.15■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 Gm10110D3Z5M2 615 aa20.15■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 Pik3caP42337 1068 aa20.15■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 Sdccag8Q80UF4 717 aa20.15■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 EmsyQ8BMB0 1264 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 Zbtb9Q8CDC7 459 aa20.15■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 Trim32Q8CH72 655 aa20.15■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 Atp1a4Q9WV27 1032 aa20.15■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 Wnt10bP48614 389 aa20.15■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 Ctr9Q62018 1173 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 Pde5aQ8CG03 865 aa20.15■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 Pard3bQ9CSB4 1203 aa20.15■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 Nsun2Q1HFZ0 757 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 Dennd1bQ3U1T9 766 aa20.14■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 Vta1Q9CR26 309 aa20.14■□□□□ 0.82
Rxra-201ENSMUST00000077257 Prex1Q69ZK0 1650 aa20.14■□□□□ 0.81
Rxra-201ENSMUST00000077257 Gdap1O88741 358 aa20.14■□□□□ 0.81
Rxra-201ENSMUST00000077257 Cd86P42082 309 aa20.14■□□□□ 0.81
Rxra-201ENSMUST00000077257 Zfp957Q3UT76 567 aa20.14■□□□□ 0.81
Rxra-201ENSMUST00000077257 SpopQ6ZWS8 374 aa20.14■□□□□ 0.81
Rxra-201ENSMUST00000077257 Otop3Q80UF9 577 aa20.14■□□□□ 0.81
Rxra-201ENSMUST00000077257 Hps6Q8BLY7 805 aa20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 13.7 ms