RNA–Protein interactions for RNA: YOL033W

MSE1, Transcript of Mitochondrial glutamyl-tRNA synthetase, yeast

Gene MSE1, Length 1,611 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MSE1	YOL033W	DAL7	P21826	554 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	AMD2	P22580	549 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	TCA17	P32613	152 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	SPC29	P33419	253 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	RCN1	P36054	211 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	SRP102	P36057	244 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	MRX1	P40050	688 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	RGI2	P40188	164 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	VHR1	P40522	640 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	NAS6	P50086	228 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	HFM1	P51979	1187 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	YGL204C	P53089	101 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	TYW3	P53177	273 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	YGR125W	P53273	1036 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	ZRG17	P53735	605 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	PRM1	P53835	661 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	YAP6	Q03935	383 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	YLR173W	Q06247	608 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	MHR1	Q06630	226 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	SGT1	Q08446	395 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	VAM3	Q12241	283 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	HER1	Q12276	1246 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	IQG1	Q12280	1495 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	AUS1	Q08409	1394 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	CDC9	P04819	755 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	SPT3	P06844	337 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	MTF2	P10849	440 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	IME1	P21190	360 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	RIT1	P23796	513 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	KIP1	P28742	1111 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	ERG3	P32353	365 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	ECM31	P38122	312 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	CDS1	P38221	457 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	HXT13	P39924	564 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	GID8	P40208	455 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	UBP7	P40453	1071 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	IDS2	P46958	469 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	YJR154W	P47181	346 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	AMA1	P50082	593 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	VOA1	P53262	265 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	HXT17	P53631	564 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	HXT15	P54854	567 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	CWC27	Q02770	301 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	YDC1	Q02896	317 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	NHP10	Q03435	203 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	SNX41	Q04053	625 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	PEX12	Q04370	399 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	STE23	Q06010	1027 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	YLR001C	Q07895	862 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	YAP7	Q08182	245 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	SMC5	Q08204	1093 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSE1	YOL033W	SIN3	P22579	1536 aa		4.59	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	HSL1	P34244	1518 aa		4.59	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	TAF2	P23255	1407 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	CYC7	P00045	113 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	ATP6	P00854	259 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	MATALPHA1	P0CY06	175 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	HMLALPHA1	P0CY07	175 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	CKA1	P15790	372 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	HOP1	P20050	605 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	AAT2	P23542	418 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	CPR4	P25334	318 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	CIN8	P27895	1000 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	ATP7	P30902	174 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	DID4	P36108	232 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	YKR073C	P36153	106 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	HEK2	P38199	381 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.58	□□□□□ -1.68	not detected
MSE1	YOL033W	POA1	P38218	177 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	YER085C	P40058	173 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	RPL4B	P49626	362 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	DIA1	P54005	336 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	ROD1	Q02805	837 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	YDR239C	Q03780	787 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	ATC1	Q04005	294 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	YLR456W	Q06199	204 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	YLR413W	Q06689	675 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	HUA2	Q12134	243 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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