RNA–Protein interactions for RNA: YKL209C

STE6, Transcript of Plasma membrane ATP-binding cassette (ABC) transporter, yeast

Gene STE6, Length 3,873 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
STE6	YKL209C	RPB10	P22139	70 aa		3.09	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	AIM26	P32858	118 aa		3.09	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	FTH1	P38310	465 aa		3.09	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	TCD1	P38756	429 aa		3.09	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	MET30	P39014	640 aa		3.09	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	FMP52	P40008	231 aa		3.09	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	ELO3	P40319	345 aa		3.09	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	MND2	P40577	368 aa		3.09	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	FAR3	P46671	204 aa		3.09	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	SNG1	P46950	547 aa		3.09	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	LYS5	P50113	272 aa		3.09	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	ZIP2	P53061	704 aa		3.09	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	YGR053C	P53234	283 aa		3.09	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	KRE28	Q04431	385 aa		3.09	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	WTM2	Q12206	467 aa		3.09	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	SCL1	P21243	252 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	AGP1	P25376	633 aa		3.09	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	FUN30	P31380	1131 aa		3.09	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	BET3	P36149	193 aa		3.09	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	DBP8	P38719	431 aa		3.09	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	YHR127W	P38833	243 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	NDE1	P40215	560 aa		3.09	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	NEO1	P40527	1151 aa		3.09	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	GTS1	P40956	396 aa		3.09	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	AZF1	P41696	914 aa		3.09	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	HDA3	Q06623	655 aa		3.09	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	UBX3	Q12229	455 aa		3.09	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	COX17	Q12287	69 aa		3.09	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	YFR010W-A	P0C5N0	62 aa		3.08	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	PHO13	P19881	312 aa		3.08	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	KAR4	P25583	335 aa		3.08	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	RPC19	P28000	142 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	PHO11	P35842	467 aa		3.08	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	PHO12	P38693	467 aa		3.08	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	PHB1	P40961	287 aa		3.08	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.08	□□□□□ -1.92	not detected
STE6	YKL209C	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	ECL1	P48235	211 aa		3.08	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	MET14	Q02196	202 aa		3.08	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	BDS1	Q08347	646 aa		3.08	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	MCM16	Q12262	181 aa		3.08	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	SEC14	P24280	304 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	SPS22	P25380	463 aa		3.08	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	SEO1	P39709	593 aa		3.08	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	APS3	P47064	194 aa		3.08	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	UBX4	P54730	416 aa		3.08	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	YPL062W	Q02781	134 aa		3.08	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	TRM12	Q04235	462 aa		3.08	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	SYT1	Q06836	1226 aa		3.08	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	SGT1	Q08446	395 aa		3.08	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	ACM1	Q08981	209 aa		3.08	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	KAR1	P11927	433 aa		3.08	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	CBS2	P14905	389 aa		3.08	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	RAD57	P25301	460 aa		3.08	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	YCR015C	P25616	317 aa		3.08	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	GCG1	P32656	232 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	SFA1	P32771	386 aa		3.08	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	MRE11	P32829	692 aa		3.08	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	OMA1	P36163	345 aa		3.08	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	HAT2	P39984	401 aa		3.08	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	APQ12	P40532	138 aa		3.08	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	YIR014W	P40570	242 aa		3.08	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	MDM34	P53083	459 aa		3.08	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	NNF2	P53253	936 aa		3.08	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	IBD2	P53892	351 aa		3.08	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	ADE12	P80210	433 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	YPL109C	Q02981	657 aa		3.08	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	TAF11	Q04226	346 aa		3.08	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	OMS1	Q06668	471 aa		3.08	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	FMP45	Q07651	309 aa		3.08	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	MMT2	Q08970	484 aa		3.08	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	YDL177C	Q12257	170 aa		3.08	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	NSI1	Q12457	570 aa		3.08	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		3.08	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	STE12	P13574	688 aa		3.07	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	BUB3	P26449	341 aa		3.07	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	KAP122	P32767	1081 aa		3.07	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	SSO1	P32867	290 aa		3.07	□□□□□ -1.92

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