RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639525.1

SPIN3-223, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5 BASIC

Gene SPIN3, Length 3,958 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-223	ENST00000639525	POTEM	A6NI47	508 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	ABL1	P00519	1130 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	GPATCH11	Q8N954	259 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	P2RX5	Q93086	422 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	TMEM260	Q9NX78	707 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	13.08	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	WNT7A	O00755	349 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	CYP4A11	Q02928	519 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	EHHADH	Q08426	723 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	UBE2S	Q16763	222 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	CEP104	O60308	925 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	TBC1D8	O95759	1140 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	EIF4A3	P38919	411 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	VPS36	Q86VN1	386 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	PNKP	Q96T60	521 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	NDUFAB1	O14561	156 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	FTCD	O95954	541 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	KLHL30	Q0D2K2	578 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	DPYD	Q12882	1025 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	SAMM50	Q9Y512	469 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	PCDHB13	Q9Y5F0	798 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	DUSP10	Q9Y6W6	482 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	TRIM66	O15016	1216 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	NCK2	O43639	380 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	TBCA	O75347	108 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	SASH3	O75995	380 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	CDR1	P51861	262 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	NAA35	Q5VZE5	725 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	13.06	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	CCT5	P48643	541 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	ADCY7	P51828	1080 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	NUP58	Q9BVL2	599 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	ESYT3	A0FGR9	886 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	PPP1R3G	B7ZBB8	358 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	RDX	P35241	583 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	13.06	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	TROAP	Q12815	778 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	13.06	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	KCTD1	Q719H9	257 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	NOX5	Q96PH1	765 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	MMS19	Q96T76	1030 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	ERLIN2	O94905	339 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	HLA-DOA	P06340	250 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	ACTN2	P35609	894 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	LIG3	P49916	1009 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	SNAP25	P60880	206 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	ERVK-24	P63145	666 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	TMC4	Q7Z404	712 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	BCAS4	Q8TDM0	211 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	MEIS1	O00470	390 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	HGS	O14964	777 aa	Predicted RBP	13.05	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	13.05	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	GUCY2D	Q02846	1103 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	DOK7	Q18PE1	504 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	CERS3	Q8IU89	383 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	SLF2	Q8IX21	1173 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	UBLCP1	Q8WVY7	318 aa	Predicted RBP	13.05	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	STK4	Q13043	487 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	KCTD19	Q17RG1	926 aa	Predicted RBP	13.05	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	KIAA1024	Q9UPX6	916 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	PIK3C2A	O00443	1686 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	XDH	P47989	1333 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	FAM196B	A6NMK8	535 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	OPA1	O60313	960 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	ABCB4	P21439	1286 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	GNGT1	P63211	74 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	13.05	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	CTNNBL1	Q8WYA6	563 aa	Predicted RBP	13.05	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	PACSIN2	Q9UNF0	486 aa	Predicted RBP	13.05	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	KRT13	P13646	458 aa		13.04	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	13.04	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	ITPK1	Q13572	414 aa		13.04	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	13.04	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	13.04	□□□□□ -0.32
SPIN3-223	ENST00000639525	RRP15	Q9Y3B9	282 aa	Known RBP	13.04	□□□□□ -0.32

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