RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619252.4

CU633967.1-201, humanhuman

TSL 2

Gene CU633967.1, Length 549 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CU633967.1-201ENST00000619252 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 SEMA6BQ9H3T3 888 aa11.7□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 CTNNA3Q9UI47 895 aa11.7□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 TBX21Q9UL17 535 aa11.7□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 CDH23Q9H251 3354 aa11.7□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 ASB14A6NK59 587 aa11.69□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 TMEM232C9JQI7 657 aa11.69□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 TLR3O15455 904 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 PLA2G6O60733 806 aa11.69□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 FOSL2P15408 326 aa11.69□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 ITGB8P26012 769 aa11.69□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 SLC1A4P43007 532 aa11.69□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 FAAP100Q0VG06 881 aa11.69□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 CCDC144BQ3MJ40 725 aa11.69□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 AKNAD1Q5T1N1 836 aa11.69□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 CASC1Q6TDU7 716 aa11.69□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 FGD4Q96M96 766 aa11.69□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 DSCC1Q9BVC3 393 aa11.69□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 HOMER2Q9NSB8 354 aa11.69□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 RNF146Q9NTX7 359 aa11.69□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 ANAPC4Q9UJX5 808 aa11.69□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 GBF1Q92538 1859 aa11.68□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 MYADML2A6NDP7 307 aa11.68□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 NMT2O60551 498 aa11.68□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 TIMP1P01033 207 aa11.68□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 ASGR1P07306 291 aa11.68□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 TBC1D10CQ8IV04 446 aa11.68□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa11.68□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 FAM133AQ8N9E0 248 aa11.68□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 STAG1Q8WVM7 1258 aa11.68□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 ESR2Q92731 530 aa11.68□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 VTI1AQ96AJ9 217 aa11.68□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa11.68□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 PPP4R2Q9NY27 417 aa11.68□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP11.68□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 NCOR1O75376 2440 aa11.68□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 EYSQ5T1H1 3165 aa11.67□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 NEDD4P46934 1319 aa11.67□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 ARVCFO00192 962 aa11.67□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 ORC4O43929 436 aa11.67□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 CABYRO75952 493 aa11.67□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 DNAJB2P25686 324 aa11.67□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 EPHB4P54760 987 aa11.67□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 NKX3-2P78367 333 aa11.67□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 CCDC96Q2M329 555 aa11.67□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 GNASQ5JWF2 1037 aa11.67□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 MFSD5Q6N075 450 aa11.67□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 TLK2Q86UE8 772 aa11.67□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 TMEM199Q8N511 208 aa11.67□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 MYLIPQ8WY64 445 aa11.67□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa11.67□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 KATNBL1Q9H079 304 aa11.67□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 IL25Q9H293 177 aa11.67□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa11.67□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 B4E1Z4 1266 aa11.66□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 ADCY6O43306 1168 aa11.66□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 ZEB2O60315 1214 aa11.66□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 PCP11498 1178 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 ALAS1P13196 640 aa11.66□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 CDK7P50613 346 aa11.66□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 CNTN2Q02246 1040 aa11.66□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 TNFAIP2Q03169 654 aa11.66□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 PTH1RQ03431 593 aa11.66□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 TRDNQ13061 729 aa11.66□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 BMP2KLQ5H9B9 411 aa11.66□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 IQCA1Q86XH1 822 aa11.66□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 FAM126BQ8IXS8 530 aa11.66□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 DCAF4Q8WV16 495 aa11.66□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 TRERF1Q96PN7 1200 aa11.66□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 AP5M1Q9H0R1 490 aa11.66□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 MYH6P13533 1939 aa11.66□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 TANC1Q9C0D5 1861 aa11.66□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 ZNF536O15090 1300 aa11.65□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa11.65□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 SGSM2O43147 1006 aa11.65□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 KDM4AO75164 1064 aa11.65□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 CDC45O75419 566 aa11.65□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 MCCP23508 829 aa11.65□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 RCSD1Q6JBY9 416 aa11.65□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 KCTD1Q719H9 257 aa11.65□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 TIFAQ96CG3 184 aa11.65□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 AGBL1Q96MI9 1066 aa11.65□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP11.65□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 UBAC1Q9BSL1 405 aa11.65□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 KRT23Q9C075 422 aa11.65□□□□□ -0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 CNNM2Q9H8M5 875 aa11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.3 ms