RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615579.1

TTC28-AS1_3.1-201, humanhuman

BASIC

Gene TTC28-AS1_3, Length 181 nt, Biotype misc RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MUM1L1Q5H9M0 696 aa16.78■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 C17orf99Q6UX52 265 aa16.78■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TRERF1Q96PN7 1200 aa16.78■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ALG1Q9BT22 464 aa16.78■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GJB4Q9NTQ9 266 aa16.78■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MORF4L1Q9UBU8 362 aa16.78■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ABCB11O95342 1321 aa16.77■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 STXBP3O00186 592 aa16.77■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NFIBO00712 420 aa16.77■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FDPSP14324 419 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CCNA1P78396 465 aa16.77■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NSMFQ6X4W1 530 aa16.77■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RIOX2Q8IUF8 465 aa16.77■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa16.77■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 WBP1LQ9NX94 342 aa16.77■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SAGE1Q9NXZ1 904 aa16.77■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TYW1BQ6NUM6 668 aa16.76■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CD99L2Q8TCZ2 262 aa16.76■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 WASF1Q92558 559 aa16.76■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa16.76■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ACAD9Q9H845 621 aa16.76■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GPR25O00155 361 aa16.75■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SLC25A27O95847 323 aa16.75■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CFBP00751 764 aa16.75■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SP3Q02447 781 aa16.75■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TRIM29Q14134 588 aa16.75■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SLC30A10Q6XR72 485 aa16.75■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MMP19Q99542 508 aa16.75■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 BARHL2Q9NY43 387 aa16.75■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 KCNJ14Q9UNX9 436 aa16.75■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa16.75■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LCTP09848 1927 aa16.74■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa16.74■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ATP2A1O14983 1001 aa16.74■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FOXN1O15353 648 aa16.74■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NLRP5P59047 1200 aa16.74■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 KIF22Q14807 665 aa16.74■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 UBE2SQ16763 222 aa16.74■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ANKRD35Q8N283 1001 aa16.74■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SHISA4Q96DD7 197 aa16.74■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FKTNO75072 461 aa16.73■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 XBP1P17861 261 aa16.73■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CALML3P27482 149 aa16.73■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MAPK4P31152 587 aa16.73■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 COPB2P35606 906 aa16.73■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PSMC4P43686 418 aa16.73■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ADCY7P51828 1080 aa16.73■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TRAF1Q13077 416 aa16.73■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TKFCQ3LXA3 575 aa16.73■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PPP1R18Q6NYC8 613 aa16.73■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GPR142Q7Z601 462 aa16.73■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 JMYQ8N9B5 988 aa16.73■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CCDC148Q8NFR7 591 aa16.73■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CLEC4DQ8WXI8 215 aa16.73■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TBC1D5Q92609 795 aa16.73■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 C8orf76Q96K31 380 aa16.73■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CFHR5Q9BXR6 569 aa16.73■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MROH8Q9H579 483 aa16.73■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PNMA2Q9UL42 364 aa16.73■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 KIF3AQ9Y496 699 aa16.73■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SMCO2A6NFE2 343 aa16.72■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 hCG_1984214I3L0E3 225 aa16.72■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PGK2P07205 417 aa16.72■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CTGFP29279 349 aa16.72■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FCGRTP55899 365 aa16.72■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 KCTD2Q14681 263 aa16.72■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PLEKHH3Q7Z736 793 aa16.72■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SHCBP1Q8NEM2 672 aa16.72■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CHST13Q8NET6 341 aa16.72■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PGBD1Q96JS3 809 aa16.72■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FBXO40Q9UH90 709 aa16.72■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa16.71■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZNF236Q9UL36 1845 aa16.71■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 H3BQV1 296 aa16.71■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 OPLAHO14841 1288 aa16.71■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FCER1AP12319 257 aa16.71■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 IFFO2Q5TF58 517 aa16.71■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 USP17L6PQ6QN14 398 aa16.71■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RNF207Q6ZRF8 634 aa16.71■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FCHSD1Q86WN1 690 aa16.71■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RASGRP4Q8TDF6 673 aa16.71■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CUL5Q93034 780 aa16.71■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms