RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 FAM26FQ5R3K3 315 aa22.18■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 ATG3Q9NT62 314 aa22.18■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 MASTLQ96GX5 879 aa22.18■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 PLEKHF1Q96S99 279 aa22.18■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 PIK3CAP42336 1068 aa22.18■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 AOC3Q16853 763 aa22.18■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 LONRF2Q1L5Z9 754 aa22.18■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 SLC7A3Q8WY07 619 aa22.18■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 ERO1AQ96HE7 468 aa22.18■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 CIB2O75838 187 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 TSPOAP1O95153 1857 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 PTGDRQ13258 359 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 ADAM9Q13443 819 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 ODR4Q5SWX8 454 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 CCDC51Q96ER9 411 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 USP28Q96RU2 1077 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 PI4KBQ9UBF8 816 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 MMP10P09238 476 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 STAT2P52630 851 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 PCDHA4Q9UN74 947 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 KIAA1024Q9UPX6 916 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 SLC39A2Q9NP94 309 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 KIAA1468Q9P260 1216 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 FAM170AA1A519 330 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 SARNPP82979 210 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 M0R2C6 588 aa22.16■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 PPM1KQ8N3J5 372 aa22.16■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 LAD1O00515 517 aa22.16■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 RPN1P04843 607 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.16■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 ADD2P35612 726 aa22.16■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 ZWINTO95229 277 aa22.16■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 CMA1P23946 247 aa22.16■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 HHATQ5VTY9 493 aa22.16■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 CDHR1Q96JP9 859 aa22.16■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 ITKQ08881 620 aa22.16■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 CUL4BQ13620 913 aa22.16■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 EXOC8Q8IYI6 725 aa22.16■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 HAUS1Q96CS2 278 aa22.15■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 CFAP57Q96MR6 1250 aa22.15■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 MAGEF1Q9HAY2 307 aa22.15■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 SLC16A2P36021 539 aa22.15■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 TRIML1Q8N9V2 468 aa22.15■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 SLC10A4Q96EP9 437 aa22.15■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 COA1Q9GZY4 146 aa22.15■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 VPS37BQ9H9H4 285 aa22.15■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 PARP2Q9UGN5 583 aa22.15■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.15■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 hCG_1984214I3L0E3 225 aa22.15■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 TBC1D8O95759 1140 aa22.15■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 PAK2Q13177 524 aa22.15■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 SYDE2Q5VT97 1194 aa22.15■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 PIM2Q9P1W9 311 aa22.15■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 BRD1O95696 1058 aa22.14■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 MAN1A1P33908 653 aa22.14■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 WDR11Q9BZH6 1224 aa22.14■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.14■■□□□ 1.14
CTDP1-208ENST00000613122 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 Q3C1V9 767 aa22.14■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 SPDYE2Q495Y8 402 aa22.14■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 CCDC160A6NGH7 325 aa22.14■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 KRBA2Q6ZNG9 492 aa22.14■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 MIGA2Q7L4E1 593 aa22.14■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 OR8K1Q8NGG5 319 aa22.14■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 ERVK-7P63135 1459 aa22.14■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 KRT15P19012 456 aa22.14■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 BRINP3Q76B58 766 aa22.13■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 RUFY4Q6ZNE9 571 aa22.13■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 GJA10Q969M2 543 aa22.13■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa22.13■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 CARD6Q9BX69 1037 aa22.13■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 RAB17Q9H0T7 212 aa22.13■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa22.13■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 I3L4J1 428 aa22.13■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 METTL23Q86XA0 190 aa22.13■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 LCORLQ8N3X6 602 aa22.13■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 TRAPPC10P48553 1259 aa22.12■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 ATP2A3Q93084 1043 aa22.12■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 CLIC6Q96NY7 704 aa22.12■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 SCRN1Q12765 414 aa22.12■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 MTMR3Q13615 1198 aa22.12■■□□□ 1.13
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