RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600964.1

AP2S1-208, Transcript of adaptor related protein complex 2 subunit sigma 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene AP2S1, Length 458 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1-208ENST00000600964 SLC43A3Q8NBI5 491 aa21.59■■□□□ 1.05
AP2S1-208ENST00000600964 DCAF4Q8WV16 495 aa21.59■■□□□ 1.05
AP2S1-208ENST00000600964 GLT1D1Q96MS3 346 aa21.59■■□□□ 1.05
AP2S1-208ENST00000600964 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
AP2S1-208ENST00000600964 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
AP2S1-208ENST00000600964 LAMA4Q16363 1823 aa21.59■■□□□ 1.05
AP2S1-208ENST00000600964 ASB14A6NK59 587 aa21.58■■□□□ 1.05
AP2S1-208ENST00000600964 ARVCFO00192 962 aa21.58■■□□□ 1.05
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AP2S1-208ENST00000600964 TAPT1Q6NXT6 567 aa21.58■■□□□ 1.05
AP2S1-208ENST00000600964 CCDC174Q6PII3 467 aa21.58■■□□□ 1.05
AP2S1-208ENST00000600964 C16orf59Q7L2K0 433 aa21.58■■□□□ 1.05
AP2S1-208ENST00000600964 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
AP2S1-208ENST00000600964 TMEM47Q9BQJ4 181 aa21.58■■□□□ 1.05
AP2S1-208ENST00000600964 SPC25Q9HBM1 224 aa21.58■■□□□ 1.05
AP2S1-208ENST00000600964 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
AP2S1-208ENST00000600964 CDH23Q9H251 3354 aa21.58■■□□□ 1.04
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AP2S1-208ENST00000600964 ICAM1P05362 532 aa21.57■■□□□ 1.04
AP2S1-208ENST00000600964 IKQ13123 557 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
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AP2S1-208ENST00000600964 FAM126BQ8IXS8 530 aa21.57■■□□□ 1.04
AP2S1-208ENST00000600964 SMC5Q8IY18 1101 aa21.57■■□□□ 1.04
AP2S1-208ENST00000600964 GBF1Q92538 1859 aa21.57■■□□□ 1.04
AP2S1-208ENST00000600964 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
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AP2S1-208ENST00000600964 TMEM63BQ5T3F8 832 aa21.56■■□□□ 1.04
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AP2S1-208ENST00000600964 PDGFCQ9NRA1 345 aa21.56■■□□□ 1.04
AP2S1-208ENST00000600964 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
AP2S1-208ENST00000600964 GRIN2DO15399 1336 aa21.55■■□□□ 1.04
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AP2S1-208ENST00000600964 PTGS1P23219 599 aa21.55■■□□□ 1.04
AP2S1-208ENST00000600964 SLC16A2P36021 539 aa21.55■■□□□ 1.04
AP2S1-208ENST00000600964 RASIP1Q5U651 963 aa21.55■■□□□ 1.04
AP2S1-208ENST00000600964 IQSEC1Q6DN90 963 aa21.55■■□□□ 1.04
AP2S1-208ENST00000600964 TTC14Q96N46 770 aa21.55■■□□□ 1.04
AP2S1-208ENST00000600964 CCPG1Q9ULG6 757 aa21.55■■□□□ 1.04
AP2S1-208ENST00000600964 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
AP2S1-208ENST00000600964 Q9Y3F1 56 aa21.55■■□□□ 1.04
AP2S1-208ENST00000600964 TMEM265A0A087WTH1 108 aa21.54■■□□□ 1.04
AP2S1-208ENST00000600964 SNHG28P0DPA3 235 aa21.54■■□□□ 1.04
AP2S1-208ENST00000600964 AAMPQ13685 434 aa21.54■■□□□ 1.04
AP2S1-208ENST00000600964 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP21.54■■□□□ 1.04
AP2S1-208ENST00000600964 LNPKQ9C0E8 428 aa21.54■■□□□ 1.04
AP2S1-208ENST00000600964 CHD9Q3L8U1 2897 aa21.54■■□□□ 1.04
AP2S1-208ENST00000600964 PDHBP11177 359 aa21.53■■□□□ 1.04
AP2S1-208ENST00000600964 TMEM240Q5SV17 173 aa21.53■■□□□ 1.04
AP2S1-208ENST00000600964 SYDE2Q5VT97 1194 aa21.53■■□□□ 1.04
AP2S1-208ENST00000600964 TLK2Q86UE8 772 aa21.53■■□□□ 1.04
AP2S1-208ENST00000600964 CLEC4DQ8WXI8 215 aa21.53■■□□□ 1.04
AP2S1-208ENST00000600964 VTI1AQ96AJ9 217 aa21.53■■□□□ 1.04
AP2S1-208ENST00000600964 OSBPL3Q9H4L5 887 aa21.53■■□□□ 1.04
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AP2S1-208ENST00000600964 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa21.53■■□□□ 1.04
AP2S1-208ENST00000600964 CCDC171Q6TFL3 1326 aa21.53■■□□□ 1.04
AP2S1-208ENST00000600964 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa21.52■■□□□ 1.04
AP2S1-208ENST00000600964 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
AP2S1-208ENST00000600964 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
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AP2S1-208ENST00000600964 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
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AP2S1-208ENST00000600964 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
AP2S1-208ENST00000600964 CCDC96Q2M329 555 aa21.52■■□□□ 1.04
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AP2S1-208ENST00000600964 AKNAD1Q5T1N1 836 aa21.52■■□□□ 1.04
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AP2S1-208ENST00000600964 NSMFQ6X4W1 530 aa21.52■■□□□ 1.04
AP2S1-208ENST00000600964 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa21.52■■□□□ 1.04
AP2S1-208ENST00000600964 VTA1Q9NP79 307 aa21.52■■□□□ 1.04
AP2S1-208ENST00000600964 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa21.52■■□□□ 1.04
AP2S1-208ENST00000600964 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
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AP2S1-208ENST00000600964 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
AP2S1-208ENST00000600964 CABYRO75952 493 aa21.51■■□□□ 1.03
AP2S1-208ENST00000600964 IGHDP01880 384 aa21.51■■□□□ 1.03
AP2S1-208ENST00000600964 CSF2RAP15509 400 aa21.51■■□□□ 1.03
AP2S1-208ENST00000600964 SDSP20132 328 aa21.51■■□□□ 1.03
AP2S1-208ENST00000600964 HAND2P61296 217 aa21.51■■□□□ 1.03
AP2S1-208ENST00000600964 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP21.51■■□□□ 1.03
AP2S1-208ENST00000600964 TBC1D10CQ8IV04 446 aa21.51■■□□□ 1.03
AP2S1-208ENST00000600964 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP21.51■■□□□ 1.03
AP2S1-208ENST00000600964 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
AP2S1-208ENST00000600964 MYLIPQ8WY64 445 aa21.51■■□□□ 1.03
AP2S1-208ENST00000600964 GPCPD1Q9NPB8 672 aa21.51■■□□□ 1.03
AP2S1-208ENST00000600964 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
AP2S1-208ENST00000600964 ZNF543Q08ER8 600 aa21.5■■□□□ 1.03
AP2S1-208ENST00000600964 ITGA7Q13683 1181 aa21.5■■□□□ 1.03
AP2S1-208ENST00000600964 EEPD1Q7L9B9 569 aa21.5■■□□□ 1.03
AP2S1-208ENST00000600964 TOMM22Q9NS69 142 aa21.5■■□□□ 1.03
AP2S1-208ENST00000600964 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
AP2S1-208ENST00000600964 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa21.49■■□□□ 1.03
AP2S1-208ENST00000600964 TLR3O15455 904 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
AP2S1-208ENST00000600964 DNAJB2P25686 324 aa21.49■■□□□ 1.03
AP2S1-208ENST00000600964 NUCB1Q02818 461 aa21.49■■□□□ 1.03
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