RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596548.1

C3-208, Transcript of complement C3, human

TSL 3

Gene C3, Length 576 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
C3-208	ENST00000596548	DDX56	Q9NY93	547 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	KLHL14	Q9P2G3	628 aa		4.9	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	SRRD	Q9UH36	339 aa		4.9	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	CORIN	Q9Y5Q5	1042 aa		4.9	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		4.9	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	GRIN3B	O60391	1043 aa		4.89	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	CTSH	P09668	335 aa		4.89	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	CAP1	Q01518	475 aa		4.89	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	GALNT18	Q6P9A2	607 aa		4.89	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		4.89	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		4.89	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	PMM1	Q92871	262 aa		4.89	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	CCDC74B	Q96LY2	380 aa		4.89	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	HDAC8	Q9BY41	377 aa		4.89	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	GEMIN8	Q9NWZ8	242 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	TMEM82	A0PJX8	343 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	NUDT19	A8MXV4	375 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	FKTN	O75072	461 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	BPNT1	O95861	308 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	NCKAP1L	P55160	1127 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	LAPTM5	Q13571	262 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	ZNF655	Q8N720	491 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	TCTN2	Q96GX1	697 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	PCDHGB7	Q9Y5F8	929 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	HMGB1P1	B2RPK0	211 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	S100B	P04271	92 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	PFKL	P17858	780 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	TFE3	P19532	575 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	LIMS1	P48059	325 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	AMPD3	Q01432	767 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	HSF5	Q4G112	596 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	HS2ST1	Q7LGA3	356 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	FERMT3	Q86UX7	667 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	FCRL2	Q96LA5	508 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	TNFRSF10D	Q9UBN6	386 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	KLHL3	Q9UH77	587 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	OVOL3	O00110	214 aa		4.86	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	MATN3	O15232	486 aa		4.86	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	FSHB	P01225	129 aa		4.86	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	SYP	P08247	313 aa		4.86	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	PRKCA	P17252	672 aa		4.86	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	ADAM17	P78536	824 aa		4.86	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	CYP4F8	P98187	520 aa		4.86	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		4.86	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		4.86	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	ZPBP2	Q6X784	338 aa		4.86	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		4.86	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	LSR	Q86X29	649 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	PHACTR4	Q8IZ21	702 aa		4.86	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	SLC16A11	Q8NCK7	471 aa		4.86	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		4.86	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	SEC16B	Q96JE7	1060 aa		4.86	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	SMPD4	Q9NXE4	827 aa		4.86	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		4.86	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	GGT7	Q9UJ14	662 aa		4.86	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	G3BP2	Q9UN86	482 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	GPR55	Q9Y2T6	319 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	USP31	Q70CQ4	1352 aa		4.86	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	FADS2P1	A8MWK0	482 aa		4.85	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	PDGFRB	P09619	1106 aa		4.85	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	RLBP1	P12271	317 aa		4.85	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	GBP1	P32455	592 aa		4.85	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	RNF4	P78317	190 aa		4.85	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	PAK2	Q13177	524 aa		4.85	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	KIR3DS1	Q14943	382 aa		4.85	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	RALBP1	Q15311	655 aa		4.85	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	BBS9	Q3SYG4	887 aa		4.85	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	ZC3H14	Q6PJT7	736 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	RPTN	Q6XPR3	784 aa		4.85	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		4.85	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	GPRASP2	Q96D09	838 aa		4.85	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		4.85	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	TNFRSF12A	Q9NP84	129 aa		4.85	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	REV1	Q9UBZ9	1251 aa		4.85	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	SUSD2	Q9UGT4	822 aa		4.85	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		4.84	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	CHURC1-FNTB	B4DL54	471 aa		4.84	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	CREB3	O43889	395 aa		4.84	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	ENDOU	P21128	410 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	TARBP2	Q15633	366 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	PLEKHN1	Q494U1	663 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	ARSH	Q5FYA8	562 aa		4.84	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	LIPI	Q6XZB0	460 aa		4.84	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
C3-208	ENST00000596548	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63

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