RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586813.5

TRAF4-216, Transcript of TNF receptor associated factor 4, humanhuman

TSL 3

Gene TRAF4, Length 789 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4-216ENST00000586813 ALX1Q15699 326 aa22.88■■□□□ 1.25
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TRAF4-216ENST00000586813 MUM1L1Q5H9M0 696 aa22.88■■□□□ 1.25
TRAF4-216ENST00000586813 FAM126BQ8IXS8 530 aa22.88■■□□□ 1.25
TRAF4-216ENST00000586813 DCAF4Q8WV16 495 aa22.88■■□□□ 1.25
TRAF4-216ENST00000586813 CYP39A1Q9NYL5 469 aa22.88■■□□□ 1.25
TRAF4-216ENST00000586813 CCPG1Q9ULG6 757 aa22.88■■□□□ 1.25
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TRAF4-216ENST00000586813 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
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TRAF4-216ENST00000586813 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
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TRAF4-216ENST00000586813 AP5M1Q9H0R1 490 aa22.84■■□□□ 1.25
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TRAF4-216ENST00000586813 VTA1Q9NP79 307 aa22.82■■□□□ 1.24
TRAF4-216ENST00000586813 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa22.82■■□□□ 1.24
TRAF4-216ENST00000586813 CCDC171Q6TFL3 1326 aa22.82■■□□□ 1.24
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TRAF4-216ENST00000586813 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
TRAF4-216ENST00000586813 GRIN2CQ14957 1233 aa22.79■■□□□ 1.24
TRAF4-216ENST00000586813 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa22.79■■□□□ 1.24
TRAF4-216ENST00000586813 TIFAQ96CG3 184 aa22.79■■□□□ 1.24
TRAF4-216ENST00000586813 HIPK3Q9H422 1215 aa22.79■■□□□ 1.24
TRAF4-216ENST00000586813 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa22.78■■□□□ 1.24
TRAF4-216ENST00000586813 PCP11498 1178 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
TRAF4-216ENST00000586813 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
TRAF4-216ENST00000586813 AKNAD1Q5T1N1 836 aa22.78■■□□□ 1.24
TRAF4-216ENST00000586813 SLC30A10Q6XR72 485 aa22.78■■□□□ 1.24
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