RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 ABCC2Q92887 1545 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 CARMIL3Q8ND23 1372 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 GUCY2DQ02846 1103 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 DLGAP5Q15398 846 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 HADHQ16836 314 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 H2AFZP0C0S5 128 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 POLR2MP0CAP2 368 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 H2AFVQ71UI9 128 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 NACA2Q9H009 215 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 STK32BQ9NY57 414 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 ARHGAP42A6NI28 874 aa23.36■■□□□ 1.33
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PTPRM-211ENST00000580170 UNC5CLQ8IV45 518 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 FAM178BQ8IXR5 827 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 SLC35F6Q8N357 371 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 PFDN1O60925 122 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 XKR9Q5GH70 373 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 ATF2P15336 505 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 YARSP54577 528 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 RBL2Q08999 1139 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 SLC39A14Q15043 492 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 GLG1Q92896 1179 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 PLEKHF1Q96S99 279 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
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PTPRM-211ENST00000580170 RASIP1Q5U651 963 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 PLEKHG3A1L390 1219 aa23.35■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 FAM26FQ5R3K3 315 aa23.35■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 CDC23Q9UJX2 597 aa23.35■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa23.35■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 M0R2C6 588 aa23.35■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 SORBS3O60504 671 aa23.35■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 SMIM24O75264 130 aa23.35■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 EHHADHQ08426 723 aa23.35■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa23.35■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 RABGGTAQ92696 567 aa23.35■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 BCAP29Q9UHQ4 241 aa23.35■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa23.35■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 LMTK3Q96Q04 1460 aa23.35■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 ENC1O14682 589 aa23.35■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 CLTAP09496 248 aa23.35■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 CCT5P48643 541 aa23.35■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
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PTPRM-211ENST00000580170 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 GCC2Q8IWJ2 1684 aa23.35■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 BTDP43251 543 aa23.34■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 TEKT3Q9BXF9 490 aa23.34■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF408Q9H9D4 720 aa23.34■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 ALDH1B1P30837 517 aa23.34■■□□□ 1.33
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PTPRM-211ENST00000580170 UBE3CQ15386 1083 aa23.34■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 FBXO11Q86XK2 927 aa23.34■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 PPM1KQ8N3J5 372 aa23.34■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 NAA35Q5VZE5 725 aa23.34■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 EFCAB13Q8IY85 973 aa23.34■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 IRX4P78413 519 aa23.34■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa23.34■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 METTL13Q8N6R0 699 aa23.34■■□□□ 1.33
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PTPRM-211ENST00000580170 DPCR1Q3MIW9 517 aa23.33■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 TRIM50Q86XT4 487 aa23.33■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 HAUS2Q9NVX0 235 aa23.33■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 APBA1Q02410 837 aa23.33■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 EXOC3L4Q17RC7 722 aa23.33■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 GNPTABQ3T906 1256 aa23.33■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 ARMCX5Q6P1M9 558 aa23.33■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 GSDMAQ96QA5 445 aa23.33■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 MAGEF1Q9HAY2 307 aa23.33■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 RPSAP08865 295 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
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PTPRM-211ENST00000580170 VCX3AQ9NNX9 186 aa23.33■■□□□ 1.33
PTPRM-211ENST00000580170 TRIM37O94972 964 aa23.33■■□□□ 1.32
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PTPRM-211ENST00000580170 ALAS1P13196 640 aa23.33■■□□□ 1.32
PTPRM-211ENST00000580170 KCTD16Q68DU8 428 aa23.33■■□□□ 1.32
PTPRM-211ENST00000580170 NXNQ6DKJ4 435 aa23.32■■□□□ 1.32
PTPRM-211ENST00000580170 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
PTPRM-211ENST00000580170 EEF2KMTQ96G04 330 aa23.32■■□□□ 1.32
PTPRM-211ENST00000580170 POLR3EQ9NVU0 708 aa23.32■■□□□ 1.32
PTPRM-211ENST00000580170 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
PTPRM-211ENST00000580170 PASKQ96RG2 1323 aa23.32■■□□□ 1.32
PTPRM-211ENST00000580170 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.32■■□□□ 1.32
PTPRM-211ENST00000580170 M0QZ92 97 aa23.32■■□□□ 1.32
PTPRM-211ENST00000580170 KAZNQ674X7 775 aa23.32■■□□□ 1.32
PTPRM-211ENST00000580170 MED10Q9BTT4 135 aa23.32■■□□□ 1.32
PTPRM-211ENST00000580170 KDM5DQ9BY66 1539 aa23.32■■□□□ 1.32
PTPRM-211ENST00000580170 STMN1P16949 149 aa23.32■■□□□ 1.32
PTPRM-211ENST00000580170 PHKA1P46020 1223 aa23.32■■□□□ 1.32
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