RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569223.1

EHD4-202, Transcript of EH domain containing 4, humanhuman

TSL 2

Gene EHD4, Length 2,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4-202ENST00000569223 SHMT1P34896 483 aa26.08■■□□□ 1.77
EHD4-202ENST00000569223 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa26.08■■□□□ 1.77
EHD4-202ENST00000569223 RAD9BQ6WBX8 426 aa26.08■■□□□ 1.77
EHD4-202ENST00000569223 CNGA4Q8IV77 575 aa26.08■■□□□ 1.77
EHD4-202ENST00000569223 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
EHD4-202ENST00000569223 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
EHD4-202ENST00000569223 COA7Q96BR5 231 aa26.08■■□□□ 1.77
EHD4-202ENST00000569223 CCDC51Q96ER9 411 aa26.08■■□□□ 1.77
EHD4-202ENST00000569223 GPCPD1Q9NPB8 672 aa26.08■■□□□ 1.77
EHD4-202ENST00000569223 ALDH1B1P30837 517 aa26.07■■□□□ 1.76
EHD4-202ENST00000569223 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP26.07■■□□□ 1.76
EHD4-202ENST00000569223 ADCY7P51828 1080 aa26.07■■□□□ 1.76
EHD4-202ENST00000569223 POTEDQ86YR6 584 aa26.07■■□□□ 1.76
EHD4-202ENST00000569223 IRF2BP1Q8IU81 584 aa26.07■■□□□ 1.76
EHD4-202ENST00000569223 PARP3Q9Y6F1 533 aa26.07■■□□□ 1.76
EHD4-202ENST00000569223 TECP42680 631 aa26.07■■□□□ 1.76
EHD4-202ENST00000569223 HHIPL2Q6UWX4 724 aa26.07■■□□□ 1.76
EHD4-202ENST00000569223 MYH4Q9Y623 1939 aa26.06■■□□□ 1.76
EHD4-202ENST00000569223 TPM1P09493 284 aa26.06■■□□□ 1.76
EHD4-202ENST00000569223 CCDC175P0C221 793 aa26.06■■□□□ 1.76
EHD4-202ENST00000569223 FECHP22830 423 aa26.06■■□□□ 1.76
EHD4-202ENST00000569223 PMS1P54277 932 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
EHD4-202ENST00000569223 GNG11P61952 73 aa26.06■■□□□ 1.76
EHD4-202ENST00000569223 STIM1Q13586 685 aa26.06■■□□□ 1.76
EHD4-202ENST00000569223 WDR24Q96S15 920 aa26.06■■□□□ 1.76
EHD4-202ENST00000569223 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
EHD4-202ENST00000569223 URI1O94763 535 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
EHD4-202ENST00000569223 ZNF543Q08ER8 600 aa26.05■■□□□ 1.76
EHD4-202ENST00000569223 TEKT1Q969V4 418 aa26.05■■□□□ 1.76
EHD4-202ENST00000569223 AKT1S1Q96B36 256 aa26.05■■□□□ 1.76
EHD4-202ENST00000569223 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
EHD4-202ENST00000569223 ADGRG1Q9Y653 693 aa26.05■■□□□ 1.76
EHD4-202ENST00000569223 CASQ1P31415 396 aa26.05■■□□□ 1.76
EHD4-202ENST00000569223 PDE6BP35913 854 aa26.05■■□□□ 1.76
EHD4-202ENST00000569223 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
EHD4-202ENST00000569223 CREBRFQ8IUR6 639 aa26.05■■□□□ 1.76
EHD4-202ENST00000569223 C7orf25Q9BPX7 421 aa26.05■■□□□ 1.76
EHD4-202ENST00000569223 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
EHD4-202ENST00000569223 TRIM9Q9C026 710 aa26.05■■□□□ 1.76
EHD4-202ENST00000569223 PSMA7O14818 248 aa26.04■■□□□ 1.76
EHD4-202ENST00000569223 TRIM14Q14142 442 aa26.04■■□□□ 1.76
EHD4-202ENST00000569223 MTMR9Q96QG7 549 aa26.04■■□□□ 1.76
EHD4-202ENST00000569223 THAP9Q9H5L6 903 aa26.04■■□□□ 1.76
EHD4-202ENST00000569223 JMJD4Q9H9V9 463 aa26.04■■□□□ 1.76
EHD4-202ENST00000569223 G3V3G9 751 aa26.04■■□□□ 1.76
EHD4-202ENST00000569223 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa26.04■■□□□ 1.76
EHD4-202ENST00000569223 DCAF8Q5TAQ9 597 aa26.04■■□□□ 1.76
EHD4-202ENST00000569223 PPP1R18Q6NYC8 613 aa26.04■■□□□ 1.76
EHD4-202ENST00000569223 FEZ1Q99689 392 aa26.04■■□□□ 1.76
EHD4-202ENST00000569223 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa26.03■■□□□ 1.76
EHD4-202ENST00000569223 EDIL3O43854 480 aa26.03■■□□□ 1.76
EHD4-202ENST00000569223 HLA-DOAP06340 250 aa26.03■■□□□ 1.76
EHD4-202ENST00000569223 CALCRLQ16602 461 aa26.03■■□□□ 1.76
EHD4-202ENST00000569223 ADGRF4Q8IZF3 695 aa26.03■■□□□ 1.76
EHD4-202ENST00000569223 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
EHD4-202ENST00000569223 KIFC2Q96AC6 838 aa26.03■■□□□ 1.76
EHD4-202ENST00000569223 MASTLQ96GX5 879 aa26.03■■□□□ 1.76
EHD4-202ENST00000569223 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
EHD4-202ENST00000569223 TRIM47Q96LD4 638 aa26.03■■□□□ 1.76
EHD4-202ENST00000569223 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
EHD4-202ENST00000569223 TXKP42681 527 aa26.02■■□□□ 1.76
EHD4-202ENST00000569223 UBXN1Q04323 297 aa26.02■■□□□ 1.76
EHD4-202ENST00000569223 TTI2Q6NXR4 508 aa26.02■■□□□ 1.76
EHD4-202ENST00000569223 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa26.02■■□□□ 1.76
EHD4-202ENST00000569223 SIPA1L1O43166 1804 aa26.02■■□□□ 1.76
EHD4-202ENST00000569223 CBX1P83916 185 aa26.02■■□□□ 1.76
EHD4-202ENST00000569223 NFIAQ12857 509 aa26.02■■□□□ 1.76
EHD4-202ENST00000569223 TTBK2Q6IQ55 1244 aa26.02■■□□□ 1.76
EHD4-202ENST00000569223 CALML4Q96GE6 196 aa26.02■■□□□ 1.76
EHD4-202ENST00000569223 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
EHD4-202ENST00000569223 RIC8AQ9NPQ8 531 aa26.02■■□□□ 1.76
EHD4-202ENST00000569223 ABHD10Q9NUJ1 306 aa26.02■■□□□ 1.76
EHD4-202ENST00000569223 EXOC1Q9NV70 894 aa26.02■■□□□ 1.76
EHD4-202ENST00000569223 SPDYE4A6NLX3 237 aa26.01■■□□□ 1.75
EHD4-202ENST00000569223 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
EHD4-202ENST00000569223 SLC37A4O43826 429 aa26.01■■□□□ 1.75
EHD4-202ENST00000569223 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
EHD4-202ENST00000569223 MMP10P09238 476 aa26.01■■□□□ 1.75
EHD4-202ENST00000569223 CRKP46108 304 aa26.01■■□□□ 1.75
EHD4-202ENST00000569223 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP26.01■■□□□ 1.75
EHD4-202ENST00000569223 ASIC1P78348 528 aa26.01■■□□□ 1.75
EHD4-202ENST00000569223 PDE4DQ08499 809 aa26.01■■□□□ 1.75
EHD4-202ENST00000569223 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
EHD4-202ENST00000569223 LGALS16A8MUM7 142 aa26■■□□□ 1.75
EHD4-202ENST00000569223 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
EHD4-202ENST00000569223 TDP2O95551 362 aa26■■□□□ 1.75
EHD4-202ENST00000569223 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
EHD4-202ENST00000569223 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
EHD4-202ENST00000569223 EHD4Q9H223 541 aa26■■□□□ 1.75
EHD4-202ENST00000569223 AMPD3Q01432 767 aa26■■□□□ 1.75
EHD4-202ENST00000569223 GRB10Q13322 594 aa26■■□□□ 1.75
EHD4-202ENST00000569223 CCDC96Q2M329 555 aa26■■□□□ 1.75
EHD4-202ENST00000569223 TMTC1Q8IUR5 882 aa26■■□□□ 1.75
EHD4-202ENST00000569223 MNS1Q8NEH6 495 aa26■■□□□ 1.75
EHD4-202ENST00000569223 DBNDD1Q9H9R9 158 aa26■■□□□ 1.75
EHD4-202ENST00000569223 LRWD1Q9UFC0 647 aa26■■□□□ 1.75
EHD4-202ENST00000569223 ERVK-24P63145 666 aa25.99■■□□□ 1.75
EHD4-202ENST00000569223 ATP2B2Q01814 1243 aa25.99■■□□□ 1.75
EHD4-202ENST00000569223 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
EHD4-202ENST00000569223 ZFPM1Q8IX07 1006 aa25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.5 ms