RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567642.1

PPP4C-211, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 2

Gene PPP4C, Length 658 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-211ENST00000567642 LRRC37A2A6NM11 1700 aa24.63■■□□□ 1.53
PPP4C-211ENST00000567642 MOXD2PA6NHM9 499 aa24.62■■□□□ 1.53
PPP4C-211ENST00000567642 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
PPP4C-211ENST00000567642 BADQ92934 168 aa24.62■■□□□ 1.53
PPP4C-211ENST00000567642 VTI1AQ96AJ9 217 aa24.62■■□□□ 1.53
PPP4C-211ENST00000567642 TRIM43BA6NCK2 446 aa24.61■■□□□ 1.53
PPP4C-211ENST00000567642 KDM4AO75164 1064 aa24.61■■□□□ 1.53
PPP4C-211ENST00000567642 CLTBP09497 229 aa24.61■■□□□ 1.53
PPP4C-211ENST00000567642 PDE4AP27815 886 aa24.61■■□□□ 1.53
PPP4C-211ENST00000567642 ZNF543Q08ER8 600 aa24.61■■□□□ 1.53
PPP4C-211ENST00000567642 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
PPP4C-211ENST00000567642 IQCA1Q86XH1 822 aa24.61■■□□□ 1.53
PPP4C-211ENST00000567642 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
PPP4C-211ENST00000567642 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
PPP4C-211ENST00000567642 DSCC1Q9BVC3 393 aa24.61■■□□□ 1.53
PPP4C-211ENST00000567642 KATNBL1Q9H079 304 aa24.61■■□□□ 1.53
PPP4C-211ENST00000567642 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
PPP4C-211ENST00000567642 B4E1Z4 1266 aa24.6■■□□□ 1.53
PPP4C-211ENST00000567642 GJA9P57773 515 aa24.6■■□□□ 1.53
PPP4C-211ENST00000567642 TNFAIP2Q03169 654 aa24.6■■□□□ 1.53
PPP4C-211ENST00000567642 GNASQ5JWF2 1037 aa24.6■■□□□ 1.53
PPP4C-211ENST00000567642 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
PPP4C-211ENST00000567642 EEPD1Q7L9B9 569 aa24.6■■□□□ 1.53
PPP4C-211ENST00000567642 GLT1D1Q96MS3 346 aa24.6■■□□□ 1.53
PPP4C-211ENST00000567642 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
PPP4C-211ENST00000567642 CTNNA3Q9UI47 895 aa24.6■■□□□ 1.53
PPP4C-211ENST00000567642 LAMA3Q16787 3333 aa24.6■■□□□ 1.53
PPP4C-211ENST00000567642 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
PPP4C-211ENST00000567642 ASGR1P07306 291 aa24.59■■□□□ 1.53
PPP4C-211ENST00000567642 CST5P28325 142 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
PPP4C-211ENST00000567642 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
PPP4C-211ENST00000567642 CCDC178Q5BJE1 867 aa24.59■■□□□ 1.53
PPP4C-211ENST00000567642 TTC22Q5TAA0 569 aa24.59■■□□□ 1.53
PPP4C-211ENST00000567642 GPR153Q6NV75 609 aa24.59■■□□□ 1.53
PPP4C-211ENST00000567642 DGKHQ86XP1 1220 aa24.59■■□□□ 1.53
PPP4C-211ENST00000567642 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
PPP4C-211ENST00000567642 ASTN1O14525 1302 aa24.59■■□□□ 1.53
PPP4C-211ENST00000567642 PTPDC1A2A3K4 754 aa24.58■■□□□ 1.53
PPP4C-211ENST00000567642 DCDC2CA8MYV0 355 aa24.58■■□□□ 1.53
PPP4C-211ENST00000567642 NFIBO00712 420 aa24.58■■□□□ 1.53
PPP4C-211ENST00000567642 GOLGA8HP0CJ92 632 aa24.58■■□□□ 1.53
PPP4C-211ENST00000567642 Q7L0L9 218 aa24.58■■□□□ 1.53
PPP4C-211ENST00000567642 DEFB123Q8N688 67 aa24.58■■□□□ 1.53
PPP4C-211ENST00000567642 KAT14Q9H8E8 782 aa24.58■■□□□ 1.53
PPP4C-211ENST00000567642 TMEM39AQ9NV64 488 aa24.58■■□□□ 1.53
PPP4C-211ENST00000567642 SNHG28P0DPA3 235 aa24.57■■□□□ 1.52
PPP4C-211ENST00000567642 RAG1P15918 1043 aa24.57■■□□□ 1.52
PPP4C-211ENST00000567642 NT5C2P49902 561 aa24.57■■□□□ 1.52
PPP4C-211ENST00000567642 BEX3Q00994 111 aa24.57■■□□□ 1.52
PPP4C-211ENST00000567642 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
PPP4C-211ENST00000567642 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
PPP4C-211ENST00000567642 PNMA1Q8ND90 353 aa24.57■■□□□ 1.52
PPP4C-211ENST00000567642 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
PPP4C-211ENST00000567642 PNMA2Q9UL42 364 aa24.57■■□□□ 1.52
PPP4C-211ENST00000567642 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
PPP4C-211ENST00000567642 SHHQ15465 462 aa24.56■■□□□ 1.52
PPP4C-211ENST00000567642 TOX2Q96NM4 488 aa24.56■■□□□ 1.52
PPP4C-211ENST00000567642 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
PPP4C-211ENST00000567642 KRT23Q9C075 422 aa24.56■■□□□ 1.52
PPP4C-211ENST00000567642 UBA5Q9GZZ9 404 aa24.56■■□□□ 1.52
PPP4C-211ENST00000567642 AP5M1Q9H0R1 490 aa24.56■■□□□ 1.52
PPP4C-211ENST00000567642 IL25Q9H293 177 aa24.56■■□□□ 1.52
PPP4C-211ENST00000567642 PDGFCQ9NRA1 345 aa24.56■■□□□ 1.52
PPP4C-211ENST00000567642 ELP1O95163 1332 aa24.56■■□□□ 1.52
PPP4C-211ENST00000567642 ITGB8P26012 769 aa24.55■■□□□ 1.52
PPP4C-211ENST00000567642 CALML3P27482 149 aa24.55■■□□□ 1.52
PPP4C-211ENST00000567642 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
PPP4C-211ENST00000567642 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa24.55■■□□□ 1.52
PPP4C-211ENST00000567642 TLK2Q86UE8 772 aa24.55■■□□□ 1.52
PPP4C-211ENST00000567642 CPVLQ9H3G5 476 aa24.55■■□□□ 1.52
PPP4C-211ENST00000567642 ZSWIM5Q9P217 1185 aa24.55■■□□□ 1.52
PPP4C-211ENST00000567642 KIAA0355O15063 1070 aa24.54■■□□□ 1.52
PPP4C-211ENST00000567642 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
PPP4C-211ENST00000567642 SMPD1P17405 629 aa24.54■■□□□ 1.52
PPP4C-211ENST00000567642 FAAP100Q0VG06 881 aa24.54■■□□□ 1.52
PPP4C-211ENST00000567642 USH1GQ495M9 461 aa24.54■■□□□ 1.52
PPP4C-211ENST00000567642 C9orf50Q5SZB4 431 aa24.54■■□□□ 1.52
PPP4C-211ENST00000567642 IQSEC1Q6DN90 963 aa24.54■■□□□ 1.52
PPP4C-211ENST00000567642 SLC30A10Q6XR72 485 aa24.54■■□□□ 1.52
PPP4C-211ENST00000567642 RNF207Q6ZRF8 634 aa24.54■■□□□ 1.52
PPP4C-211ENST00000567642 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa24.54■■□□□ 1.52
PPP4C-211ENST00000567642 CLEC4DQ8WXI8 215 aa24.54■■□□□ 1.52
PPP4C-211ENST00000567642 CNNM2Q9H8M5 875 aa24.54■■□□□ 1.52
PPP4C-211ENST00000567642 VTA1Q9NP79 307 aa24.54■■□□□ 1.52
PPP4C-211ENST00000567642 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
PPP4C-211ENST00000567642 TNKSO95271 1327 aa24.54■■□□□ 1.52
PPP4C-211ENST00000567642 MROH7Q68CQ1 1323 aa24.54■■□□□ 1.52
PPP4C-211ENST00000567642 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
PPP4C-211ENST00000567642 CTAGE5O15320 804 aa24.53■■□□□ 1.52
PPP4C-211ENST00000567642 PTGS1P23219 599 aa24.53■■□□□ 1.52
PPP4C-211ENST00000567642 TAPT1Q6NXT6 567 aa24.53■■□□□ 1.52
PPP4C-211ENST00000567642 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
PPP4C-211ENST00000567642 RUFY2Q8WXA3 655 aa24.53■■□□□ 1.52
PPP4C-211ENST00000567642 UBAC1Q9BSL1 405 aa24.53■■□□□ 1.52
PPP4C-211ENST00000567642 WDR19Q8NEZ3 1342 aa24.53■■□□□ 1.52
PPP4C-211ENST00000567642 ARVCFO00192 962 aa24.52■■□□□ 1.52
PPP4C-211ENST00000567642 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
PPP4C-211ENST00000567642 MORC4Q8TE76 937 aa24.52■■□□□ 1.52
PPP4C-211ENST00000567642 ANKS1AQ92625 1134 aa24.52■■□□□ 1.52
PPP4C-211ENST00000567642 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
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