RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563498.1

NME3-204, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene NME3, Length 920 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-204ENST00000563498 PRDM6Q9NQX0 595 aa22.16■■□□□ 1.14
NME3-204ENST00000563498 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
NME3-204ENST00000563498 LRRC37A2A6NM11 1700 aa22.15■■□□□ 1.14
NME3-204ENST00000563498 GRXCR1A8MXD5 290 aa22.15■■□□□ 1.14
NME3-204ENST00000563498 MCCP23508 829 aa22.15■■□□□ 1.14
NME3-204ENST00000563498 IKQ13123 557 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
NME3-204ENST00000563498 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
NME3-204ENST00000563498 RCSD1Q6JBY9 416 aa22.15■■□□□ 1.14
NME3-204ENST00000563498 CXCL17Q6UXB2 119 aa22.15■■□□□ 1.14
NME3-204ENST00000563498 PI4K2BQ8TCG2 481 aa22.15■■□□□ 1.14
NME3-204ENST00000563498 HERVK_113Q902F9 699 aa22.15■■□□□ 1.14
NME3-204ENST00000563498 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
NME3-204ENST00000563498 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
NME3-204ENST00000563498 Q9Y3F1 56 aa22.15■■□□□ 1.14
NME3-204ENST00000563498 TTC28Q96AY4 2481 aa22.15■■□□□ 1.14
NME3-204ENST00000563498 ZEB2O60315 1214 aa22.14■■□□□ 1.13
NME3-204ENST00000563498 ACRP10323 421 aa22.14■■□□□ 1.13
NME3-204ENST00000563498 ALAS1P13196 640 aa22.14■■□□□ 1.13
NME3-204ENST00000563498 CYP2C18P33260 490 aa22.14■■□□□ 1.13
NME3-204ENST00000563498 ITGA7Q13683 1181 aa22.14■■□□□ 1.13
NME3-204ENST00000563498 RAB30Q15771 203 aa22.14■■□□□ 1.13
NME3-204ENST00000563498 AKNAD1Q5T1N1 836 aa22.14■■□□□ 1.13
NME3-204ENST00000563498 IQSEC1Q6DN90 963 aa22.14■■□□□ 1.13
NME3-204ENST00000563498 FSD1Q9BTV5 496 aa22.14■■□□□ 1.13
NME3-204ENST00000563498 AP5M1Q9H0R1 490 aa22.14■■□□□ 1.13
NME3-204ENST00000563498 HIPK3Q9H422 1215 aa22.14■■□□□ 1.13
NME3-204ENST00000563498 CYP39A1Q9NYL5 469 aa22.14■■□□□ 1.13
NME3-204ENST00000563498 STX8Q9UNK0 236 aa22.14■■□□□ 1.13
NME3-204ENST00000563498 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.13
NME3-204ENST00000563498 SMPD1P17405 629 aa22.13■■□□□ 1.13
NME3-204ENST00000563498 IL17RBQ9NRM6 502 aa22.13■■□□□ 1.13
NME3-204ENST00000563498 PRR12Q9ULL5 1215 aa22.13■■□□□ 1.13
NME3-204ENST00000563498 TSPY2A6NKD2 308 aa22.12■■□□□ 1.13
NME3-204ENST00000563498 TAPT1Q6NXT6 567 aa22.12■■□□□ 1.13
NME3-204ENST00000563498 KCTD1Q719H9 257 aa22.12■■□□□ 1.13
NME3-204ENST00000563498 MORC4Q8TE76 937 aa22.12■■□□□ 1.13
NME3-204ENST00000563498 MSRAQ9UJ68 235 aa22.12■■□□□ 1.13
NME3-204ENST00000563498 GRIN2DO15399 1336 aa22.11■■□□□ 1.13
NME3-204ENST00000563498 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
NME3-204ENST00000563498 FGBP02675 491 aa22.11■■□□□ 1.13
NME3-204ENST00000563498 NOVP48745 357 aa22.11■■□□□ 1.13
NME3-204ENST00000563498 PRDM12Q9H4Q4 367 aa22.11■■□□□ 1.13
NME3-204ENST00000563498 VTA1Q9NP79 307 aa22.11■■□□□ 1.13
NME3-204ENST00000563498 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
NME3-204ENST00000563498 FOXP2O15409 715 aa22.1■■□□□ 1.13
NME3-204ENST00000563498 ICAM1P05362 532 aa22.1■■□□□ 1.13
NME3-204ENST00000563498 MUM1L1Q5H9M0 696 aa22.1■■□□□ 1.13
NME3-204ENST00000563498 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
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NME3-204ENST00000563498 PDGFCQ9NRA1 345 aa22.1■■□□□ 1.13
NME3-204ENST00000563498 ANAPC4Q9UJX5 808 aa22.1■■□□□ 1.13
NME3-204ENST00000563498 CCPG1Q9ULG6 757 aa22.1■■□□□ 1.13
NME3-204ENST00000563498 CHD9Q3L8U1 2897 aa22.09■■□□□ 1.13
NME3-204ENST00000563498 UMODL1Q5DID0 1318 aa22.09■■□□□ 1.13
NME3-204ENST00000563498 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa22.09■■□□□ 1.13
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NME3-204ENST00000563498 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
NME3-204ENST00000563498 B4GALT4O60513 344 aa22.08■■□□□ 1.13
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NME3-204ENST00000563498 MX1P20591 662 aa22.08■■□□□ 1.13
NME3-204ENST00000563498 SNAP25P60880 206 aa22.08■■□□□ 1.13
NME3-204ENST00000563498 CTDSPL2Q05D32 466 aa22.08■■□□□ 1.13
NME3-204ENST00000563498 DUSP28Q4G0W2 176 aa22.08■■□□□ 1.13
NME3-204ENST00000563498 NSMFQ6X4W1 530 aa22.08■■□□□ 1.13
NME3-204ENST00000563498 EEPD1Q7L9B9 569 aa22.08■■□□□ 1.13
NME3-204ENST00000563498 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
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NME3-204ENST00000563498 CHMP4CQ96CF2 233 aa22.08■■□□□ 1.13
NME3-204ENST00000563498 TRPV6Q9H1D0 765 aa22.08■■□□□ 1.13
NME3-204ENST00000563498 SLC28A3Q9HAS3 691 aa22.08■■□□□ 1.13
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NME3-204ENST00000563498 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
NME3-204ENST00000563498 LCTP09848 1927 aa22.08■■□□□ 1.12
NME3-204ENST00000563498 TNFRSF10AO00220 468 aa22.07■■□□□ 1.12
NME3-204ENST00000563498 ORC4O43929 436 aa22.07■■□□□ 1.12
NME3-204ENST00000563498 FGRP09769 529 aa22.07■■□□□ 1.12
NME3-204ENST00000563498 PTGS1P23219 599 aa22.07■■□□□ 1.12
NME3-204ENST00000563498 BTNL9Q6UXG8 535 aa22.07■■□□□ 1.12
NME3-204ENST00000563498 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa22.07■■□□□ 1.12
NME3-204ENST00000563498 RASGRP2Q7LDG7 609 aa22.07■■□□□ 1.12
NME3-204ENST00000563498 WNT8AQ9H1J5 351 aa22.07■■□□□ 1.12
NME3-204ENST00000563498 INCENPQ9NQS7 918 aa22.07■■□□□ 1.12
NME3-204ENST00000563498 THEGQ9P2T0 379 aa22.07■■□□□ 1.12
NME3-204ENST00000563498 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
NME3-204ENST00000563498 CCL23P55773 120 aa22.06■■□□□ 1.12
NME3-204ENST00000563498 PSMC6P62333 389 aa22.06■■□□□ 1.12
NME3-204ENST00000563498 ADGRE1Q14246 886 aa22.06■■□□□ 1.12
NME3-204ENST00000563498 TMEM63BQ5T3F8 832 aa22.06■■□□□ 1.12
NME3-204ENST00000563498 OTOP2Q7RTS6 562 aa22.06■■□□□ 1.12
NME3-204ENST00000563498 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
NME3-204ENST00000563498 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa22.06■■□□□ 1.12
NME3-204ENST00000563498 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa22.06■■□□□ 1.12
NME3-204ENST00000563498 MUC3AQ02505 3323 aa22.06■■□□□ 1.12
NME3-204ENST00000563498 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa22.05■■□□□ 1.12
NME3-204ENST00000563498 ALX1Q15699 326 aa22.05■■□□□ 1.12
NME3-204ENST00000563498 CCDC96Q2M329 555 aa22.05■■□□□ 1.12
NME3-204ENST00000563498 PPM1EQ8WY54 764 aa22.05■■□□□ 1.12
NME3-204ENST00000563498 ASB2Q96Q27 587 aa22.05■■□□□ 1.12
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