RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559737.5

USP3-AS1-203, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene USP3-AS1, Length 1,434 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-203ENST00000559737 BARHL2Q9NY43 387 aa21.54■■□□□ 1.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 VPS54Q9P1Q0 977 aa21.54■■□□□ 1.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 TRERF1Q96PN7 1200 aa21.53■■□□□ 1.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 EFCC1Q9HA90 598 aa21.53■■□□□ 1.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 RNF146Q9NTX7 359 aa21.53■■□□□ 1.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 WBP1LQ9NX94 342 aa21.53■■□□□ 1.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 SAGE1Q9NXZ1 904 aa21.53■■□□□ 1.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 ABCB11O95342 1321 aa21.52■■□□□ 1.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 ERCC3P19447 782 aa21.52■■□□□ 1.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 NAPAP54920 295 aa21.52■■□□□ 1.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 NCAPG2Q86XI2 1143 aa21.52■■□□□ 1.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 WASF1Q92558 559 aa21.52■■□□□ 1.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 PNMA2Q9UL42 364 aa21.52■■□□□ 1.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 hCG_1984214I3L0E3 225 aa21.51■■□□□ 1.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 OPLAHO14841 1288 aa21.51■■□□□ 1.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 SLC25A27O95847 323 aa21.51■■□□□ 1.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 CCNA1P78396 465 aa21.51■■□□□ 1.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 TRAF1Q13077 416 aa21.51■■□□□ 1.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 CLEC4DQ8WXI8 215 aa21.51■■□□□ 1.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 BEGAINQ9BUH8 593 aa21.51■■□□□ 1.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 TSKSQ9UJT2 592 aa21.51■■□□□ 1.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 NFIBO00712 420 aa21.5■■□□□ 1.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 TKFCQ3LXA3 575 aa21.5■■□□□ 1.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 WDR78Q5VTH9 848 aa21.5■■□□□ 1.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 SHCBP1Q8NEM2 672 aa21.5■■□□□ 1.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 TBC1D5Q92609 795 aa21.5■■□□□ 1.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 KCNJ14Q9UNX9 436 aa21.5■■□□□ 1.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 GUCY1B3Q02153 619 aa21.49■■□□□ 1.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 JMYQ8N9B5 988 aa21.49■■□□□ 1.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 CHST13Q8NET6 341 aa21.49■■□□□ 1.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 ACAD9Q9H845 621 aa21.49■■□□□ 1.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 SH3GLB2Q9NR46 395 aa21.49■■□□□ 1.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 DOCK3Q8IZD9 2030 aa21.49■■□□□ 1.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa21.48■■□□□ 1.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 SMCO2A6NFE2 343 aa21.48■■□□□ 1.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 GPR25O00155 361 aa21.48■■□□□ 1.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 COPB2P35606 906 aa21.48■■□□□ 1.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 PPP1R18Q6NYC8 613 aa21.48■■□□□ 1.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 C8orf76Q96K31 380 aa21.48■■□□□ 1.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 MROH8Q9H579 483 aa21.48■■□□□ 1.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 MGAMO43451 1857 aa21.48■■□□□ 1.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 ADAMTS3O15072 1205 aa21.47■■□□□ 1.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 CTGFP29279 349 aa21.47■■□□□ 1.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 NLRP5P59047 1200 aa21.47■■□□□ 1.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 SP3Q02447 781 aa21.47■■□□□ 1.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 KRT40Q6A162 431 aa21.47■■□□□ 1.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 CCDC148Q8NFR7 591 aa21.47■■□□□ 1.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZMYND12Q9H0C1 365 aa21.47■■□□□ 1.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 KIF3AQ9Y496 699 aa21.47■■□□□ 1.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 PLXNB2O15031 1838 aa21.47■■□□□ 1.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 CFBP00751 764 aa21.46■■□□□ 1.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 XBP1P17861 261 aa21.46■■□□□ 1.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 NSMFQ6X4W1 530 aa21.46■■□□□ 1.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 PHF20Q9BVI0 1012 aa21.46■■□□□ 1.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa21.46■■□□□ 1.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 PSTPIP2Q9H939 334 aa21.46■■□□□ 1.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 FBXO40Q9UH90 709 aa21.46■■□□□ 1.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 ESYT2A0FGR8 921 aa21.46■■□□□ 1.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 MAPK4P31152 587 aa21.46■■□□□ 1.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 ADCY7P51828 1080 aa21.46■■□□□ 1.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 CAP1Q01518 475 aa21.46■■□□□ 1.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 NPY5RQ15761 445 aa21.46■■□□□ 1.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 GPR142Q7Z601 462 aa21.46■■□□□ 1.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa21.46■■□□□ 1.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 RIC8AQ9NPQ8 531 aa21.46■■□□□ 1.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 MEIS2O14770 477 aa21.45■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 TRIM29Q14134 588 aa21.45■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 UBE2SQ16763 222 aa21.45■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 USP17L6PQ6QN14 398 aa21.45■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 MCF2L2Q86YR7 1114 aa21.45■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 MMP19Q99542 508 aa21.45■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 C6orf50Q9HD87 102 aa21.45■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 FCER1AP12319 257 aa21.44■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 SYT1P21579 422 aa21.44■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 RPS6P62753 249 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 SLC30A10Q6XR72 485 aa21.44■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 RNF207Q6ZRF8 634 aa21.44■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP21.44■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 PLEKHH3Q7Z736 793 aa21.44■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 ANKRD35Q8N283 1001 aa21.44■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 RGS22Q8NE09 1264 aa21.44■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 CUL5Q93034 780 aa21.44■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 CYP39A1Q9NYL5 469 aa21.44■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 LCTP09848 1927 aa21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms