RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558086.1

TMC3-AS1-201, TMC3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene TMC3-AS1, Length 658 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC3-AS1-201ENST00000558086 RNF146Q9NTX7 359 aa16■□□□□ 0.15
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
TMC3-AS1-201ENST00000558086 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP16■□□□□ 0.15
TMC3-AS1-201ENST00000558086 TSPY3P0CV98 308 aa15.99■□□□□ 0.15
TMC3-AS1-201ENST00000558086 TSPY8P0CW00 308 aa15.99■□□□□ 0.15
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ACRP10323 421 aa15.99■□□□□ 0.15
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SMPD1P17405 629 aa15.99■□□□□ 0.15
TMC3-AS1-201ENST00000558086 BEX3Q00994 111 aa15.99■□□□□ 0.15
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PDE4BQ07343 736 aa15.99■□□□□ 0.15
TMC3-AS1-201ENST00000558086 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa15.99■□□□□ 0.15
TMC3-AS1-201ENST00000558086 TAPT1Q6NXT6 567 aa15.99■□□□□ 0.15
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CXCL17Q6UXB2 119 aa15.99■□□□□ 0.15
TMC3-AS1-201ENST00000558086 STK11IPQ8N1F8 1099 aa15.99■□□□□ 0.15
TMC3-AS1-201ENST00000558086 GPATCH3Q96I76 525 aa15.99■□□□□ 0.15
TMC3-AS1-201ENST00000558086 AGBL1Q96MI9 1066 aa15.99■□□□□ 0.15
TMC3-AS1-201ENST00000558086 BCL11AQ9H165 835 aa15.99■□□□□ 0.15
TMC3-AS1-201ENST00000558086 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
TMC3-AS1-201ENST00000558086 HIPK3Q9H422 1215 aa15.99■□□□□ 0.15
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PRDM12Q9H4Q4 367 aa15.99■□□□□ 0.15
TMC3-AS1-201ENST00000558086 THEGQ9P2T0 379 aa15.99■□□□□ 0.15
TMC3-AS1-201ENST00000558086 UMODL1Q5DID0 1318 aa15.98■□□□□ 0.15
TMC3-AS1-201ENST00000558086 TTC41PQ6P2S7 1318 aa15.98■□□□□ 0.15
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CHD7Q9P2D1 2997 aa15.98■□□□□ 0.15
TMC3-AS1-201ENST00000558086 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa15.98■□□□□ 0.15
TMC3-AS1-201ENST00000558086 FOXP2O15409 715 aa15.98■□□□□ 0.15
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PPARAQ07869 468 aa15.98■□□□□ 0.15
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ITGA7Q13683 1181 aa15.98■□□□□ 0.15
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
TMC3-AS1-201ENST00000558086 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
TMC3-AS1-201ENST00000558086 IQSEC1Q6DN90 963 aa15.98■□□□□ 0.15
TMC3-AS1-201ENST00000558086 VTI1AQ96AJ9 217 aa15.98■□□□□ 0.15
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ASB2Q96Q27 587 aa15.98■□□□□ 0.15
TMC3-AS1-201ENST00000558086 NACAP1Q9BZK3 213 aa15.98■□□□□ 0.15
TMC3-AS1-201ENST00000558086 WNT8AQ9H1J5 351 aa15.98■□□□□ 0.15
TMC3-AS1-201ENST00000558086 HOMER2Q9NSB8 354 aa15.98■□□□□ 0.15
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CYP39A1Q9NYL5 469 aa15.98■□□□□ 0.15
TMC3-AS1-201ENST00000558086 MSRAQ9UJ68 235 aa15.98■□□□□ 0.15
TMC3-AS1-201ENST00000558086 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
TMC3-AS1-201ENST00000558086 B4GALT4O60513 344 aa15.97■□□□□ 0.15
TMC3-AS1-201ENST00000558086 FGBP02675 491 aa15.97■□□□□ 0.15
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SLC1A4P43007 532 aa15.97■□□□□ 0.15
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SLC4A3P48751 1232 aa15.97■□□□□ 0.15
TMC3-AS1-201ENST00000558086 TFAP4Q01664 338 aa15.97■□□□□ 0.15
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa15.97■□□□□ 0.15
TMC3-AS1-201ENST00000558086 C20orf194Q5TEA3 1177 aa15.97■□□□□ 0.15
TMC3-AS1-201ENST00000558086 TSHZ3Q63HK5 1081 aa15.97■□□□□ 0.15
TMC3-AS1-201ENST00000558086 RCSD1Q6JBY9 416 aa15.97■□□□□ 0.15
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PI4K2BQ8TCG2 481 aa15.97■□□□□ 0.15
TMC3-AS1-201ENST00000558086 TRERF1Q96PN7 1200 aa15.97■□□□□ 0.15
TMC3-AS1-201ENST00000558086 VTA1Q9NP79 307 aa15.97■□□□□ 0.15
TMC3-AS1-201ENST00000558086 RCAN3Q9UKA8 241 aa15.97■□□□□ 0.15
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa15.96■□□□□ 0.15
TMC3-AS1-201ENST00000558086 BDP1A6H8Y1 2624 aa15.96■□□□□ 0.15
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ZEB2O60315 1214 aa15.96■□□□□ 0.15
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PDGFCQ9NRA1 345 aa15.96■□□□□ 0.15
TMC3-AS1-201ENST00000558086 IL17RBQ9NRM6 502 aa15.96■□□□□ 0.15
TMC3-AS1-201ENST00000558086 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
TMC3-AS1-201ENST00000558086 APPP05067 770 aa15.95■□□□□ 0.14
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ICAM1P05362 532 aa15.95■□□□□ 0.14
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PFKMP08237 780 aa15.95■□□□□ 0.14
TMC3-AS1-201ENST00000558086 FGRP09769 529 aa15.95■□□□□ 0.14
TMC3-AS1-201ENST00000558086 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
TMC3-AS1-201ENST00000558086 MCCP23508 829 aa15.95■□□□□ 0.14
TMC3-AS1-201ENST00000558086 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
TMC3-AS1-201ENST00000558086 DUSP28Q4G0W2 176 aa15.95■□□□□ 0.14
TMC3-AS1-201ENST00000558086 MUM1L1Q5H9M0 696 aa15.95■□□□□ 0.14
TMC3-AS1-201ENST00000558086 BTNL9Q6UXG8 535 aa15.95■□□□□ 0.14
TMC3-AS1-201ENST00000558086 AP5M1Q9H0R1 490 aa15.95■□□□□ 0.14
TMC3-AS1-201ENST00000558086 NAPBQ9H115 298 aa15.95■□□□□ 0.14
TMC3-AS1-201ENST00000558086 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa15.95■□□□□ 0.14
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ANAPC4Q9UJX5 808 aa15.95■□□□□ 0.14
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PRR12Q9ULL5 1215 aa15.95■□□□□ 0.14
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa15.95■□□□□ 0.14
TMC3-AS1-201ENST00000558086 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ALAS1P13196 640 aa15.94■□□□□ 0.14
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PTGS1P23219 599 aa15.94■□□□□ 0.14
TMC3-AS1-201ENST00000558086 TMEM63BQ5T3F8 832 aa15.94■□□□□ 0.14
TMC3-AS1-201ENST00000558086 KCTD1Q719H9 257 aa15.94■□□□□ 0.14
TMC3-AS1-201ENST00000558086 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
TMC3-AS1-201ENST00000558086 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa15.94■□□□□ 0.14
TMC3-AS1-201ENST00000558086 TRPV6Q9H1D0 765 aa15.94■□□□□ 0.14
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
TMC3-AS1-201ENST00000558086 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SLC28A3Q9HAS3 691 aa15.94■□□□□ 0.14
TMC3-AS1-201ENST00000558086 TANC1Q9C0D5 1861 aa15.93■□□□□ 0.14
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ERC2O15083 957 aa15.93■□□□□ 0.14
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ORC4O43929 436 aa15.93■□□□□ 0.14
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PURAQ00577 322 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
TMC3-AS1-201ENST00000558086 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
TMC3-AS1-201ENST00000558086 OTOP2Q7RTS6 562 aa15.93■□□□□ 0.14
TMC3-AS1-201ENST00000558086 DCAF4Q8WV16 495 aa15.93■□□□□ 0.14
TMC3-AS1-201ENST00000558086 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SALL3Q9BXA9 1300 aa15.93■□□□□ 0.14
TMC3-AS1-201ENST00000558086 COL9A1P20849 921 aa15.92■□□□□ 0.14
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CCL23P55773 120 aa15.92■□□□□ 0.14
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PSMC6P62333 389 aa15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms