RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557779.1

TMEM229B-208, Transcript of transmembrane protein 229B, humanhuman

TSL 2

Gene TMEM229B, Length 701 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM229B-208ENST00000557779 CCDC178Q5BJE1 867 aa28.39■■■□□ 2.14
TMEM229B-208ENST00000557779 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
TMEM229B-208ENST00000557779 NSMFQ6X4W1 530 aa28.39■■■□□ 2.14
TMEM229B-208ENST00000557779 PDLIM7Q9NR12 457 aa28.39■■■□□ 2.14
TMEM229B-208ENST00000557779 MYADML2A6NDP7 307 aa28.38■■■□□ 2.13
TMEM229B-208ENST00000557779 MOXD2PA6NHM9 499 aa28.38■■■□□ 2.13
TMEM229B-208ENST00000557779 CST5P28325 142 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
TMEM229B-208ENST00000557779 ACLYP53396 1101 aa28.38■■■□□ 2.13
TMEM229B-208ENST00000557779 LRIT3Q3SXY7 679 aa28.38■■■□□ 2.13
TMEM229B-208ENST00000557779 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
TMEM229B-208ENST00000557779 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
TMEM229B-208ENST00000557779 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
TMEM229B-208ENST00000557779 LTBP2Q14767 1821 aa28.38■■■□□ 2.13
TMEM229B-208ENST00000557779 NFIBO00712 420 aa28.37■■■□□ 2.13
TMEM229B-208ENST00000557779 TLE2Q04725 743 aa28.37■■■□□ 2.13
TMEM229B-208ENST00000557779 KCNA10Q16322 511 aa28.37■■■□□ 2.13
TMEM229B-208ENST00000557779 PNMA1Q8ND90 353 aa28.37■■■□□ 2.13
TMEM229B-208ENST00000557779 ANKS1AQ92625 1134 aa28.37■■■□□ 2.13
TMEM229B-208ENST00000557779 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
TMEM229B-208ENST00000557779 LRRC37A2A6NM11 1700 aa28.37■■■□□ 2.13
TMEM229B-208ENST00000557779 GJA9P57773 515 aa28.36■■■□□ 2.13
TMEM229B-208ENST00000557779 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
TMEM229B-208ENST00000557779 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
TMEM229B-208ENST00000557779 KRT23Q9C075 422 aa28.36■■■□□ 2.13
TMEM229B-208ENST00000557779 KAT14Q9H8E8 782 aa28.36■■■□□ 2.13
TMEM229B-208ENST00000557779 CNNM2Q9H8M5 875 aa28.36■■■□□ 2.13
TMEM229B-208ENST00000557779 SPC25Q9HBM1 224 aa28.36■■■□□ 2.13
TMEM229B-208ENST00000557779 ZSWIM5Q9P217 1185 aa28.36■■■□□ 2.13
TMEM229B-208ENST00000557779 PNMA2Q9UL42 364 aa28.36■■■□□ 2.13
TMEM229B-208ENST00000557779 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
TMEM229B-208ENST00000557779 WDR19Q8NEZ3 1342 aa28.36■■■□□ 2.13
TMEM229B-208ENST00000557779 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
TMEM229B-208ENST00000557779 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
TMEM229B-208ENST00000557779 NUP133Q8WUM0 1156 aa28.35■■■□□ 2.13
TMEM229B-208ENST00000557779 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
TMEM229B-208ENST00000557779 TNKSO95271 1327 aa28.35■■■□□ 2.13
TMEM229B-208ENST00000557779 LCTP09848 1927 aa28.35■■■□□ 2.13
TMEM229B-208ENST00000557779 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
TMEM229B-208ENST00000557779 GOLGA8HP0CJ92 632 aa28.34■■■□□ 2.13
TMEM229B-208ENST00000557779 CHMLP26374 656 aa28.34■■■□□ 2.13
TMEM229B-208ENST00000557779 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa28.34■■■□□ 2.13
TMEM229B-208ENST00000557779 MORC4Q8TE76 937 aa28.34■■■□□ 2.13
TMEM229B-208ENST00000557779 RUFY2Q8WXA3 655 aa28.34■■■□□ 2.13
TMEM229B-208ENST00000557779 CLEC4DQ8WXI8 215 aa28.34■■■□□ 2.13
TMEM229B-208ENST00000557779 STARD7Q9NQZ5 370 aa28.34■■■□□ 2.13
TMEM229B-208ENST00000557779 TRIM43BA6NCK2 446 aa28.33■■■□□ 2.13
TMEM229B-208ENST00000557779 NKX3-2P78367 333 aa28.33■■■□□ 2.13
TMEM229B-208ENST00000557779 TNFAIP2Q03169 654 aa28.33■■■□□ 2.13
TMEM229B-208ENST00000557779 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
TMEM229B-208ENST00000557779 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
TMEM229B-208ENST00000557779 CTAGE5O15320 804 aa28.32■■■□□ 2.12
TMEM229B-208ENST00000557779 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
TMEM229B-208ENST00000557779 CLTBP09497 229 aa28.32■■■□□ 2.12
TMEM229B-208ENST00000557779 SLC30A10Q6XR72 485 aa28.32■■■□□ 2.12
TMEM229B-208ENST00000557779 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa28.32■■■□□ 2.12
TMEM229B-208ENST00000557779 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
TMEM229B-208ENST00000557779 UBAC1Q9BSL1 405 aa28.32■■■□□ 2.12
TMEM229B-208ENST00000557779 CPVLQ9H3G5 476 aa28.32■■■□□ 2.12
TMEM229B-208ENST00000557779 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
TMEM229B-208ENST00000557779 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
TMEM229B-208ENST00000557779 PTPDC1A2A3K4 754 aa28.31■■■□□ 2.12
TMEM229B-208ENST00000557779 ASGR1P07306 291 aa28.31■■■□□ 2.12
TMEM229B-208ENST00000557779 ASPRV1Q53RT3 343 aa28.31■■■□□ 2.12
TMEM229B-208ENST00000557779 GPR153Q6NV75 609 aa28.31■■■□□ 2.12
TMEM229B-208ENST00000557779 TAPT1Q6NXT6 567 aa28.31■■■□□ 2.12
TMEM229B-208ENST00000557779 BADQ92934 168 aa28.31■■■□□ 2.12
TMEM229B-208ENST00000557779 GLT1D1Q96MS3 346 aa28.31■■■□□ 2.12
TMEM229B-208ENST00000557779 UBA5Q9GZZ9 404 aa28.31■■■□□ 2.12
TMEM229B-208ENST00000557779 ELP1O95163 1332 aa28.3■■■□□ 2.12
TMEM229B-208ENST00000557779 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa28.3■■■□□ 2.12
TMEM229B-208ENST00000557779 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
TMEM229B-208ENST00000557779 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
TMEM229B-208ENST00000557779 GNASQ5JWF2 1037 aa28.3■■■□□ 2.12
TMEM229B-208ENST00000557779 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
TMEM229B-208ENST00000557779 EEPD1Q7L9B9 569 aa28.3■■■□□ 2.12
TMEM229B-208ENST00000557779 TOX2Q96NM4 488 aa28.3■■■□□ 2.12
TMEM229B-208ENST00000557779 VTA1Q9NP79 307 aa28.3■■■□□ 2.12
TMEM229B-208ENST00000557779 PDGFCQ9NRA1 345 aa28.3■■■□□ 2.12
TMEM229B-208ENST00000557779 SMPD1P17405 629 aa28.29■■■□□ 2.12
TMEM229B-208ENST00000557779 PTH1RQ03431 593 aa28.29■■■□□ 2.12
TMEM229B-208ENST00000557779 RNF207Q6ZRF8 634 aa28.29■■■□□ 2.12
TMEM229B-208ENST00000557779 TLK2Q86UE8 772 aa28.29■■■□□ 2.12
TMEM229B-208ENST00000557779 KIAA0355O15063 1070 aa28.28■■■□□ 2.12
TMEM229B-208ENST00000557779 CALML3P27482 149 aa28.28■■■□□ 2.12
TMEM229B-208ENST00000557779 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
TMEM229B-208ENST00000557779 IQSEC1Q6DN90 963 aa28.28■■■□□ 2.12
TMEM229B-208ENST00000557779 SGSM2O43147 1006 aa28.27■■■□□ 2.12
TMEM229B-208ENST00000557779 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
TMEM229B-208ENST00000557779 ITGB8P26012 769 aa28.27■■■□□ 2.12
TMEM229B-208ENST00000557779 RPS6P62753 249 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
TMEM229B-208ENST00000557779 BEX3Q00994 111 aa28.27■■■□□ 2.12
TMEM229B-208ENST00000557779 FAAP100Q0VG06 881 aa28.27■■■□□ 2.12
TMEM229B-208ENST00000557779 SEC23AQ15436 765 aa28.27■■■□□ 2.12
TMEM229B-208ENST00000557779 USH1GQ495M9 461 aa28.27■■■□□ 2.12
TMEM229B-208ENST00000557779 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
TMEM229B-208ENST00000557779 CYB5R4Q7L1T6 521 aa28.27■■■□□ 2.12
TMEM229B-208ENST00000557779 ADGRF4Q8IZF3 695 aa28.27■■■□□ 2.12
TMEM229B-208ENST00000557779 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
TMEM229B-208ENST00000557779 DCDC2CA8MYV0 355 aa28.26■■■□□ 2.11
TMEM229B-208ENST00000557779 CYP21A2P08686 494 aa28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59 ms