RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556374.5

ATXN3-241, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 1,083 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-241ENST00000556374 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa5.59□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa5.58□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa5.58□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 CGNL1Q0VF96 1302 aa5.58□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 RAC2P15153 192 aa5.58□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa5.58□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 UNC5CLQ8IV45 518 aa5.58□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 TMEM87BQ96K49 555 aa5.58□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 CFAP53Q96M91 514 aa5.58□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 ATP13A1Q9HD20 1204 aa5.58□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 C19orf73Q9NVV2 129 aa5.58□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 USP31Q70CQ4 1352 aa5.57□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa5.57□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 KIF1AQ12756 1690 aa5.57□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa5.57□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 PLIN1O60240 522 aa5.57□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 SRFP11831 508 aa5.57□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 ERCC3P19447 782 aa5.57□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 DAB2P98082 770 aa5.57□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 TMEM201Q5SNT2 666 aa5.57□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 GPR62Q9BZJ7 368 aa5.57□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 PRDM7Q9NQW5 492 aa5.57□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 SLC52A1Q9NWF4 448 aa5.57□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP5.57□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 CEP131Q9UPN4 1083 aa5.57□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 NSD3Q9BZ95 1437 aa5.57□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 NSD2O96028 1365 aa5.56□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 PRR36Q9H6K5 1346 aa5.56□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 PRR33A8MZF0 331 aa5.56□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 H3BS24 57 aa5.56□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 PGRP06401 933 aa5.56□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 RAP1GAPP47736 663 aa5.56□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 TNK2Q07912 1038 aa5.56□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 PWP1Q13610 501 aa5.56□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 BECN1Q14457 450 aa5.56□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 MLANAQ16655 118 aa5.56□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 CDKAL1Q5VV42 579 aa5.56□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP5.56□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 RIN3Q8TB24 985 aa5.56□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.56□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 TJP2Q9UDY2 1190 aa5.56□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 KCNH3Q9ULD8 1083 aa5.56□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 DLC1Q96QB1 1528 aa5.56□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa5.56□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 NRXN1Q9ULB1 1477 aa5.56□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 UTRNP46939 3433 aa5.55□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 KDM2BQ8NHM5 1336 aa5.55□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 YARSP54577 528 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 SLFN5Q08AF3 891 aa5.55□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 VPS72Q15906 364 aa5.55□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa5.55□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP5.55□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 TMC4Q7Z404 712 aa5.55□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 CILP2Q8IUL8 1156 aa5.55□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 CCDC146Q8IYE0 955 aa5.55□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 SLFN12Q8IYM2 578 aa5.55□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 LILRA2Q8N149 483 aa5.55□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa5.55□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 UBE2FQ969M7 185 aa5.55□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 SPON1Q9HCB6 807 aa5.55□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa5.55□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 TMEM59LQ9UK28 342 aa5.55□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa5.55□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 NPHP3Q7Z494 1330 aa5.54□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 ZNF521Q96K83 1311 aa5.54□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa5.54□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 ANKRD33BA6NCL7 494 aa5.54□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 HPXP02790 462 aa5.54□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 MED14OSP0DP75 135 aa5.54□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 RGS3P49796 1198 aa5.54□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 LMNB2Q03252 620 aa5.54□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 NR0B2Q15466 257 aa5.54□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 GAB4Q2WGN9 574 aa5.54□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 FYB2Q5VWT5 728 aa5.54□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 MPZL3Q6UWV2 235 aa5.54□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 MORC1Q86VD1 984 aa5.54□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 DNAJB8Q8NHS0 232 aa5.54□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa5.54□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 RSRP1Q9BUV0 290 aa5.54□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 GPATCH2Q9NW75 528 aa5.54□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 METP08581 1390 aa5.54□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 KCNQ2O43526 872 aa5.53□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 CILPO75339 1184 aa5.53□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 CBX7O95931 251 aa5.53□□□□□ -1.52
ATXN3-241ENST00000556374 ESR1P03372 595 aa5.53□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.6 ms