RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550442.5

LETMD1-223, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 4

Gene LETMD1, Length 469 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-223	ENST00000550442	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	PRDM1	O75626	825 aa		13.36	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	AMPD3	Q01432	767 aa		13.36	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	PTGDR	Q13258	359 aa		13.36	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	NPY5R	Q15761	445 aa		13.36	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	SPATA1	Q5VX52	437 aa		13.36	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		13.36	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	MOB2	Q70IA6	237 aa		13.36	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		13.36	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	ARMC5	Q96C12	935 aa		13.36	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	NAA15	Q9BXJ9	866 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	RAB34	Q9BZG1	259 aa		13.36	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	MAN1B1	Q9UKM7	699 aa		13.36	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		13.36	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442		A0A0C4DFX4	3053 aa		13.36	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	COL4A1	P02462	1669 aa		13.36	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		13.36	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	FLT1	P17948	1338 aa		13.36	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	CENPF	P49454	3210 aa		13.35	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		13.35	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	UQCRHL	A0A096LP55	91 aa		13.35	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	C6orf229	H3BNL8	230 aa		13.35	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442		M0R2N6	131 aa		13.35	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	HLA-DOA	P06340	250 aa		13.35	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	UQCRH	P07919	91 aa		13.35	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF18	P17022	549 aa		13.35	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	NF2	P35240	595 aa		13.35	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	MMP14	P50281	582 aa		13.35	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	RHBDL3	P58872	404 aa		13.35	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	TUBB4B	P68371	445 aa		13.35	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	PNOC	Q13519	176 aa		13.35	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	KCNB1	Q14721	858 aa		13.35	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	PTPN14	Q15678	1187 aa		13.35	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		13.35	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	VSTM4	Q8IW00	320 aa		13.35	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	KCTD17	Q8N5Z5	321 aa		13.35	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	IQCD	Q96DY2	449 aa		13.35	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	CCDC51	Q96ER9	411 aa		13.35	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	PAGE5	Q96GU1	130 aa		13.35	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	ERO1A	Q96HE7	468 aa		13.35	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		13.35	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		13.35	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		13.35	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	IFNK	Q9P0W0	207 aa		13.35	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		13.35	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	STK24	Q9Y6E0	443 aa		13.35	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	HTT	P42858	3142 aa		13.35	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		13.34	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	KLRF2	D3W0D1	207 aa		13.34	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	RIMBP2	O15034	1052 aa		13.34	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	ECE2	O60344	883 aa		13.34	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	STX10	O60499	249 aa		13.34	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	TPM1	P09493	284 aa		13.34	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	STIM1	Q13586	685 aa		13.34	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	TRIM14	Q14142	442 aa		13.34	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		13.34	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	KIF18A	Q8NI77	898 aa		13.34	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	OXER1	Q8TDS5	423 aa		13.34	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	POLL	Q9UGP5	575 aa		13.34	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	PYCARD	Q9ULZ3	195 aa		13.34	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		13.34	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	TAF1	P21675	1872 aa		13.33	□□□□□ -0.27
LETMD1-223	ENST00000550442	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442		G3V3G9	751 aa		13.33	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	ARHGAP6	O43182	974 aa		13.33	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	SNHG28	P0DPA3	235 aa		13.33	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	GABPA	Q06546	454 aa		13.33	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	DPYD	Q12882	1025 aa		13.33	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	13.33	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	CFAP100	Q494V2	611 aa		13.33	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		13.33	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		13.33	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	SPECC1L	Q69YQ0	1117 aa		13.33	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		13.33	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		13.33	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		13.33	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	TEKT1	Q969V4	418 aa		13.33	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		13.33	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	STX8	Q9UNK0	236 aa		13.33	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	NAV1	Q8NEY1	1877 aa		13.33	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	BRCA2	P51587	3418 aa		13.33	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	BIN1	O00499	593 aa		13.32	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	TTLL1	O95922	423 aa		13.32	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	TNNT1	P13805	278 aa		13.32	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	UBA7	P41226	1012 aa		13.32	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	CCZ1B	P86790	482 aa		13.32	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	CCZ1	P86791	482 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
LETMD1-223	ENST00000550442	TUBB2A	Q13885	445 aa		13.32	□□□□□ -0.28

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms