RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa9.56□□□□□ -0.88
CS-215ENST00000549143 POTEDQ86YR6 584 aa9.56□□□□□ -0.88
CS-215ENST00000549143 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa9.56□□□□□ -0.88
CS-215ENST00000549143 PPP1R9BQ96SB3 815 aa9.56□□□□□ -0.88
CS-215ENST00000549143 PRR12Q9ULL5 1215 aa9.56□□□□□ -0.88
CS-215ENST00000549143 UBA7P41226 1012 aa9.55□□□□□ -0.88
CS-215ENST00000549143 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
CS-215ENST00000549143 FCHSD1Q86WN1 690 aa9.55□□□□□ -0.88
CS-215ENST00000549143 FBXO11Q86XK2 927 aa9.55□□□□□ -0.88
CS-215ENST00000549143 C4orf32Q8N8J7 132 aa9.55□□□□□ -0.88
CS-215ENST00000549143 GMCL1Q96IK5 515 aa9.55□□□□□ -0.88
CS-215ENST00000549143 TIGD1Q96MW7 591 aa9.55□□□□□ -0.88
CS-215ENST00000549143 AMNQ9BXJ7 453 aa9.55□□□□□ -0.88
CS-215ENST00000549143 BLZF1Q9H2G9 400 aa9.55□□□□□ -0.88
CS-215ENST00000549143 GPRC5DQ9NZD1 345 aa9.55□□□□□ -0.88
CS-215ENST00000549143 LTBP3Q9NS15 1303 aa9.55□□□□□ -0.88
CS-215ENST00000549143 ECM29Q5VYK3 1845 aa9.55□□□□□ -0.88
CS-215ENST00000549143 DLEC1Q9Y238 1755 aa9.55□□□□□ -0.88
CS-215ENST00000549143 SLC37A4O43826 429 aa9.55□□□□□ -0.88
CS-215ENST00000549143 DRC7Q8IY82 874 aa9.55□□□□□ -0.88
CS-215ENST00000549143 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
CS-215ENST00000549143 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
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CS-215ENST00000549143 PGAP2Q9UHJ9 254 aa9.55□□□□□ -0.88
CS-215ENST00000549143 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
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CS-215ENST00000549143 ESYT2A0FGR8 921 aa9.55□□□□□ -0.88
CS-215ENST00000549143 PHF20L1A8MW92 1017 aa9.55□□□□□ -0.88
CS-215ENST00000549143 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
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CS-215ENST00000549143 OR52Z1P0C646 297 aa9.55□□□□□ -0.88
CS-215ENST00000549143 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP9.55□□□□□ -0.889e-10■■□□□ 12.1
CS-215ENST00000549143 TXLNAP40222 546 aa9.55□□□□□ -0.88
CS-215ENST00000549143 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
CS-215ENST00000549143 SPP2Q13103 211 aa9.55□□□□□ -0.88
CS-215ENST00000549143 CPXCR1Q8N123 301 aa9.55□□□□□ -0.88
CS-215ENST00000549143 SMARCE1Q969G3 411 aa9.55□□□□□ -0.88
CS-215ENST00000549143 PDLIM2Q96JY6 352 aa9.55□□□□□ -0.88
CS-215ENST00000549143 WRNIP1Q96S55 665 aa9.55□□□□□ -0.88
CS-215ENST00000549143 VCPKMTQ9H867 229 aa9.55□□□□□ -0.88
CS-215ENST00000549143 FOCADQ5VW36 1801 aa9.54□□□□□ -0.88
CS-215ENST00000549143 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa9.54□□□□□ -0.88
CS-215ENST00000549143 hCG_1984214I3L0E3 225 aa9.54□□□□□ -0.88
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CS-215ENST00000549143 IQCB1Q15051 598 aa9.54□□□□□ -0.88
CS-215ENST00000549143 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
CS-215ENST00000549143 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
CS-215ENST00000549143 IQUBQ8NA54 791 aa9.54□□□□□ -0.88
CS-215ENST00000549143 MTMR8Q96EF0 704 aa9.54□□□□□ -0.88
CS-215ENST00000549143 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
CS-215ENST00000549143 SLFN14P0C7P3 912 aa9.54□□□□□ -0.88
CS-215ENST00000549143 STAT6P42226 847 aa9.54□□□□□ -0.88
CS-215ENST00000549143 NLRP12P59046 1061 aa9.54□□□□□ -0.88
CS-215ENST00000549143 MTMR2Q13614 643 aa9.54□□□□□ -0.88
CS-215ENST00000549143 CALCRLQ16602 461 aa9.54□□□□□ -0.88
CS-215ENST00000549143 KLHL10Q6JEL2 608 aa9.54□□□□□ -0.88
CS-215ENST00000549143 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
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CS-215ENST00000549143 TBC1D5Q92609 795 aa9.54□□□□□ -0.88
CS-215ENST00000549143 TANGO6Q9C0B7 1094 aa9.54□□□□□ -0.88
CS-215ENST00000549143 BMP6P22004 513 aa9.53□□□□□ -0.88
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CS-215ENST00000549143 UBXN2AP68543 259 aa9.53□□□□□ -0.88
CS-215ENST00000549143 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
CS-215ENST00000549143 PAGE5Q96GU1 130 aa9.53□□□□□ -0.88
CS-215ENST00000549143 CCDC34Q96HJ3 373 aa9.53□□□□□ -0.88
CS-215ENST00000549143 HOMER2Q9NSB8 354 aa9.53□□□□□ -0.88
CS-215ENST00000549143 POTEMA6NI47 508 aa9.53□□□□□ -0.88
CS-215ENST00000549143 SPDYE3A6NKU9 549 aa9.53□□□□□ -0.88
CS-215ENST00000549143 MEIS2O14770 477 aa9.53□□□□□ -0.88
CS-215ENST00000549143 C9orf131Q5VYM1 1079 aa9.53□□□□□ -0.88
CS-215ENST00000549143 RRAGBQ5VZM2 374 aa9.53□□□□□ -0.88
CS-215ENST00000549143 SH2D4AQ9H788 454 aa9.53□□□□□ -0.88
CS-215ENST00000549143 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
CS-215ENST00000549143 TUBE1Q9UJT0 475 aa9.53□□□□□ -0.88
CS-215ENST00000549143 MAN1B1Q9UKM7 699 aa9.53□□□□□ -0.88
CS-215ENST00000549143 MYH8P13535 1937 aa9.53□□□□□ -0.88
CS-215ENST00000549143 MYH15Q9Y2K3 1946 aa9.53□□□□□ -0.88
CS-215ENST00000549143 EDIL3O43854 480 aa9.52□□□□□ -0.88
CS-215ENST00000549143 COBLO75128 1261 aa9.52□□□□□ -0.88
CS-215ENST00000549143 CAVIN2O95810 425 aa9.52□□□□□ -0.88
CS-215ENST00000549143 KANK3Q6NY19 840 aa9.52□□□□□ -0.88
CS-215ENST00000549143 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.88
CS-215ENST00000549143 CHURC1Q8WUH1 139 aa9.52□□□□□ -0.88
CS-215ENST00000549143 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.88
CS-215ENST00000549143 ANO3Q9BYT9 981 aa9.52□□□□□ -0.88
CS-215ENST00000549143 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.88
CS-215ENST00000549143 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa9.52□□□□□ -0.88
CS-215ENST00000549143 ZHX2Q9Y6X8 837 aa9.52□□□□□ -0.88
CS-215ENST00000549143 SIPA1L1O43166 1804 aa9.52□□□□□ -0.89
CS-215ENST00000549143 KIF13BQ9NQT8 1826 aa9.52□□□□□ -0.89
CS-215ENST00000549143 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
CS-215ENST00000549143 FLOT1O75955 427 aa9.52□□□□□ -0.89
CS-215ENST00000549143 PRR16Q569H4 304 aa9.52□□□□□ -0.89
CS-215ENST00000549143 AGBL1Q96MI9 1066 aa9.52□□□□□ -0.89
CS-215ENST00000549143 PICK1Q9NRD5 415 aa9.52□□□□□ -0.89
CS-215ENST00000549143 ESPNB1AK53 854 aa9.51□□□□□ -0.89
CS-215ENST00000549143 STX17P56962 302 aa9.51□□□□□ -0.89
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