RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547310.1

LGR5-204, Transcript of leucine rich repeat containing G protein-coupled receptor 5, human

TSL 3

Gene LGR5, Length 576 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LGR5-204	ENST00000547310	CNOT6	Q9ULM6	557 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
LGR5-204	ENST00000547310	OTOL1	A6NHN0	477 aa	Predicted RBP	7	□□□□□ -1.29
LGR5-204	ENST00000547310	PEX10	O60683	326 aa		7	□□□□□ -1.29
LGR5-204	ENST00000547310	SEMA7A	O75326	666 aa		7	□□□□□ -1.29
LGR5-204	ENST00000547310	GJB6	O95452	261 aa		7	□□□□□ -1.29
LGR5-204	ENST00000547310	DUSP4	Q13115	394 aa		7	□□□□□ -1.29
LGR5-204	ENST00000547310	GRB10	Q13322	594 aa		7	□□□□□ -1.29
LGR5-204	ENST00000547310	NR0B2	Q15466	257 aa		7	□□□□□ -1.29
LGR5-204	ENST00000547310	MRM1	Q6IN84	353 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
LGR5-204	ENST00000547310	CELF2-AS1	Q8N7Q2	184 aa		7	□□□□□ -1.29
LGR5-204	ENST00000547310	PDZD8	Q8NEN9	1154 aa		7	□□□□□ -1.29
LGR5-204	ENST00000547310	BRF1	Q92994	677 aa		7	□□□□□ -1.29
LGR5-204	ENST00000547310	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	7	□□□□□ -1.29
LGR5-204	ENST00000547310	SLC12A9	Q9BXP2	914 aa		7	□□□□□ -1.29
LGR5-204	ENST00000547310	MSRB2	Q9Y3D2	182 aa		7	□□□□□ -1.29
LGR5-204	ENST00000547310	SSU72P8	A0A1W2PR75	194 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LGR5-204	ENST00000547310	OVOL3	O00110	214 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LGR5-204	ENST00000547310	AKAP8	O43823	692 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
LGR5-204	ENST00000547310	SUSD5	O60279	629 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LGR5-204	ENST00000547310	DDAH1	O94760	285 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LGR5-204	ENST00000547310	HPX	P02790	462 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LGR5-204	ENST00000547310	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	6.99	□□□□□ -1.29
LGR5-204	ENST00000547310	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
LGR5-204	ENST00000547310	CWF19L1	Q69YN2	538 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
LGR5-204	ENST00000547310	CRTC3	Q6UUV7	619 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LGR5-204	ENST00000547310	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LGR5-204	ENST00000547310	ADAT2	Q7Z6V5	191 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
LGR5-204	ENST00000547310	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
LGR5-204	ENST00000547310	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LGR5-204	ENST00000547310	NOL6	Q9H6R4	1146 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
LGR5-204	ENST00000547310	SP110	Q9HB58	689 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LGR5-204	ENST00000547310	CGGBP1	Q9UFW8	167 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
LGR5-204	ENST00000547310	EMC9	Q9Y3B6	208 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LGR5-204	ENST00000547310		B2RBV5	119 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LGR5-204	ENST00000547310		H0Y8X5	98 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LGR5-204	ENST00000547310	MEIS1	O00470	390 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LGR5-204	ENST00000547310	INSRR	P14616	1297 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LGR5-204	ENST00000547310	KIR2DL1	P43626	348 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
LGR5-204	ENST00000547310	KIR2DL2	P43627	348 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
LGR5-204	ENST00000547310	POU4F1	Q01851	419 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LGR5-204	ENST00000547310	CHRNE	Q04844	493 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LGR5-204	ENST00000547310	SERINC3	Q13530	473 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LGR5-204	ENST00000547310	RTP2	Q5QGT7	225 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LGR5-204	ENST00000547310	POMZP3	Q6PJE2	187 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LGR5-204	ENST00000547310	SPPL2C	Q8IUH8	684 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LGR5-204	ENST00000547310	ANKS4B	Q8N8V4	417 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LGR5-204	ENST00000547310	BVES	Q8NE79	360 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LGR5-204	ENST00000547310	MYLIP	Q8WY64	445 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LGR5-204	ENST00000547310	ZNF669	Q96BR6	464 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
LGR5-204	ENST00000547310	FCRL2	Q96LA5	508 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
LGR5-204	ENST00000547310	FGD4	Q96M96	766 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LGR5-204	ENST00000547310	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LGR5-204	ENST00000547310	APEX2	Q9UBZ4	518 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LGR5-204	ENST00000547310	EBF1	Q9UH73	591 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LGR5-204	ENST00000547310	FITM1	A5D6W6	292 aa		6.97	□□□□□ -1.29
LGR5-204	ENST00000547310	RPL10	P27635	214 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
LGR5-204	ENST00000547310	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		6.97	□□□□□ -1.29
LGR5-204	ENST00000547310	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		6.97	□□□□□ -1.29
LGR5-204	ENST00000547310	OXR1	Q8N573	874 aa		6.97	□□□□□ -1.29
LGR5-204	ENST00000547310	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
LGR5-204	ENST00000547310	MAP6	Q96JE9	813 aa		6.97	□□□□□ -1.29
LGR5-204	ENST00000547310	MRGPRX3	Q96LB0	322 aa		6.97	□□□□□ -1.29
LGR5-204	ENST00000547310	DRC1	Q96MC2	740 aa		6.97	□□□□□ -1.29
LGR5-204	ENST00000547310	FCRL3	Q96P31	734 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
LGR5-204	ENST00000547310	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		6.97	□□□□□ -1.29
LGR5-204	ENST00000547310	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		6.97	□□□□□ -1.29
LGR5-204	ENST00000547310	TNFRSF10D	Q9UBN6	386 aa		6.97	□□□□□ -1.29
LGR5-204	ENST00000547310	KCTD3	Q9Y597	815 aa		6.97	□□□□□ -1.29
LGR5-204	ENST00000547310	RFXAP	O00287	272 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LGR5-204	ENST00000547310	CAPNS1	P04632	268 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LGR5-204	ENST00000547310	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LGR5-204	ENST00000547310	IRF2BP1	Q8IU81	584 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LGR5-204	ENST00000547310	LILRA2	Q8N149	483 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LGR5-204	ENST00000547310	ADCY4	Q8NFM4	1077 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LGR5-204	ENST00000547310	ERVK13-1	Q9NX77	482 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LGR5-204	ENST00000547310	AKT3	Q9Y243	479 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LGR5-204	ENST00000547310	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LGR5-204	ENST00000547310	AURKA	O14965	403 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LGR5-204	ENST00000547310	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	6.95	□□□□□ -1.3
LGR5-204	ENST00000547310	PUM1	Q14671	1186 aa	Known RBP eCLIP	6.95	□□□□□ -1.3
LGR5-204	ENST00000547310	PPP2R5D	Q14738	602 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LGR5-204	ENST00000547310	SNX17	Q15036	470 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LGR5-204	ENST00000547310	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LGR5-204	ENST00000547310	MKL1	Q969V6	931 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LGR5-204	ENST00000547310	SGSM3	Q96HU1	749 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LGR5-204	ENST00000547310	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LGR5-204	ENST00000547310	ST7	Q9NRC1	585 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LGR5-204	ENST00000547310	ADAMTS20	P59510	1910 aa		6.94	□□□□□ -1.3
LGR5-204	ENST00000547310	TEX51	A0A1B0GUA7	166 aa		6.94	□□□□□ -1.3
LGR5-204	ENST00000547310	MYOCOS	A0A1B0GUC4	107 aa		6.94	□□□□□ -1.3
LGR5-204	ENST00000547310	FADS2P1	A8MWK0	482 aa		6.94	□□□□□ -1.3
LGR5-204	ENST00000547310	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	6.94	□□□□□ -1.3
LGR5-204	ENST00000547310	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	6.94	□□□□□ -1.3
LGR5-204	ENST00000547310	FGF10	O15520	208 aa	Predicted RBP	6.94	□□□□□ -1.3
LGR5-204	ENST00000547310	FKTN	O75072	461 aa		6.94	□□□□□ -1.3
LGR5-204	ENST00000547310	HK2	P52789	917 aa		6.94	□□□□□ -1.3
LGR5-204	ENST00000547310	AMPD2	Q01433	879 aa		6.94	□□□□□ -1.3
LGR5-204	ENST00000547310	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		6.94	□□□□□ -1.3
LGR5-204	ENST00000547310	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		6.94	□□□□□ -1.3
LGR5-204	ENST00000547310	CYP2R1	Q6VVX0	501 aa		6.94	□□□□□ -1.3

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms