RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546891.5

CS-205, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 911 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-205ENST00000546891 EHBP1Q8NDI1 1231 aa10.98□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 RASGRP4Q8TDF6 673 aa10.98□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 GOLGA1Q92805 767 aa10.98□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 CEP95Q96GE4 821 aa10.98□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 TRIM47Q96LD4 638 aa10.98□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 CCDC17Q96LX7 622 aa10.98□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 MTRQ99707 1265 aa10.98□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 TMEM60Q9H2L4 133 aa10.98□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 ABHD10Q9NUJ1 306 aa10.98□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa10.98□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa10.98□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa10.97□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa10.97□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 KLRC4O43908 158 aa10.97□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 TTLL1O95922 423 aa10.97□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 GYPCP04921 128 aa10.97□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 PDHBP11177 359 aa10.97□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 ALDH1B1P30837 517 aa10.97□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 CASP14P31944 242 aa10.97□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 CBX1P83916 185 aa10.97□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 UBXN1Q04323 297 aa10.97□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 GABPAQ06546 454 aa10.97□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 GOLGA8FQ08AF8 430 aa10.97□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa10.97□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 SEPT2Q15019 361 aa10.97□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 SLC35G1Q2M3R5 365 aa10.97□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 TMCO3Q6UWJ1 677 aa10.97□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 RABGGTAQ92696 567 aa10.97□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 STAMQ92783 540 aa10.97□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 KIFC2Q96AC6 838 aa10.97□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa10.97□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 MTMR4Q9NYA4 1195 aa10.97□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 TAB2Q9NYJ8 693 aa10.97□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 ABCB11O95342 1321 aa10.97□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 LTBP1Q14766 1721 aa10.96□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 CTAGE9A4FU28 777 aa10.96□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 SOWAHDA6NJG2 315 aa10.96□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 NPR1P16066 1061 aa10.96□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 PLCG1P19174 1290 aa10.96□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 ASIC1P78348 528 aa10.96□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 PDE4DQ08499 809 aa10.96□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 CALCRLQ16602 461 aa10.96□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa10.96□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 USP17L2Q6R6M4 530 aa10.96□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 HHIPL2Q6UWX4 724 aa10.96□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 ZNF662Q6ZS27 426 aa10.96□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 SV2BQ7L1I2 683 aa10.96□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 TEX2Q8IWB9 1127 aa10.96□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 MB21D1Q8N884 522 aa10.96□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 FLAD1Q8NFF5 587 aa10.96□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 OR8K1Q8NGG5 319 aa10.96□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 TBCKQ8TEA7 893 aa10.96□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 P2RX5Q93086 422 aa10.96□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 PIGSQ96S52 555 aa10.96□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 ARID3AQ99856 593 aa10.96□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 CARD6Q9BX69 1037 aa10.96□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 TRIM9Q9C026 710 aa10.96□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 EHD4Q9H223 541 aa10.96□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 VPS16Q9H269 839 aa10.96□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 LRRC4BQ9NT99 713 aa10.96□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 POLLQ9UGP5 575 aa10.96□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 SERPINB13Q9UIV8 391 aa10.96□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 GDAQ9Y2T3 454 aa10.96□□□□□ -0.65
CS-205ENST00000546891 BRWD3Q6RI45 1802 aa10.95□□□□□ -0.66
CS-205ENST00000546891 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa10.95□□□□□ -0.66
CS-205ENST00000546891 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa10.95□□□□□ -0.66
CS-205ENST00000546891 GOLGA8HP0CJ92 632 aa10.95□□□□□ -0.66
CS-205ENST00000546891 SRGNP10124 158 aa10.95□□□□□ -0.66
CS-205ENST00000546891 KRT9P35527 623 aa10.95□□□□□ -0.66
CS-205ENST00000546891 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
CS-205ENST00000546891 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
CS-205ENST00000546891 GTF2IP78347 998 aa10.95□□□□□ -0.66
CS-205ENST00000546891 KRT83P78385 493 aa10.95□□□□□ -0.66
CS-205ENST00000546891 DDR1Q08345 913 aa10.95□□□□□ -0.66
CS-205ENST00000546891 ZNF543Q08ER8 600 aa10.95□□□□□ -0.66
CS-205ENST00000546891 PSMD2Q13200 908 aa10.95□□□□□ -0.66
CS-205ENST00000546891 PDIA5Q14554 519 aa10.95□□□□□ -0.66
CS-205ENST00000546891 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
CS-205ENST00000546891 TXNRD1Q16881 649 aa10.95□□□□□ -0.66
CS-205ENST00000546891 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa10.95□□□□□ -0.66
CS-205ENST00000546891 FIGNQ5HY92 759 aa10.95□□□□□ -0.66
CS-205ENST00000546891 FKBP15Q5T1M5 1219 aa10.95□□□□□ -0.66
CS-205ENST00000546891 KRT79Q5XKE5 535 aa10.95□□□□□ -0.66
CS-205ENST00000546891 PPP4R3AQ6IN85 833 aa10.95□□□□□ -0.66
CS-205ENST00000546891 TTI2Q6NXR4 508 aa10.95□□□□□ -0.66
CS-205ENST00000546891 RAD9BQ6WBX8 426 aa10.95□□□□□ -0.66
CS-205ENST00000546891 UNC13DQ70J99 1090 aa10.95□□□□□ -0.66
CS-205ENST00000546891 NLGN1Q8N2Q7 840 aa10.95□□□□□ -0.66
CS-205ENST00000546891 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa10.95□□□□□ -0.66
CS-205ENST00000546891 CPLX3Q8WVH0 158 aa10.95□□□□□ -0.66
CS-205ENST00000546891 CUL5Q93034 780 aa10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms