RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540109.5

PTPRD-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 6,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-214ENST00000540109 PLCG2P16885 1265 aa6.7□□□□□ -1.34
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PTPRD-214ENST00000540109 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRD-214ENST00000540109 KIAA1524Q8TCG1 905 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRD-214ENST00000540109 ACSBG1Q96GR2 724 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRD-214ENST00000540109 Q9H521 79 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRD-214ENST00000540109 KIF9Q9HAQ2 790 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRD-214ENST00000540109 CBX8Q9HC52 389 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRD-214ENST00000540109 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
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PTPRD-214ENST00000540109 USP21Q9UK80 565 aa6.7□□□□□ -1.34
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PTPRD-214ENST00000540109 SBK1Q52WX2 424 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRD-214ENST00000540109 TCERG1LQ5VWI1 586 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRD-214ENST00000540109 FBXO33Q7Z6M2 555 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRD-214ENST00000540109 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRD-214ENST00000540109 RNF14Q9UBS8 474 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRD-214ENST00000540109 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa6.7□□□□□ -1.34
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PTPRD-214ENST00000540109 C4BP0C0L5 1744 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRD-214ENST00000540109 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRD-214ENST00000540109 ANTXR2P58335 489 aa6.69□□□□□ -1.34
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PTPRD-214ENST00000540109 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
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PTPRD-214ENST00000540109 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRD-214ENST00000540109 HIP1RO75146 1068 aa6.69□□□□□ -1.34
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PTPRD-214ENST00000540109 CHD4Q14839 1912 aa6.69□□□□□ -1.34
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PTPRD-214ENST00000540109 BAG3O95817 575 aa6.69□□□□□ -1.34
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PTPRD-214ENST00000540109 TAF6LQ9Y6J9 622 aa6.69□□□□□ -1.34
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PTPRD-214ENST00000540109 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRD-214ENST00000540109 MACROD2A1Z1Q3 448 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRD-214ENST00000540109 GSG1L2A8MUP6 293 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRD-214ENST00000540109 FOXP2O15409 715 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRD-214ENST00000540109 CCT2P78371 535 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
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PTPRD-214ENST00000540109 ERFEQ4G0M1 354 aa6.68□□□□□ -1.34
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PTPRD-214ENST00000540109 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa6.68□□□□□ -1.34
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PTPRD-214ENST00000540109 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRD-214ENST00000540109 HPS5Q9UPZ3 1129 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRD-214ENST00000540109 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRD-214ENST00000540109 RFC4P35249 363 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRD-214ENST00000540109 SLC39A14Q15043 492 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRD-214ENST00000540109 TBC1D10CQ8IV04 446 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRD-214ENST00000540109 C3orf20Q8ND61 904 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRD-214ENST00000540109 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRD-214ENST00000540109 C8orf37Q96NL8 207 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRD-214ENST00000540109 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRD-214ENST00000540109 LZTS2Q9BRK4 669 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRD-214ENST00000540109 CCDC68Q9H2F9 335 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRD-214ENST00000540109 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
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