RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525711.1

UBASH3B-202, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 4

Gene UBASH3B, Length 572 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-202ENST00000525711 STK11IPQ8N1F8 1099 aa16.93■□□□□ 0.3
UBASH3B-202ENST00000525711 KATNBL1Q9H079 304 aa16.93■□□□□ 0.3
UBASH3B-202ENST00000525711 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
UBASH3B-202ENST00000525711 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
UBASH3B-202ENST00000525711 LCTP09848 1927 aa16.93■□□□□ 0.3
UBASH3B-202ENST00000525711 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
UBASH3B-202ENST00000525711 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
UBASH3B-202ENST00000525711 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
UBASH3B-202ENST00000525711 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
UBASH3B-202ENST00000525711 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
UBASH3B-202ENST00000525711 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa16.92■□□□□ 0.3
UBASH3B-202ENST00000525711 UMODL1Q5DID0 1318 aa16.92■□□□□ 0.3
UBASH3B-202ENST00000525711 B4GALT4O60513 344 aa16.91■□□□□ 0.3
UBASH3B-202ENST00000525711 TTLL1O95922 423 aa16.91■□□□□ 0.3
UBASH3B-202ENST00000525711 PFKMP08237 780 aa16.91■□□□□ 0.3
UBASH3B-202ENST00000525711 STAT2P52630 851 aa16.91■□□□□ 0.3
UBASH3B-202ENST00000525711 RABGGTBP53611 331 aa16.91■□□□□ 0.3
UBASH3B-202ENST00000525711 CNTN2Q02246 1040 aa16.91■□□□□ 0.3
UBASH3B-202ENST00000525711 FAM133AQ8N9E0 248 aa16.91■□□□□ 0.3
UBASH3B-202ENST00000525711 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa16.91■□□□□ 0.3
UBASH3B-202ENST00000525711 MKL1Q969V6 931 aa16.91■□□□□ 0.3
UBASH3B-202ENST00000525711 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP16.91■□□□□ 0.3
UBASH3B-202ENST00000525711 ASTN1O14525 1302 aa16.91■□□□□ 0.3
UBASH3B-202ENST00000525711 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa16.9■□□□□ 0.3
UBASH3B-202ENST00000525711 BMP3P12645 472 aa16.9■□□□□ 0.3
UBASH3B-202ENST00000525711 BMP1P13497 986 aa16.9■□□□□ 0.3
UBASH3B-202ENST00000525711 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
UBASH3B-202ENST00000525711 IKQ13123 557 aaPredicted RBP16.9■□□□□ 0.3
UBASH3B-202ENST00000525711 TKFCQ3LXA3 575 aa16.9■□□□□ 0.3
UBASH3B-202ENST00000525711 CEP95Q96GE4 821 aa16.9■□□□□ 0.3
UBASH3B-202ENST00000525711 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP16.9■□□□□ 0.3
UBASH3B-202ENST00000525711 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
UBASH3B-202ENST00000525711 TRPV6Q9H1D0 765 aa16.9■□□□□ 0.3
UBASH3B-202ENST00000525711 WNT8AQ9H1J5 351 aa16.9■□□□□ 0.3
UBASH3B-202ENST00000525711 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
UBASH3B-202ENST00000525711 RNF146Q9NTX7 359 aa16.9■□□□□ 0.3
UBASH3B-202ENST00000525711 Q9Y3F1 56 aa16.9■□□□□ 0.3
UBASH3B-202ENST00000525711 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
UBASH3B-202ENST00000525711 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.29
UBASH3B-202ENST00000525711 GSG1L2A8MUP6 293 aa16.89■□□□□ 0.29
UBASH3B-202ENST00000525711 ERC2O15083 957 aa16.89■□□□□ 0.29
UBASH3B-202ENST00000525711 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.29
UBASH3B-202ENST00000525711 TDO2P48775 406 aa16.89■□□□□ 0.29
UBASH3B-202ENST00000525711 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.29
UBASH3B-202ENST00000525711 TFF2Q03403 129 aa16.89■□□□□ 0.29
UBASH3B-202ENST00000525711 TMEM67Q5HYA8 995 aa16.89■□□□□ 0.29
UBASH3B-202ENST00000525711 SLFN13Q68D06 897 aa16.89■□□□□ 0.29
UBASH3B-202ENST00000525711 IQSEC1Q6DN90 963 aa16.89■□□□□ 0.29
UBASH3B-202ENST00000525711 FAM160B2Q86V87 743 aa16.89■□□□□ 0.29
UBASH3B-202ENST00000525711 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.29
UBASH3B-202ENST00000525711 CHURC1Q8WUH1 139 aa16.89■□□□□ 0.29
UBASH3B-202ENST00000525711 MTMR4Q9NYA4 1195 aa16.89■□□□□ 0.29
UBASH3B-202ENST00000525711 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa16.89■□□□□ 0.29
UBASH3B-202ENST00000525711 TMEM232C9JQI7 657 aa16.88■□□□□ 0.29
UBASH3B-202ENST00000525711 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa16.88■□□□□ 0.29
UBASH3B-202ENST00000525711 ACTN1P12814 892 aa16.88■□□□□ 0.29
UBASH3B-202ENST00000525711 MYOGP15173 224 aa16.88■□□□□ 0.29
UBASH3B-202ENST00000525711 SMPD1P17405 629 aa16.88■□□□□ 0.29
UBASH3B-202ENST00000525711 GNAT2P19087 354 aa16.88■□□□□ 0.29
UBASH3B-202ENST00000525711 SCLYQ96I15 445 aa16.88■□□□□ 0.29
UBASH3B-202ENST00000525711 GRIN2DO15399 1336 aa16.88■□□□□ 0.29
UBASH3B-202ENST00000525711 PLIN4Q96Q06 1357 aa16.88■□□□□ 0.29
UBASH3B-202ENST00000525711 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
UBASH3B-202ENST00000525711 SOWAHBA6NEL2 793 aa16.87■□□□□ 0.29
UBASH3B-202ENST00000525711 PRDM1O75626 825 aa16.87■□□□□ 0.29
UBASH3B-202ENST00000525711 TSPY3P0CV98 308 aa16.87■□□□□ 0.29
UBASH3B-202ENST00000525711 TSPY8P0CW00 308 aa16.87■□□□□ 0.29
UBASH3B-202ENST00000525711 ALAS1P13196 640 aa16.87■□□□□ 0.29
UBASH3B-202ENST00000525711 KCNQ1P51787 676 aa16.87■□□□□ 0.29
UBASH3B-202ENST00000525711 PSMC6P62333 389 aa16.87■□□□□ 0.29
UBASH3B-202ENST00000525711 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
UBASH3B-202ENST00000525711 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
UBASH3B-202ENST00000525711 APPBP2Q92624 585 aa16.87■□□□□ 0.29
UBASH3B-202ENST00000525711 TRERF1Q96PN7 1200 aa16.87■□□□□ 0.29
UBASH3B-202ENST00000525711 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
UBASH3B-202ENST00000525711 DCTPP1Q9H773 170 aa16.87■□□□□ 0.29
UBASH3B-202ENST00000525711 VTA1Q9NP79 307 aa16.87■□□□□ 0.29
UBASH3B-202ENST00000525711 POLR3EQ9NVU0 708 aa16.87■□□□□ 0.29
UBASH3B-202ENST00000525711 COG5Q9UP83 839 aa16.87■□□□□ 0.29
UBASH3B-202ENST00000525711 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
UBASH3B-202ENST00000525711 PTPRSQ13332 1948 aa16.87■□□□□ 0.29
UBASH3B-202ENST00000525711 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa16.87■□□□□ 0.29
UBASH3B-202ENST00000525711 APPP05067 770 aa16.86■□□□□ 0.29
UBASH3B-202ENST00000525711 CA3P07451 260 aa16.86■□□□□ 0.29
UBASH3B-202ENST00000525711 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
UBASH3B-202ENST00000525711 PDE4BQ07343 736 aa16.86■□□□□ 0.29
UBASH3B-202ENST00000525711 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa16.86■□□□□ 0.29
UBASH3B-202ENST00000525711 EEPD1Q7L9B9 569 aa16.86■□□□□ 0.29
UBASH3B-202ENST00000525711 STAG1Q8WVM7 1258 aa16.86■□□□□ 0.29
UBASH3B-202ENST00000525711 AGBL1Q96MI9 1066 aa16.86■□□□□ 0.29
UBASH3B-202ENST00000525711 SLC9A7Q96T83 725 aa16.86■□□□□ 0.29
UBASH3B-202ENST00000525711 LRRCC1Q9C099 1032 aa16.86■□□□□ 0.29
UBASH3B-202ENST00000525711 MTCH2Q9Y6C9 303 aa16.86■□□□□ 0.29
UBASH3B-202ENST00000525711 GPAA1O43292 621 aa16.85■□□□□ 0.29
UBASH3B-202ENST00000525711 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
UBASH3B-202ENST00000525711 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
UBASH3B-202ENST00000525711 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
UBASH3B-202ENST00000525711 RFC2P35250 354 aa16.85■□□□□ 0.29
UBASH3B-202ENST00000525711 SLC1A4P43007 532 aa16.85■□□□□ 0.29
UBASH3B-202ENST00000525711 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms