RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517323.2

TRPS1-206, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5

Gene TRPS1, Length 2,171 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-206ENST00000517323 BRAPQ7Z569 592 aa17.77■□□□□ 0.44
TRPS1-206ENST00000517323 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.44
TRPS1-206ENST00000517323 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.44
TRPS1-206ENST00000517323 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
TRPS1-206ENST00000517323 C6orf50Q9HD87 102 aa17.77■□□□□ 0.44
TRPS1-206ENST00000517323 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa17.77■□□□□ 0.44
TRPS1-206ENST00000517323 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 DSG3P32926 999 aa17.77■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 COG2Q14746 738 aa17.77■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 SPATA32Q96LK8 384 aa17.77■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 ZIC5Q96T25 663 aa17.77■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 MEIS2O14770 477 aa17.76■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 PLA2G6O60733 806 aa17.76■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 CFBP00751 764 aa17.76■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 CALML3P27482 149 aa17.76■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 UBXN2AP68543 259 aa17.76■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 ZNF174Q15697 407 aa17.76■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 BRI3BPQ8WY22 251 aa17.76■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 PAGR1Q9BTK6 254 aa17.76■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 BRMS1Q9HCU9 246 aa17.76■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 CXCL11O14625 94 aa17.76■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 ICAM1P05362 532 aa17.76■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 SNAPC2Q13487 334 aa17.76■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 SPRYD7Q5W111 196 aa17.76■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 FCHSD1Q86WN1 690 aa17.76■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 REPS2Q8NFH8 660 aa17.76■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 PTPN18Q99952 460 aa17.76■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 RIC8AQ9NPQ8 531 aa17.76■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 BTBD7Q9P203 1132 aa17.76■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa17.75■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 EDIL3O43854 480 aa17.75■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 FKBP1BP68106 108 aa17.75■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 CCL15Q16663 113 aa17.75■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 SMC1BQ8NDV3 1235 aa17.75■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 CUL5Q93034 780 aa17.75■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 TXNRD2Q9NNW7 524 aa17.75■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa17.74■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 GNA11P29992 359 aa17.74■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 GRIN1Q05586 938 aa17.74■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 ANO1Q5XXA6 986 aa17.74■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 FAM43AQ8N2R8 423 aa17.74■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 DAGLBQ8NCG7 672 aa17.74■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 GPT2Q8TD30 523 aa17.74■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 TBCKQ8TEA7 893 aa17.74■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa17.74■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 BTBD19C9JJ37 291 aa17.74■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 MCM7P33993 719 aa17.74■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP17.74■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 HTRA3P83110 453 aa17.74■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 RASAL3Q86YV0 1011 aa17.74■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP17.74■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 CLEC4DQ8WXI8 215 aa17.74■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 GJA10Q969M2 543 aa17.74■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP17.74■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 ESYT2A0FGR8 921 aa17.73■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 ZBED4O75132 1171 aa17.73■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 CLK2P49760 499 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 LINC00301Q8NCQ3 95 aa17.73■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 CLIC6Q96NY7 704 aa17.73■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa17.73■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 HTTP42858 3142 aa17.73■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 TOMM70O94826 608 aa17.73■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 PTPAQ15257 358 aa17.73■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 LETM2Q2VYF4 491 aa17.73■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 SPECC1Q5M775 1068 aa17.73■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 RTEL1Q9NZ71 1219 aa17.73■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 COL20A1Q9P218 1284 aa17.73■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 hCG_1984214I3L0E3 225 aa17.72■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 PDHXO00330 501 aa17.72■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 HERVK_113P62684 666 aa17.72■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 STK38Q15208 465 aa17.72■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 TTC38Q5R3I4 469 aa17.72■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 TRERF1Q96PN7 1200 aa17.72■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 Q3C1V9 767 aa17.72■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 PPP1R18Q6NYC8 613 aa17.72■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 SLC30A10Q6XR72 485 aa17.72■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 POLR3EQ9NVU0 708 aa17.72■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 CFAP45Q9UL16 551 aa17.72■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 A0A0G2JMZ2 1700 aa17.71■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 CNMDO75829 334 aa17.71■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 TDP2O95551 362 aa17.71■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 ME1P48163 572 aa17.71■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP17.71■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 RILPL1Q5EBL4 403 aa17.71■□□□□ 0.43
TRPS1-206ENST00000517323 RGMBQ6NW40 437 aa17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.2 ms