RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516224.1

RNU6-311P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 311, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-311P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-311P-201ENST00000516224 EEPD1Q7L9B9 569 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-311P-201ENST00000516224 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-311P-201ENST00000516224 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
RNU6-311P-201ENST00000516224 COPS5Q92905 334 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-311P-201ENST00000516224 PPP1R14AQ96A00 147 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-311P-201ENST00000516224 KCNK12Q9HB15 430 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-311P-201ENST00000516224 IMPACTQ9P2X3 320 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-311P-201ENST00000516224 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
RNU6-311P-201ENST00000516224 CAPNS1P04632 268 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-311P-201ENST00000516224 PNLIPP16233 465 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-311P-201ENST00000516224 CKAP2LQ8IYA6 745 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-311P-201ENST00000516224 BTN2A2Q8WVV5 523 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-311P-201ENST00000516224 ARMC5Q96C12 935 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-311P-201ENST00000516224 EPN3Q9H201 632 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-311P-201ENST00000516224 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-311P-201ENST00000516224 TBC1D8O95759 1140 aa7.35□□□□□ -1.23
RNU6-311P-201ENST00000516224 MSL3P1P0C860 447 aa7.35□□□□□ -1.23
RNU6-311P-201ENST00000516224 PRKCAP17252 672 aa7.35□□□□□ -1.23
RNU6-311P-201ENST00000516224 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.23
RNU6-311P-201ENST00000516224 SEPHS1P49903 392 aa7.35□□□□□ -1.23
RNU6-311P-201ENST00000516224 MVKQ03426 396 aa7.35□□□□□ -1.23
RNU6-311P-201ENST00000516224 SCRN1Q12765 414 aa7.35□□□□□ -1.23
RNU6-311P-201ENST00000516224 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
RNU6-311P-201ENST00000516224 NUP43Q8NFH3 380 aa7.35□□□□□ -1.23
RNU6-311P-201ENST00000516224 EPB41L4BQ9H329 900 aa7.35□□□□□ -1.23
RNU6-311P-201ENST00000516224 CYP26B1Q9NR63 512 aa7.35□□□□□ -1.23
RNU6-311P-201ENST00000516224 MSRB2Q9Y3D2 182 aa7.35□□□□□ -1.23
RNU6-311P-201ENST00000516224 ERVFRD-1P60508 538 aa7.34□□□□□ -1.23
RNU6-311P-201ENST00000516224 RBL2Q08999 1139 aa7.34□□□□□ -1.23
RNU6-311P-201ENST00000516224 NBPF6Q5VWK0 638 aa7.34□□□□□ -1.23
RNU6-311P-201ENST00000516224 JAMLQ86YT9 394 aa7.34□□□□□ -1.23
RNU6-311P-201ENST00000516224 KSR1Q8IVT5 923 aa7.34□□□□□ -1.23
RNU6-311P-201ENST00000516224 FAM84AQ96KN4 292 aa7.34□□□□□ -1.23
RNU6-311P-201ENST00000516224 NBPF4Q96M43 638 aa7.34□□□□□ -1.23
RNU6-311P-201ENST00000516224 TRIM55Q9BYV6 548 aa7.34□□□□□ -1.23
RNU6-311P-201ENST00000516224 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
RNU6-311P-201ENST00000516224 LRP2BPQ9P2M1 347 aa7.34□□□□□ -1.23
RNU6-311P-201ENST00000516224 SDHBP21912 280 aa7.33□□□□□ -1.24
RNU6-311P-201ENST00000516224 PDE6BP35913 854 aa7.33□□□□□ -1.24
RNU6-311P-201ENST00000516224 CYP4F8P98187 520 aa7.33□□□□□ -1.24
RNU6-311P-201ENST00000516224 LAPTM5Q13571 262 aa7.33□□□□□ -1.24
RNU6-311P-201ENST00000516224 ADGRF1Q5T601 910 aa7.33□□□□□ -1.24
RNU6-311P-201ENST00000516224 CPNE8Q86YQ8 564 aa7.33□□□□□ -1.24
RNU6-311P-201ENST00000516224 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
RNU6-311P-201ENST00000516224 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
RNU6-311P-201ENST00000516224 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa7.33□□□□□ -1.24
RNU6-311P-201ENST00000516224 GPRC5CQ9NQ84 441 aa7.33□□□□□ -1.24
RNU6-311P-201ENST00000516224 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-311P-201ENST00000516224 A0A1W2PQU0 124 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-311P-201ENST00000516224 OR14I1A6ND48 311 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-311P-201ENST00000516224 THBDP07204 575 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-311P-201ENST00000516224 C8AP07357 584 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-311P-201ENST00000516224 PLS3P13797 630 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-311P-201ENST00000516224 PAMP19021 973 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-311P-201ENST00000516224 L1CAMP32004 1257 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-311P-201ENST00000516224 CORO7P57737 925 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-311P-201ENST00000516224 MBLAC2Q68D91 279 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-311P-201ENST00000516224 ZNF605Q86T29 641 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-311P-201ENST00000516224 NLGN2Q8NFZ4 835 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-311P-201ENST00000516224 NPLOC4Q8TAT6 608 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-311P-201ENST00000516224 FRS2Q8WU20 508 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-311P-201ENST00000516224 CLEC1BQ9P126 229 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-311P-201ENST00000516224 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa7.31□□□□□ -1.24
RNU6-311P-201ENST00000516224 KRT1P04264 644 aa7.31□□□□□ -1.24
RNU6-311P-201ENST00000516224 SCG5P05408 212 aa7.31□□□□□ -1.24
RNU6-311P-201ENST00000516224 HOXC12P31275 282 aa7.31□□□□□ -1.24
RNU6-311P-201ENST00000516224 PPP2R2AP63151 447 aa7.31□□□□□ -1.24
RNU6-311P-201ENST00000516224 SERINC3Q13530 473 aa7.31□□□□□ -1.24
RNU6-311P-201ENST00000516224 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
RNU6-311P-201ENST00000516224 SF1Q15637 639 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
RNU6-311P-201ENST00000516224 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
RNU6-311P-201ENST00000516224 MMP19Q99542 508 aa7.31□□□□□ -1.24
RNU6-311P-201ENST00000516224 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
RNU6-311P-201ENST00000516224 MCOLN1Q9GZU1 580 aa7.31□□□□□ -1.24
RNU6-311P-201ENST00000516224 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-311P-201ENST00000516224 ARNTLO00327 626 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-311P-201ENST00000516224 PEX10O60683 326 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-311P-201ENST00000516224 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
RNU6-311P-201ENST00000516224 ARL4AP40617 200 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-311P-201ENST00000516224 GRIA2P42262 883 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-311P-201ENST00000516224 GFRA1P56159 465 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-311P-201ENST00000516224 YBX1P67809 324 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
RNU6-311P-201ENST00000516224 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
RNU6-311P-201ENST00000516224 KREMEN2Q8NCW0 462 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-311P-201ENST00000516224 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-311P-201ENST00000516224 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-311P-201ENST00000516224 PDLIM7Q9NR12 457 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-311P-201ENST00000516224 FBLN5Q9UBX5 448 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-311P-201ENST00000516224 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
RNU6-311P-201ENST00000516224 A0A1W2PQ27 194 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-311P-201ENST00000516224 A0A1W2PQ64 194 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-311P-201ENST00000516224 A0A1W2PQC6 194 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-311P-201ENST00000516224 A0A1W2PQD8 194 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-311P-201ENST00000516224 C7orf72A4D263 438 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-311P-201ENST00000516224 HRKO00198 91 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-311P-201ENST00000516224 AGRPO00253 132 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-311P-201ENST00000516224 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RNU6-311P-201ENST00000516224 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RNU6-311P-201ENST00000516224 TACR1P25103 407 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-311P-201ENST00000516224 PRSS53Q2L4Q9 553 aa7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms