RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498648.5

STRADB-210, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta, humanhuman

TSL 3

Gene STRADB, Length 535 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADB-210ENST00000498648 KLF15Q9UIH9 416 aa6.03□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 DMTF1Q9Y222 760 aa6.03□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa6.03□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa6.03□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
STRADB-210ENST00000498648 LDHCP07864 332 aa6.02□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 HSPA6P17066 643 aa6.02□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 HOXC12P31275 282 aa6.02□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 ECE1P42892 770 aa6.02□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 USP14P54578 494 aa6.02□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 OCRLQ01968 901 aa6.02□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 C19orf57Q0VDD7 668 aa6.02□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 SCARF1Q14162 830 aa6.02□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 LHX8Q68G74 356 aa6.02□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa6.02□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa6.02□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 SRLQ86TD4 932 aa6.02□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa6.02□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 ZNF354CQ86Y25 554 aa6.02□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 FAM186BQ8IYM0 893 aa6.02□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa6.02□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 TMEM145Q8NBT3 493 aa6.02□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 CLRN3Q8NCR9 226 aa6.02□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 CCDC140Q96MF4 163 aa6.02□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 SPTLC3Q9NUV7 552 aa6.02□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 FRRS1LQ9P0K9 344 aa6.02□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 SLC6A14Q9UN76 642 aa6.02□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa6.02□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 PRRT4C9JH25 899 aa6.01□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 TRAF5O00463 557 aa6.01□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 PCDHGA12O60330 932 aa6.01□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 SIN3BO75182 1162 aa6.01□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 KCNH1O95259 989 aa6.01□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 IL33O95760 270 aa6.01□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 APPP05067 770 aa6.01□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 SCG5P05408 212 aa6.01□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 SETSIPP0DME0 302 aa6.01□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 ITGA4P13612 1032 aa6.01□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 NAT1P18440 290 aa6.01□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 RHCEP18577 417 aa6.01□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 FGFR3P22607 806 aa6.01□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 AK2P54819 239 aa6.01□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 SESN3P58005 492 aa6.01□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 PIP4K2BP78356 416 aa6.01□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 HTRA3P83110 453 aa6.01□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 RHDQ02161 417 aa6.01□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 DBN1Q16643 649 aa6.01□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP6.01□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 PPM1JQ5JR12 505 aa6.01□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 ZBTB37Q5TC79 503 aa6.01□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 ZNF280DQ6N043 979 aa6.01□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 PGM2L1Q6PCE3 622 aa6.01□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 SYT9Q86SS6 491 aa6.01□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 C11orf74Q86VG3 221 aa6.01□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 C7orf61Q8IZ16 206 aa6.01□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 STK11IPQ8N1F8 1099 aa6.01□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 ADCY4Q8NFM4 1077 aa6.01□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 DCAF4Q8WV16 495 aa6.01□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 CHTF18Q8WVB6 975 aa6.01□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 BRF1Q92994 677 aa6.01□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 TNFRSF25Q93038 417 aa6.01□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 WNT8BQ93098 351 aa6.01□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 MYD88Q99836 296 aa6.01□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 SELENOOQ9BVL4 669 aa6.01□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa6.01□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 GP6Q9HCN6 339 aa6.01□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 C14orf119Q9NWQ9 140 aa6.01□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 MKS1Q9NXB0 559 aa6.01□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 B4GALT6Q9UBX8 382 aa6.01□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 DNM3Q9UQ16 869 aa6.01□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa6.01□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa6.01□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa6.01□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa6.01□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa6.01□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 TRIM75PA6NK02 468 aa6□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 WDR64B1ANS9 1081 aa6□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 FANCGO15287 622 aa6□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP6□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 CASP2P42575 452 aa6□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 KCNJ6P48051 423 aa6□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 ARL4DP49703 201 aa6□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 ERVK-24P63145 666 aa6□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 GUCY1A3Q02108 690 aa6□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 PRSS53Q2L4Q9 553 aa6□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
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