RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498454.1

TTYH3-207, Transcript of tweety family member 3, humanhuman

TSL 2

Gene TTYH3, Length 587 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTYH3-207ENST00000498454 FDPSP14324 419 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
TTYH3-207ENST00000498454 ERCC3P19447 782 aa24.43■■□□□ 1.5
TTYH3-207ENST00000498454 WWC2Q6AWC2 1192 aa24.43■■□□□ 1.5
TTYH3-207ENST00000498454 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa24.43■■□□□ 1.5
TTYH3-207ENST00000498454 DDX11Q96FC9 970 aa24.43■■□□□ 1.5
TTYH3-207ENST00000498454 EFCC1Q9HA90 598 aa24.43■■□□□ 1.5
TTYH3-207ENST00000498454 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa24.43■■□□□ 1.5
TTYH3-207ENST00000498454 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
TTYH3-207ENST00000498454 CHST13Q8NET6 341 aa24.42■■□□□ 1.5
TTYH3-207ENST00000498454 TRERF1Q96PN7 1200 aa24.42■■□□□ 1.5
TTYH3-207ENST00000498454 MROH8Q9H579 483 aa24.42■■□□□ 1.5
TTYH3-207ENST00000498454 HOMER2Q9NSB8 354 aa24.42■■□□□ 1.5
TTYH3-207ENST00000498454 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa24.42■■□□□ 1.5
TTYH3-207ENST00000498454 PLXNB2O15031 1838 aa24.41■■□□□ 1.5
TTYH3-207ENST00000498454 hCG_1984214I3L0E3 225 aa24.41■■□□□ 1.5
TTYH3-207ENST00000498454 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
TTYH3-207ENST00000498454 MAPK4P31152 587 aa24.41■■□□□ 1.5
TTYH3-207ENST00000498454 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
TTYH3-207ENST00000498454 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
TTYH3-207ENST00000498454 MUM1L1Q5H9M0 696 aa24.41■■□□□ 1.5
TTYH3-207ENST00000498454 WDR78Q5VTH9 848 aa24.41■■□□□ 1.5
TTYH3-207ENST00000498454 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
TTYH3-207ENST00000498454 FBXO40Q9UH90 709 aa24.41■■□□□ 1.5
TTYH3-207ENST00000498454 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
TTYH3-207ENST00000498454 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
TTYH3-207ENST00000498454 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
TTYH3-207ENST00000498454 FKTNO75072 461 aa24.4■■□□□ 1.5
TTYH3-207ENST00000498454 BECN1Q14457 450 aa24.4■■□□□ 1.5
TTYH3-207ENST00000498454 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
TTYH3-207ENST00000498454 CLEC4DQ8WXI8 215 aa24.4■■□□□ 1.5
TTYH3-207ENST00000498454 WASF1Q92558 559 aa24.4■■□□□ 1.5
TTYH3-207ENST00000498454 AIFM3Q96NN9 605 aa24.4■■□□□ 1.5
TTYH3-207ENST00000498454 ACAD9Q9H845 621 aa24.4■■□□□ 1.5
TTYH3-207ENST00000498454 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
TTYH3-207ENST00000498454 BARHL2Q9NY43 387 aa24.4■■□□□ 1.5
TTYH3-207ENST00000498454 DOCK3Q8IZD9 2030 aa24.4■■□□□ 1.5
TTYH3-207ENST00000498454 STXBP3O00186 592 aa24.39■■□□□ 1.49
TTYH3-207ENST00000498454 CTGFP29279 349 aa24.39■■□□□ 1.49
TTYH3-207ENST00000498454 TYW1BQ6NUM6 668 aa24.39■■□□□ 1.49
TTYH3-207ENST00000498454 SMC3Q9UQE7 1217 aa24.39■■□□□ 1.49
TTYH3-207ENST00000498454 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
TTYH3-207ENST00000498454 NFIBO00712 420 aa24.38■■□□□ 1.49
TTYH3-207ENST00000498454 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
TTYH3-207ENST00000498454 NAPAP54920 295 aa24.38■■□□□ 1.49
TTYH3-207ENST00000498454 KIF22Q14807 665 aa24.38■■□□□ 1.49
TTYH3-207ENST00000498454 PPP1R18Q6NYC8 613 aa24.38■■□□□ 1.49
TTYH3-207ENST00000498454 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP24.38■■□□□ 1.49
TTYH3-207ENST00000498454 GPR142Q7Z601 462 aa24.38■■□□□ 1.49
TTYH3-207ENST00000498454 PLEKHH3Q7Z736 793 aa24.38■■□□□ 1.49
TTYH3-207ENST00000498454 CD99L2Q8TCZ2 262 aa24.38■■□□□ 1.49
TTYH3-207ENST00000498454 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
TTYH3-207ENST00000498454 ALG1Q9BT22 464 aa24.38■■□□□ 1.49
TTYH3-207ENST00000498454 VPS54Q9P1Q0 977 aa24.38■■□□□ 1.49
TTYH3-207ENST00000498454 OPLAHO14841 1288 aa24.37■■□□□ 1.49
TTYH3-207ENST00000498454 PSMC4P43686 418 aa24.37■■□□□ 1.49
TTYH3-207ENST00000498454 FCGRTP55899 365 aa24.37■■□□□ 1.49
TTYH3-207ENST00000498454 FAM184AQ8NB25 1140 aa24.37■■□□□ 1.49
TTYH3-207ENST00000498454 SHISA4Q96DD7 197 aa24.37■■□□□ 1.49
TTYH3-207ENST00000498454 ERO1AQ96HE7 468 aa24.37■■□□□ 1.49
TTYH3-207ENST00000498454 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa24.37■■□□□ 1.49
TTYH3-207ENST00000498454 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
TTYH3-207ENST00000498454 PTPREP23469 700 aa24.36■■□□□ 1.49
TTYH3-207ENST00000498454 GJB2P29033 226 aa24.36■■□□□ 1.49
TTYH3-207ENST00000498454 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
TTYH3-207ENST00000498454 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
TTYH3-207ENST00000498454 TRIM47Q96LD4 638 aa24.36■■□□□ 1.49
TTYH3-207ENST00000498454 MMP19Q99542 508 aa24.36■■□□□ 1.49
TTYH3-207ENST00000498454 SH3GLB2Q9NR46 395 aa24.36■■□□□ 1.49
TTYH3-207ENST00000498454 FOXD4L1Q9NU39 408 aa24.36■■□□□ 1.49
TTYH3-207ENST00000498454 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa24.36■■□□□ 1.49
TTYH3-207ENST00000498454 FCER1AP12319 257 aa24.35■■□□□ 1.49
TTYH3-207ENST00000498454 LBX1P52954 281 aa24.35■■□□□ 1.49
TTYH3-207ENST00000498454 CAP1Q01518 475 aa24.35■■□□□ 1.49
TTYH3-207ENST00000498454 KCTD2Q14681 263 aa24.35■■□□□ 1.49
TTYH3-207ENST00000498454 NSMFQ6X4W1 530 aa24.35■■□□□ 1.49
TTYH3-207ENST00000498454 MCF2L2Q86YR7 1114 aa24.35■■□□□ 1.49
TTYH3-207ENST00000498454 CCDC148Q8NFR7 591 aa24.35■■□□□ 1.49
TTYH3-207ENST00000498454 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
TTYH3-207ENST00000498454 TBC1D5Q92609 795 aa24.35■■□□□ 1.49
TTYH3-207ENST00000498454 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
TTYH3-207ENST00000498454 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
TTYH3-207ENST00000498454 ZNF236Q9UL36 1845 aa24.35■■□□□ 1.49
TTYH3-207ENST00000498454 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa24.34■■□□□ 1.49
TTYH3-207ENST00000498454 STRNO43815 780 aa24.34■■□□□ 1.49
TTYH3-207ENST00000498454 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
TTYH3-207ENST00000498454 ANKRD35Q8N283 1001 aa24.34■■□□□ 1.49
TTYH3-207ENST00000498454 RGS22Q8NE09 1264 aa24.34■■□□□ 1.49
TTYH3-207ENST00000498454 PRDM10Q9NQV6 1147 aa24.34■■□□□ 1.49
TTYH3-207ENST00000498454 GJB4Q9NTQ9 266 aa24.34■■□□□ 1.49
TTYH3-207ENST00000498454 KIF3AQ9Y496 699 aa24.34■■□□□ 1.49
TTYH3-207ENST00000498454 ESYT2A0FGR8 921 aa24.33■■□□□ 1.49
TTYH3-207ENST00000498454 SMCO2A6NFE2 343 aa24.33■■□□□ 1.49
TTYH3-207ENST00000498454 SLC15A5A6NIM6 579 aa24.33■■□□□ 1.49
TTYH3-207ENST00000498454 CFBP00751 764 aa24.33■■□□□ 1.49
TTYH3-207ENST00000498454 XBP1P17861 261 aa24.33■■□□□ 1.49
TTYH3-207ENST00000498454 FOSBP53539 338 aa24.33■■□□□ 1.49
TTYH3-207ENST00000498454 GHRHRQ02643 423 aa24.33■■□□□ 1.49
TTYH3-207ENST00000498454 GRB14Q14449 540 aa24.33■■□□□ 1.49
TTYH3-207ENST00000498454 RNF207Q6ZRF8 634 aa24.33■■□□□ 1.49
TTYH3-207ENST00000498454 ABRAQ8N0Z2 381 aa24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.3 ms