RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498007.1

HLA-B-255, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

Gene HLA-B, Length 1,087 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-255ENST00000498007 LZTS2Q9BRK4 669 aa22.98■■□□□ 1.27
HLA-B-255ENST00000498007 AGXT2Q9BYV1 514 aa22.98■■□□□ 1.27
HLA-B-255ENST00000498007 RIOX1Q9H6W3 641 aa22.98■■□□□ 1.27
HLA-B-255ENST00000498007 SLC5A4Q9NY91 659 aa22.98■■□□□ 1.27
HLA-B-255ENST00000498007 NFIBO00712 420 aa22.97■■□□□ 1.27
HLA-B-255ENST00000498007 ZBTB5O15062 677 aa22.97■■□□□ 1.27
HLA-B-255ENST00000498007 HOXC6P09630 235 aa22.97■■□□□ 1.27
HLA-B-255ENST00000498007 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP22.97■■□□□ 1.27
HLA-B-255ENST00000498007 UBXN2AP68543 259 aa22.97■■□□□ 1.27
HLA-B-255ENST00000498007 TRIM32Q13049 653 aa22.97■■□□□ 1.27
HLA-B-255ENST00000498007 NSMFQ6X4W1 530 aa22.97■■□□□ 1.27
HLA-B-255ENST00000498007 TMTC3Q6ZXV5 915 aa22.97■■□□□ 1.27
HLA-B-255ENST00000498007 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
HLA-B-255ENST00000498007 CCDC82Q8N4S0 544 aa22.97■■□□□ 1.27
HLA-B-255ENST00000498007 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
HLA-B-255ENST00000498007 MTMR8Q96EF0 704 aa22.97■■□□□ 1.27
HLA-B-255ENST00000498007 SPZ1Q9BXG8 430 aa22.97■■□□□ 1.27
HLA-B-255ENST00000498007 C22orf23Q9BZE7 217 aa22.97■■□□□ 1.27
HLA-B-255ENST00000498007 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
HLA-B-255ENST00000498007 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
HLA-B-255ENST00000498007 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
HLA-B-255ENST00000498007 FLRT1Q9NZU1 646 aa22.97■■□□□ 1.27
HLA-B-255ENST00000498007 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
HLA-B-255ENST00000498007 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP22.96■■□□□ 1.27
HLA-B-255ENST00000498007 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
HLA-B-255ENST00000498007 AMNQ9BXJ7 453 aa22.96■■□□□ 1.27
HLA-B-255ENST00000498007 PFASO15067 1338 aa22.96■■□□□ 1.27
HLA-B-255ENST00000498007 ABCB11O95342 1321 aa22.96■■□□□ 1.27
HLA-B-255ENST00000498007 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
HLA-B-255ENST00000498007 CAPN15O75808 1086 aa22.95■■□□□ 1.26
HLA-B-255ENST00000498007 RCAN1P53805 252 aa22.95■■□□□ 1.26
HLA-B-255ENST00000498007 CLEC4DQ8WXI8 215 aa22.95■■□□□ 1.26
HLA-B-255ENST00000498007 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
HLA-B-255ENST00000498007 IL17RAQ96F46 866 aa22.95■■□□□ 1.26
HLA-B-255ENST00000498007 MAML3Q96JK9 1138 aa22.95■■□□□ 1.26
HLA-B-255ENST00000498007 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
HLA-B-255ENST00000498007 LCTP09848 1927 aa22.94■■□□□ 1.26
HLA-B-255ENST00000498007 BRCA2P51587 3418 aa22.94■■□□□ 1.26
HLA-B-255ENST00000498007 PTPDC1A2A3K4 754 aa22.94■■□□□ 1.26
HLA-B-255ENST00000498007 MTFR1Q15390 333 aa22.94■■□□□ 1.26
HLA-B-255ENST00000498007 ZNF792Q3KQV3 632 aa22.94■■□□□ 1.26
HLA-B-255ENST00000498007 CYP39A1Q9NYL5 469 aa22.94■■□□□ 1.26
HLA-B-255ENST00000498007 NID2Q14112 1375 aa22.93■■□□□ 1.26
HLA-B-255ENST00000498007 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa22.93■■□□□ 1.26
HLA-B-255ENST00000498007 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa22.93■■□□□ 1.26
HLA-B-255ENST00000498007 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa22.93■■□□□ 1.26
HLA-B-255ENST00000498007 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa22.93■■□□□ 1.26
HLA-B-255ENST00000498007 POTEB2H3BUK9 544 aa22.93■■□□□ 1.26
HLA-B-255ENST00000498007 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
HLA-B-255ENST00000498007 SMARCA1P28370 1054 aa22.93■■□□□ 1.26
HLA-B-255ENST00000498007 CDC27P30260 824 aa22.93■■□□□ 1.26
HLA-B-255ENST00000498007 MFSD14CQ5VZR4 134 aa22.93■■□□□ 1.26
HLA-B-255ENST00000498007 SLC30A10Q6XR72 485 aa22.93■■□□□ 1.26
HLA-B-255ENST00000498007 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa22.93■■□□□ 1.26
HLA-B-255ENST00000498007 CCL5P13501 91 aa22.92■■□□□ 1.26
HLA-B-255ENST00000498007 CALML3P27482 149 aa22.92■■□□□ 1.26
HLA-B-255ENST00000498007 CYP2C19P33261 490 aa22.92■■□□□ 1.26
HLA-B-255ENST00000498007 NEK4P51957 841 aa22.92■■□□□ 1.26
HLA-B-255ENST00000498007 CNTN2Q02246 1040 aa22.92■■□□□ 1.26
HLA-B-255ENST00000498007 OLFML2BQ68BL8 750 aa22.92■■□□□ 1.26
HLA-B-255ENST00000498007 RNF207Q6ZRF8 634 aa22.92■■□□□ 1.26
HLA-B-255ENST00000498007 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
HLA-B-255ENST00000498007 UNC93B1Q9H1C4 597 aa22.92■■□□□ 1.26
HLA-B-255ENST00000498007 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
HLA-B-255ENST00000498007 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
HLA-B-255ENST00000498007 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
HLA-B-255ENST00000498007 ADD1P35611 737 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
HLA-B-255ENST00000498007 AK2P54819 239 aa22.91■■□□□ 1.26
HLA-B-255ENST00000498007 SOX10P56693 466 aa22.91■■□□□ 1.26
HLA-B-255ENST00000498007 EVCP57679 992 aa22.91■■□□□ 1.26
HLA-B-255ENST00000498007 CCT2P78371 535 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
HLA-B-255ENST00000498007 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
HLA-B-255ENST00000498007 STK3Q13188 491 aa22.91■■□□□ 1.26
HLA-B-255ENST00000498007 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
HLA-B-255ENST00000498007 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
HLA-B-255ENST00000498007 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa22.9■■□□□ 1.26
HLA-B-255ENST00000498007 RBM25P49756 843 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
HLA-B-255ENST00000498007 TRAF1Q13077 416 aa22.9■■□□□ 1.26
HLA-B-255ENST00000498007 FAM133AQ8N9E0 248 aa22.9■■□□□ 1.26
HLA-B-255ENST00000498007 FGD4Q96M96 766 aa22.9■■□□□ 1.26
HLA-B-255ENST00000498007 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
HLA-B-255ENST00000498007 TMEM106CQ9BVX2 250 aa22.9■■□□□ 1.26
HLA-B-255ENST00000498007 RNF208Q9H0X6 261 aa22.9■■□□□ 1.26
HLA-B-255ENST00000498007 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
HLA-B-255ENST00000498007 RPS6P62753 249 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
HLA-B-255ENST00000498007 PPP2R5BQ15173 497 aa22.89■■□□□ 1.25
HLA-B-255ENST00000498007 ANKRD1Q15327 319 aa22.89■■□□□ 1.25
HLA-B-255ENST00000498007 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa22.89■■□□□ 1.25
HLA-B-255ENST00000498007 TINF2Q9BSI4 451 aa22.89■■□□□ 1.25
HLA-B-255ENST00000498007 SOWAHBA6NEL2 793 aa22.88■■□□□ 1.25
HLA-B-255ENST00000498007 FUT2Q10981 343 aa22.88■■□□□ 1.25
HLA-B-255ENST00000498007 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa22.88■■□□□ 1.25
HLA-B-255ENST00000498007 MCF2L2Q86YR7 1114 aa22.88■■□□□ 1.25
HLA-B-255ENST00000498007 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
HLA-B-255ENST00000498007 BACH2Q9BYV9 841 aa22.88■■□□□ 1.25
HLA-B-255ENST00000498007 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP22.88■■□□□ 1.25
HLA-B-255ENST00000498007 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
HLA-B-255ENST00000498007 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
HLA-B-255ENST00000498007 LRRC37A2A6NM11 1700 aa22.88■■□□□ 1.25
HLA-B-255ENST00000498007 RPTORQ8N122 1335 aa22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.4 ms