RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496253.1

MFSD9-208, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 9, human

TSL 2

Gene MFSD9, Length 347 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MFSD9-208	ENST00000496253	GBF1	Q92538	1859 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MFSD9-208	ENST00000496253	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MFSD9-208	ENST00000496253		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MFSD9-208	ENST00000496253	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MFSD9-208	ENST00000496253	SOWAHB	A6NEL2	793 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MFSD9-208	ENST00000496253	ASB14	A6NK59	587 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MFSD9-208	ENST00000496253	HIP1	O00291	1037 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MFSD9-208	ENST00000496253	ATP2A1	O14983	1001 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MFSD9-208	ENST00000496253	SORBS3	O60504	671 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MFSD9-208	ENST00000496253	ICAM1	P05362	532 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MFSD9-208	ENST00000496253	ASGR1	P07306	291 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MFSD9-208	ENST00000496253	MYL3	P08590	195 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MFSD9-208	ENST00000496253	PDHB	P11177	359 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MFSD9-208	ENST00000496253	BMP8B	P34820	402 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MFSD9-208	ENST00000496253	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MFSD9-208	ENST00000496253	PSMC6	P62333	389 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MFSD9-208	ENST00000496253	TNFAIP2	Q03169	654 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MFSD9-208	ENST00000496253	FPGS	Q05932	587 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MFSD9-208	ENST00000496253	PDE4D	Q08499	809 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MFSD9-208	ENST00000496253	SHH	Q15465	462 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MFSD9-208	ENST00000496253	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MFSD9-208	ENST00000496253	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MFSD9-208	ENST00000496253	TKFC	Q3LXA3	575 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MFSD9-208	ENST00000496253	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MFSD9-208	ENST00000496253	GNAS	Q5JWF2	1037 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MFSD9-208	ENST00000496253	ZNF697	Q5TEC3	545 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MFSD9-208	ENST00000496253	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MFSD9-208	ENST00000496253	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MFSD9-208	ENST00000496253	IQCA1	Q86XH1	822 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MFSD9-208	ENST00000496253	HOMER1	Q86YM7	354 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MFSD9-208	ENST00000496253	PNMA1	Q8ND90	353 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MFSD9-208	ENST00000496253	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MFSD9-208	ENST00000496253	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MFSD9-208	ENST00000496253	FGD4	Q96M96	766 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MFSD9-208	ENST00000496253	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MFSD9-208	ENST00000496253	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MFSD9-208	ENST00000496253	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MFSD9-208	ENST00000496253	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MFSD9-208	ENST00000496253	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MFSD9-208	ENST00000496253	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MFSD9-208	ENST00000496253	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MFSD9-208	ENST00000496253	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MFSD9-208	ENST00000496253	ASTN1	O14525	1302 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MFSD9-208	ENST00000496253	TNKS	O95271	1327 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MFSD9-208	ENST00000496253	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MFSD9-208	ENST00000496253	MOXD2P	A6NHM9	499 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	DUSP11	O75319	330 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	IGHA2	P01877	340 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	FDX1	P10109	184 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	ACR	P10323	421 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	SMPD1	P17405	629 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	ITGB8	P26012	769 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	PDE4A	P27815	886 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	ZNF543	Q08ER8	600 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	TRDN	Q13061	729 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	AAMP	Q13685	434 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	SNX17	Q15036	470 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	PPP2R5B	Q15173	497 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	ALX1	Q15699	326 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	LRIT3	Q3SXY7	679 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	TTC22	Q5TAA0	569 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	CHST3	Q7LGC8	479 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	FAM133A	Q8N9E0	248 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	IL25	Q9H293	177 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	RANBP17	Q9H2T7	1088 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	SCN5A	Q14524	2016 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	RAD50	Q92878	1312 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	ERICH2	A1L162	156 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	ZBBX	A8MT70	800 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	ZEB2	O60315	1214 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	CFB	P00751	764 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	PC	P11498	1178 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	CSF2RA	P15509	400 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	CYP2C18	P33260	490 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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