RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492780.1

WDR6-218, Transcript of WD repeat domain 6, humanhuman

TSL 2

Gene WDR6, Length 537 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR6-218ENST00000492780 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
WDR6-218ENST00000492780 PRR12Q9ULL5 1215 aa16.06■□□□□ 0.16
WDR6-218ENST00000492780 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
WDR6-218ENST00000492780 ZNF236Q9UL36 1845 aa16.05■□□□□ 0.16
WDR6-218ENST00000492780 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
WDR6-218ENST00000492780 PFKFB2O60825 505 aa16.05■□□□□ 0.16
WDR6-218ENST00000492780 ZBED4O75132 1171 aa16.05■□□□□ 0.16
WDR6-218ENST00000492780 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
WDR6-218ENST00000492780 ADORA2AP29274 412 aa16.05■□□□□ 0.16
WDR6-218ENST00000492780 STAT3P40763 770 aa16.05■□□□□ 0.16
WDR6-218ENST00000492780 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
WDR6-218ENST00000492780 MFSD14CQ5VZR4 134 aa16.05■□□□□ 0.16
WDR6-218ENST00000492780 DPP9Q86TI2 863 aa16.05■□□□□ 0.16
WDR6-218ENST00000492780 RIOX2Q8IUF8 465 aa16.05■□□□□ 0.16
WDR6-218ENST00000492780 REPS2Q8NFH8 660 aa16.05■□□□□ 0.16
WDR6-218ENST00000492780 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa16.05■□□□□ 0.16
WDR6-218ENST00000492780 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
WDR6-218ENST00000492780 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
WDR6-218ENST00000492780 FCER1AP12319 257 aa16.04■□□□□ 0.16
WDR6-218ENST00000492780 CDC27P30260 824 aa16.04■□□□□ 0.16
WDR6-218ENST00000492780 COPB2P35606 906 aa16.04■□□□□ 0.16
WDR6-218ENST00000492780 CCT2P78371 535 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
WDR6-218ENST00000492780 STK3Q13188 491 aa16.04■□□□□ 0.16
WDR6-218ENST00000492780 ME3Q16798 604 aa16.04■□□□□ 0.16
WDR6-218ENST00000492780 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
WDR6-218ENST00000492780 TMTC3Q6ZXV5 915 aa16.04■□□□□ 0.16
WDR6-218ENST00000492780 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa16.04■□□□□ 0.16
WDR6-218ENST00000492780 ADGRF4Q8IZF3 695 aa16.04■□□□□ 0.16
WDR6-218ENST00000492780 ABRAQ8N0Z2 381 aa16.04■□□□□ 0.16
WDR6-218ENST00000492780 NPLOC4Q8TAT6 608 aa16.04■□□□□ 0.16
WDR6-218ENST00000492780 SPZ1Q9BXG8 430 aa16.04■□□□□ 0.16
WDR6-218ENST00000492780 RIOX1Q9H6W3 641 aa16.04■□□□□ 0.16
WDR6-218ENST00000492780 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa16.04■□□□□ 0.16
WDR6-218ENST00000492780 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
WDR6-218ENST00000492780 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
WDR6-218ENST00000492780 FLRT1Q9NZU1 646 aa16.04■□□□□ 0.16
WDR6-218ENST00000492780 CPLX1O14810 134 aa16.03■□□□□ 0.16
WDR6-218ENST00000492780 PLEKHA8P1O95397 391 aa16.03■□□□□ 0.16
WDR6-218ENST00000492780 ADD1P35611 737 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
WDR6-218ENST00000492780 OAZ1P54368 228 aa16.03■□□□□ 0.16
WDR6-218ENST00000492780 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
WDR6-218ENST00000492780 MMP19Q99542 508 aa16.03■□□□□ 0.16
WDR6-218ENST00000492780 TEX13BQ9BXU2 312 aa16.03■□□□□ 0.16
WDR6-218ENST00000492780 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
WDR6-218ENST00000492780 CPVLQ9H3G5 476 aa16.03■□□□□ 0.16
WDR6-218ENST00000492780 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
WDR6-218ENST00000492780 VAT1LQ9HCJ6 419 aa16.03■□□□□ 0.16
WDR6-218ENST00000492780 SLC5A4Q9NY91 659 aa16.03■□□□□ 0.16
WDR6-218ENST00000492780 PNMA2Q9UL42 364 aa16.03■□□□□ 0.16
WDR6-218ENST00000492780 CEP290O15078 2479 aa16.03■□□□□ 0.16
WDR6-218ENST00000492780 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
WDR6-218ENST00000492780 SCRN1Q12765 414 aa16.02■□□□□ 0.16
WDR6-218ENST00000492780 KCTD2Q14681 263 aa16.02■□□□□ 0.16
WDR6-218ENST00000492780 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
WDR6-218ENST00000492780 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
WDR6-218ENST00000492780 GTF3C6Q969F1 213 aa16.02■□□□□ 0.16
WDR6-218ENST00000492780 JMJD4Q9H9V9 463 aa16.02■□□□□ 0.16
WDR6-218ENST00000492780 ATP2A1O14983 1001 aa16.01■□□□□ 0.15
WDR6-218ENST00000492780 CYTH3O43739 400 aa16.01■□□□□ 0.15
WDR6-218ENST00000492780 COBLO75128 1261 aa16.01■□□□□ 0.15
WDR6-218ENST00000492780 CDKL5O76039 1030 aa16.01■□□□□ 0.15
WDR6-218ENST00000492780 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
WDR6-218ENST00000492780 LARGE1O95461 756 aa16.01■□□□□ 0.15
WDR6-218ENST00000492780 CYP2C19P33261 490 aa16.01■□□□□ 0.15
WDR6-218ENST00000492780 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
WDR6-218ENST00000492780 OLFML2BQ68BL8 750 aa16.01■□□□□ 0.15
WDR6-218ENST00000492780 CPXCR1Q8N123 301 aa16.01■□□□□ 0.15
WDR6-218ENST00000492780 CCDC82Q8N4S0 544 aa16.01■□□□□ 0.15
WDR6-218ENST00000492780 SNX21Q969T3 373 aa16.01■□□□□ 0.15
WDR6-218ENST00000492780 MTMR8Q96EF0 704 aa16.01■□□□□ 0.15
WDR6-218ENST00000492780 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
WDR6-218ENST00000492780 HTATIP2Q9BUP3 242 aa16.01■□□□□ 0.15
WDR6-218ENST00000492780 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
WDR6-218ENST00000492780 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
WDR6-218ENST00000492780 ZBTB5O15062 677 aa16■□□□□ 0.15
WDR6-218ENST00000492780 ICAM1P05362 532 aa16■□□□□ 0.15
WDR6-218ENST00000492780 IFNAR1P17181 557 aa16■□□□□ 0.15
WDR6-218ENST00000492780 SLC4A3P48751 1232 aa16■□□□□ 0.15
WDR6-218ENST00000492780 FUT2Q10981 343 aa16■□□□□ 0.15
WDR6-218ENST00000492780 TRAF1Q13077 416 aa16■□□□□ 0.15
WDR6-218ENST00000492780 SLC35G1Q2M3R5 365 aa16■□□□□ 0.15
WDR6-218ENST00000492780 CCDC174Q6PII3 467 aa16■□□□□ 0.15
WDR6-218ENST00000492780 HOMER1Q86YM7 354 aa16■□□□□ 0.15
WDR6-218ENST00000492780 NECAB1Q8N987 351 aa16■□□□□ 0.15
WDR6-218ENST00000492780 ANKLE1Q8NAG6 615 aa16■□□□□ 0.15
WDR6-218ENST00000492780 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
WDR6-218ENST00000492780 OGDHLQ9ULD0 1010 aa16■□□□□ 0.15
WDR6-218ENST00000492780 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa15.99■□□□□ 0.15
WDR6-218ENST00000492780 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa15.99■□□□□ 0.15
WDR6-218ENST00000492780 IGHA2P01877 340 aa15.99■□□□□ 0.15
WDR6-218ENST00000492780 PGK2P07205 417 aa15.99■□□□□ 0.15
WDR6-218ENST00000492780 CNGA1P29973 690 aa15.99■□□□□ 0.15
WDR6-218ENST00000492780 SNAP25P60880 206 aa15.99■□□□□ 0.15
WDR6-218ENST00000492780 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
WDR6-218ENST00000492780 NTRK3Q16288 839 aa15.99■□□□□ 0.15
WDR6-218ENST00000492780 QRICH1Q2TAL8 776 aa15.99■□□□□ 0.15
WDR6-218ENST00000492780 TRIM22Q8IYM9 498 aa15.99■□□□□ 0.15
WDR6-218ENST00000492780 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
WDR6-218ENST00000492780 DPF3Q92784 378 aa15.99■□□□□ 0.15
WDR6-218ENST00000492780 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms