RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486539.1

CACNA2D1-211, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1, humanhuman

TSL 5

Gene CACNA2D1, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1-211ENST00000486539 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa6.34□□□□□ -1.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 NPIPB8E9PQR5 432 aa6.34□□□□□ -1.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 RGS13O14921 159 aa6.34□□□□□ -1.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 RLBP1P12271 317 aa6.34□□□□□ -1.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 PMLP29590 882 aa6.34□□□□□ -1.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 SPDYAQ5MJ70 313 aa6.34□□□□□ -1.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 REV1Q9UBZ9 1251 aa6.34□□□□□ -1.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
CACNA2D1-211ENST00000486539 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa6.33□□□□□ -1.4
CACNA2D1-211ENST00000486539 TMEM52Q8NDY8 209 aa6.33□□□□□ -1.4
CACNA2D1-211ENST00000486539 DCTN4Q9UJW0 460 aa6.33□□□□□ -1.4
CACNA2D1-211ENST00000486539 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
CACNA2D1-211ENST00000486539 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
CACNA2D1-211ENST00000486539 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
CACNA2D1-211ENST00000486539 NAT16Q8N8M0 369 aa6.32□□□□□ -1.4
CACNA2D1-211ENST00000486539 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
CACNA2D1-211ENST00000486539 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
CACNA2D1-211ENST00000486539 FRMD6Q96NE9 622 aa6.32□□□□□ -1.4
CACNA2D1-211ENST00000486539 IKZF4Q9H2S9 585 aa6.32□□□□□ -1.4
CACNA2D1-211ENST00000486539 DLL4Q9NR61 685 aa6.32□□□□□ -1.4
CACNA2D1-211ENST00000486539 AP5S1Q9NUS5 200 aa6.32□□□□□ -1.4
CACNA2D1-211ENST00000486539 GPR42O15529 346 aa6.31□□□□□ -1.4
CACNA2D1-211ENST00000486539 VAV1P15498 845 aa6.31□□□□□ -1.4
CACNA2D1-211ENST00000486539 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
CACNA2D1-211ENST00000486539 SLC9A5Q14940 896 aa6.31□□□□□ -1.4
CACNA2D1-211ENST00000486539 CSRP2Q16527 193 aa6.31□□□□□ -1.4
CACNA2D1-211ENST00000486539 MIIPQ5JXC2 388 aa6.31□□□□□ -1.4
CACNA2D1-211ENST00000486539 CYP2R1Q6VVX0 501 aa6.31□□□□□ -1.4
CACNA2D1-211ENST00000486539 VOPP1Q96AW1 172 aa6.31□□□□□ -1.4
CACNA2D1-211ENST00000486539 CRAMP1Q96RY5 1269 aa6.31□□□□□ -1.4
CACNA2D1-211ENST00000486539 PCSK5Q92824 1860 aa6.3□□□□□ -1.4
CACNA2D1-211ENST00000486539 C9orf118A6NHY6 69 aa6.3□□□□□ -1.4
CACNA2D1-211ENST00000486539 INHBCP55103 352 aa6.3□□□□□ -1.4
CACNA2D1-211ENST00000486539 FOXE3Q13461 319 aa6.3□□□□□ -1.4
CACNA2D1-211ENST00000486539 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CACNA2D1-211ENST00000486539 SCUBE1Q8IWY4 988 aa6.3□□□□□ -1.4
CACNA2D1-211ENST00000486539 PATE3B3GLJ2 98 aa6.29□□□□□ -1.4
CACNA2D1-211ENST00000486539 MCM7P33993 719 aa6.29□□□□□ -1.4
CACNA2D1-211ENST00000486539 THBS2P35442 1172 aa6.29□□□□□ -1.4
CACNA2D1-211ENST00000486539 ATP2B2Q01814 1243 aa6.29□□□□□ -1.4
CACNA2D1-211ENST00000486539 CARNS1A5YM72 827 aa6.28□□□□□ -1.4
CACNA2D1-211ENST00000486539 HTR3BO95264 441 aa6.28□□□□□ -1.4
CACNA2D1-211ENST00000486539 CYP2C8P10632 490 aa6.28□□□□□ -1.4
CACNA2D1-211ENST00000486539 MLECQ14165 292 aa6.28□□□□□ -1.4
CACNA2D1-211ENST00000486539 C9orf131Q5VYM1 1079 aa6.28□□□□□ -1.4
CACNA2D1-211ENST00000486539 MCTP2Q6DN12 878 aa6.28□□□□□ -1.4
CACNA2D1-211ENST00000486539 CABP7Q86V35 215 aa6.28□□□□□ -1.4
CACNA2D1-211ENST00000486539 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
CACNA2D1-211ENST00000486539 NLGN2Q8NFZ4 835 aa6.28□□□□□ -1.4
CACNA2D1-211ENST00000486539 TRIM8Q9BZR9 551 aa6.28□□□□□ -1.4
CACNA2D1-211ENST00000486539 PRR13Q9NZ81 148 aa6.28□□□□□ -1.4
CACNA2D1-211ENST00000486539 NUDT5Q9UKK9 219 aa6.28□□□□□ -1.4
CACNA2D1-211ENST00000486539 A0A087X1B8 175 aa6.27□□□□□ -1.41
CACNA2D1-211ENST00000486539 UBOX5O94941 541 aa6.27□□□□□ -1.41
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF202O95125 648 aa6.27□□□□□ -1.41
CACNA2D1-211ENST00000486539 MAPK8P45983 427 aa6.27□□□□□ -1.41
CACNA2D1-211ENST00000486539 RGS19P49795 217 aa6.27□□□□□ -1.41
CACNA2D1-211ENST00000486539 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa6.27□□□□□ -1.41
CACNA2D1-211ENST00000486539 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa6.27□□□□□ -1.41
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZG16BQ96DA0 208 aa6.27□□□□□ -1.41
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
CACNA2D1-211ENST00000486539 USTQ9Y2C2 406 aa6.27□□□□□ -1.41
CACNA2D1-211ENST00000486539 B4GALT3O60512 393 aa6.26□□□□□ -1.41
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF623O75123 536 aa6.26□□□□□ -1.41
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZBTB7AO95365 584 aa6.26□□□□□ -1.41
CACNA2D1-211ENST00000486539 GLI4P10075 376 aa6.26□□□□□ -1.41
CACNA2D1-211ENST00000486539 EPHB4P54760 987 aa6.26□□□□□ -1.41
CACNA2D1-211ENST00000486539 MAP3K11Q16584 847 aa6.26□□□□□ -1.41
CACNA2D1-211ENST00000486539 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
CACNA2D1-211ENST00000486539 USP48Q86UV5 1035 aa6.26□□□□□ -1.41
CACNA2D1-211ENST00000486539 PEX11GQ96HA9 241 aa6.26□□□□□ -1.41
CACNA2D1-211ENST00000486539 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa6.26□□□□□ -1.41
CACNA2D1-211ENST00000486539 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
CACNA2D1-211ENST00000486539 CTSKP43235 329 aa6.25□□□□□ -1.41
CACNA2D1-211ENST00000486539 HS1BP3Q53T59 392 aa6.25□□□□□ -1.41
CACNA2D1-211ENST00000486539 TXNDC2Q86VQ3 553 aa6.25□□□□□ -1.41
CACNA2D1-211ENST00000486539 TTLL6Q8N841 843 aa6.25□□□□□ -1.41
CACNA2D1-211ENST00000486539 KYQ8NBH2 561 aa6.25□□□□□ -1.41
CACNA2D1-211ENST00000486539 USP33Q8TEY7 942 aa6.25□□□□□ -1.41
CACNA2D1-211ENST00000486539 DDX11Q96FC9 970 aa6.25□□□□□ -1.41
CACNA2D1-211ENST00000486539 MINPP1Q9UNW1 487 aa6.25□□□□□ -1.41
CACNA2D1-211ENST00000486539 GSNP06396 782 aa6.24□□□□□ -1.41
CACNA2D1-211ENST00000486539 ACRP10323 421 aa6.24□□□□□ -1.41
CACNA2D1-211ENST00000486539 RAG1P15918 1043 aa6.24□□□□□ -1.41
CACNA2D1-211ENST00000486539 RTP2Q5QGT7 225 aa6.24□□□□□ -1.41
CACNA2D1-211ENST00000486539 SLFN13Q68D06 897 aa6.24□□□□□ -1.41
CACNA2D1-211ENST00000486539 RGS22Q8NE09 1264 aa6.24□□□□□ -1.41
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF503Q96F45 646 aa6.24□□□□□ -1.41
CACNA2D1-211ENST00000486539 MEIS1O00470 390 aa6.23□□□□□ -1.41
CACNA2D1-211ENST00000486539 PPP2CBP62714 309 aa6.23□□□□□ -1.41
CACNA2D1-211ENST00000486539 PPP2CAP67775 309 aa6.23□□□□□ -1.41
CACNA2D1-211ENST00000486539 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP6.23□□□□□ -1.41
CACNA2D1-211ENST00000486539 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.23□□□□□ -1.41
CACNA2D1-211ENST00000486539 RNF207Q6ZRF8 634 aa6.23□□□□□ -1.41
CACNA2D1-211ENST00000486539 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa6.23□□□□□ -1.41
CACNA2D1-211ENST00000486539 GATAD2BQ8WXI9 593 aa6.23□□□□□ -1.41
CACNA2D1-211ENST00000486539 GORASP1Q9BQQ3 440 aa6.23□□□□□ -1.41
CACNA2D1-211ENST00000486539 JADE2Q9NQC1 790 aa6.23□□□□□ -1.41
CACNA2D1-211ENST00000486539 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa6.23□□□□□ -1.41
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