RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482785.1

SHQ1-208, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 3

Gene SHQ1, Length 502 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-208ENST00000482785 CYP4X1Q8N118 509 aa5.02□□□□□ -1.61
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SHQ1-208ENST00000482785 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa5.02□□□□□ -1.61
SHQ1-208ENST00000482785 BRI3BPQ8WY22 251 aa5.02□□□□□ -1.61
SHQ1-208ENST00000482785 ITPKCQ96DU7 683 aa5.02□□□□□ -1.61
SHQ1-208ENST00000482785 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
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SHQ1-208ENST00000482785 ZFAND3Q9H8U3 227 aa5.02□□□□□ -1.61
SHQ1-208ENST00000482785 KBTBD4Q9NVX7 518 aa5.02□□□□□ -1.61
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SHQ1-208ENST00000482785 MTCH2Q9Y6C9 303 aa5.01□□□□□ -1.61
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SHQ1-208ENST00000482785 AGBL1Q96MI9 1066 aa5□□□□□ -1.61
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SHQ1-208ENST00000482785 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
SHQ1-208ENST00000482785 PLA2G4AP47712 749 aa4.98□□□□□ -1.61
SHQ1-208ENST00000482785 FLT3LGP49771 235 aa4.98□□□□□ -1.61
SHQ1-208ENST00000482785 RELBQ01201 579 aa4.98□□□□□ -1.61
SHQ1-208ENST00000482785 KIAA2012Q0VF49 1180 aa4.98□□□□□ -1.61
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