RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480420.5

CTPS1-209, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 750 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-209ENST00000480420 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa9.48□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 MYADML2A6NDP7 307 aa9.48□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 SOWAHBA6NEL2 793 aa9.48□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 ASB14A6NK59 587 aa9.48□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 DCDC2CA8MYV0 355 aa9.48□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 HIP1O00291 1037 aa9.48□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 IGHA2P01877 340 aa9.48□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 ACLYP53396 1101 aa9.48□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 BEX3Q00994 111 aa9.48□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 TNFAIP2Q03169 654 aa9.48□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 TKFCQ3LXA3 575 aa9.48□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 IQCA1Q86XH1 822 aa9.48□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 NUP133Q8WUM0 1156 aa9.48□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 GLT1D1Q96MS3 346 aa9.48□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 UBA5Q9GZZ9 404 aa9.48□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 AP5M1Q9H0R1 490 aa9.48□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 KAT14Q9H8E8 782 aa9.48□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 PHF24Q9UPV7 400 aa9.48□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF536O15090 1300 aa9.48□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 LAMA4Q16363 1823 aa9.47□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 ICAM1P05362 532 aa9.47□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 ASGR1P07306 291 aa9.47□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 CLTBP09497 229 aa9.47□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 PTGS1P23219 599 aa9.47□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa9.47□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa9.47□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 UBAC1Q9BSL1 405 aa9.47□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 PDLIM7Q9NR12 457 aa9.47□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 PDGFCQ9NRA1 345 aa9.47□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 CTNNA3Q9UI47 895 aa9.47□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 LTBP2Q14767 1821 aa9.47□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 TRIM43BA6NCK2 446 aa9.46□□□□□ -0.9
CTPS1-209ENST00000480420 NFIBO00712 420 aa9.46□□□□□ -0.9
CTPS1-209ENST00000480420 ADCY6O43306 1168 aa9.46□□□□□ -0.9
CTPS1-209ENST00000480420 ADAMTS4O75173 837 aa9.46□□□□□ -0.9
CTPS1-209ENST00000480420 PDHBP11177 359 aa9.46□□□□□ -0.9
CTPS1-209ENST00000480420 PDE4DQ08499 809 aa9.46□□□□□ -0.9
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF543Q08ER8 600 aa9.46□□□□□ -0.9
CTPS1-209ENST00000480420 SHHQ15465 462 aa9.46□□□□□ -0.9
CTPS1-209ENST00000480420 TTC22Q5TAA0 569 aa9.46□□□□□ -0.9
CTPS1-209ENST00000480420 GPR153Q6NV75 609 aa9.46□□□□□ -0.9
CTPS1-209ENST00000480420 RNF207Q6ZRF8 634 aa9.46□□□□□ -0.9
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
CTPS1-209ENST00000480420 FAM133AQ8N9E0 248 aa9.46□□□□□ -0.9
CTPS1-209ENST00000480420 PNMA1Q8ND90 353 aa9.46□□□□□ -0.9
CTPS1-209ENST00000480420 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
CTPS1-209ENST00000480420 FGD4Q96M96 766 aa9.46□□□□□ -0.9
CTPS1-209ENST00000480420 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
CTPS1-209ENST00000480420 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
CTPS1-209ENST00000480420 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa9.46□□□□□ -0.9
CTPS1-209ENST00000480420 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
CTPS1-209ENST00000480420 OSBPL3Q9H4L5 887 aa9.46□□□□□ -0.9
CTPS1-209ENST00000480420 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa9.46□□□□□ -0.9
CTPS1-209ENST00000480420 CYP39A1Q9NYL5 469 aa9.46□□□□□ -0.9
CTPS1-209ENST00000480420 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
CTPS1-209ENST00000480420 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa9.46□□□□□ -0.9
CTPS1-209ENST00000480420 PLA2G6O60733 806 aa9.45□□□□□ -0.9
CTPS1-209ENST00000480420 MYL3P08590 195 aa9.45□□□□□ -0.9
CTPS1-209ENST00000480420 FGRP09769 529 aa9.45□□□□□ -0.9
CTPS1-209ENST00000480420 PCP11498 1178 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
CTPS1-209ENST00000480420 PDE4AP27815 886 aa9.45□□□□□ -0.9
CTPS1-209ENST00000480420 TRDNQ13061 729 aa9.45□□□□□ -0.9
CTPS1-209ENST00000480420 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
CTPS1-209ENST00000480420 C9orf50Q5SZB4 431 aa9.45□□□□□ -0.9
CTPS1-209ENST00000480420 CXCL17Q6UXB2 119 aa9.45□□□□□ -0.9
CTPS1-209ENST00000480420 SLC30A10Q6XR72 485 aa9.45□□□□□ -0.9
CTPS1-209ENST00000480420 TLK2Q86UE8 772 aa9.45□□□□□ -0.9
CTPS1-209ENST00000480420 RUFY2Q8WXA3 655 aa9.45□□□□□ -0.9
CTPS1-209ENST00000480420 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
CTPS1-209ENST00000480420 TTC14Q96N46 770 aa9.45□□□□□ -0.9
CTPS1-209ENST00000480420 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
CTPS1-209ENST00000480420 KRT23Q9C075 422 aa9.45□□□□□ -0.9
CTPS1-209ENST00000480420 MTMR10Q9NXD2 777 aa9.45□□□□□ -0.9
CTPS1-209ENST00000480420 ZSWIM5Q9P217 1185 aa9.45□□□□□ -0.9
CTPS1-209ENST00000480420 ZMYM6O95789 1325 aa9.45□□□□□ -0.9
CTPS1-209ENST00000480420 EYSQ5T1H1 3165 aa9.45□□□□□ -0.9
CTPS1-209ENST00000480420 LCTP09848 1927 aa9.44□□□□□ -0.9
CTPS1-209ENST00000480420 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
CTPS1-209ENST00000480420 MOXD2PA6NHM9 499 aa9.44□□□□□ -0.9
CTPS1-209ENST00000480420 TLR3O15455 904 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
CTPS1-209ENST00000480420 ZEB2O60315 1214 aa9.44□□□□□ -0.9
CTPS1-209ENST00000480420 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
CTPS1-209ENST00000480420 SMPD1P17405 629 aa9.44□□□□□ -0.9
CTPS1-209ENST00000480420 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
CTPS1-209ENST00000480420 PSMC6P62333 389 aa9.44□□□□□ -0.9
CTPS1-209ENST00000480420 FPGSQ05932 587 aa9.44□□□□□ -0.9
CTPS1-209ENST00000480420 FAAP100Q0VG06 881 aa9.44□□□□□ -0.9
CTPS1-209ENST00000480420 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
CTPS1-209ENST00000480420 LRIT3Q3SXY7 679 aa9.44□□□□□ -0.9
CTPS1-209ENST00000480420 CCDC178Q5BJE1 867 aa9.44□□□□□ -0.9
CTPS1-209ENST00000480420 FAM47CQ5HY64 1035 aa9.44□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.5 ms