RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476423.5

SZRD1-208, Transcript of SUZ RNA binding domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene SZRD1, Length 567 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZRD1-208ENST00000476423 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa9.55□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 CABP5Q9NP86 173 aa9.55□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 BRWD1Q9NSI6 2320 aa9.54□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 LINC01553A4QN01 128 aa9.54□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 EFCAB14O75071 495 aa9.54□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 LMNAP02545 664 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 TRIM27P14373 513 aa9.54□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 PLCG2P16885 1265 aa9.54□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 ACVR2BQ13705 512 aa9.54□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 TCEAL5Q5H9L2 206 aa9.54□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 C1orf115Q9H7X2 142 aa9.54□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 PALD1Q9ULE6 856 aa9.54□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 INSL6Q9Y581 213 aa9.54□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 PARP14Q460N5 1801 aa9.54□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 LCHNA4D1U4 455 aa9.53□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 LOC730098B7Z3J9 87 aa9.53□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 PITPNM1O00562 1244 aa9.53□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 GJB5O95377 273 aa9.53□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 PARNO95453 639 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 BAG3O95817 575 aa9.53□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 GH2P01242 217 aa9.53□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 PGK2P07205 417 aa9.53□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 IQCF3P0C7M6 154 aa9.53□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 BFSP2Q13515 415 aa9.53□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 RAB3GAP1Q15042 981 aa9.53□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 CXCL17Q6UXB2 119 aa9.53□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 SPRED2Q7Z698 418 aa9.53□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 RPAINQ86UA6 219 aa9.53□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa9.53□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 DDX11Q96FC9 970 aa9.53□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 TANGO6Q9C0B7 1094 aa9.53□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 CD207Q9UJ71 328 aa9.53□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 SIP14410 1827 aa9.53□□□□□ -0.88
SZRD1-208ENST00000476423 EPG5Q9HCE0 2579 aa9.52□□□□□ -0.89
SZRD1-208ENST00000476423 H3BNC9 293 aa9.52□□□□□ -0.89
SZRD1-208ENST00000476423 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
SZRD1-208ENST00000476423 ICAM3P32942 547 aa9.52□□□□□ -0.89
SZRD1-208ENST00000476423 LTBRP36941 435 aa9.52□□□□□ -0.89
SZRD1-208ENST00000476423 WDR5P61964 334 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
SZRD1-208ENST00000476423 DMWDQ09019 674 aa9.52□□□□□ -0.89
SZRD1-208ENST00000476423 CTC1Q2NKJ3 1217 aa9.52□□□□□ -0.89
SZRD1-208ENST00000476423 CCDC144BQ3MJ40 725 aa9.52□□□□□ -0.89
SZRD1-208ENST00000476423 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
SZRD1-208ENST00000476423 RIOX2Q8IUF8 465 aa9.52□□□□□ -0.89
SZRD1-208ENST00000476423 MAGEB6Q8N7X4 407 aa9.52□□□□□ -0.89
SZRD1-208ENST00000476423 CLUAP1Q96AJ1 413 aa9.52□□□□□ -0.89
SZRD1-208ENST00000476423 HAUS7Q99871 368 aa9.52□□□□□ -0.89
SZRD1-208ENST00000476423 AP5M1Q9H0R1 490 aa9.52□□□□□ -0.89
SZRD1-208ENST00000476423 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
SZRD1-208ENST00000476423 LRP2BPQ9P2M1 347 aa9.52□□□□□ -0.89
SZRD1-208ENST00000476423 AKAP2Q9Y2D5 859 aa9.52□□□□□ -0.89
SZRD1-208ENST00000476423 CHD8Q9HCK8 2581 aa9.52□□□□□ -0.89
SZRD1-208ENST00000476423 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa9.51□□□□□ -0.89
SZRD1-208ENST00000476423 BCAR3O75815 825 aa9.51□□□□□ -0.89
SZRD1-208ENST00000476423 ZAP70P43403 619 aa9.51□□□□□ -0.89
SZRD1-208ENST00000476423 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
SZRD1-208ENST00000476423 GPM6BQ13491 265 aa9.51□□□□□ -0.89
SZRD1-208ENST00000476423 TNNI3KQ59H18 835 aa9.51□□□□□ -0.89
SZRD1-208ENST00000476423 GORABQ5T7V8 394 aa9.51□□□□□ -0.89
SZRD1-208ENST00000476423 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
SZRD1-208ENST00000476423 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
SZRD1-208ENST00000476423 MIGA1Q8NAN2 632 aa9.51□□□□□ -0.89
SZRD1-208ENST00000476423 ACER1Q8TDN7 264 aa9.51□□□□□ -0.89
SZRD1-208ENST00000476423 HINFPQ9BQA5 517 aa9.51□□□□□ -0.89
SZRD1-208ENST00000476423 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
SZRD1-208ENST00000476423 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa9.51□□□□□ -0.89
SZRD1-208ENST00000476423 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
SZRD1-208ENST00000476423 ZFHX4Q86UP3 3567 aa9.5□□□□□ -0.89
SZRD1-208ENST00000476423 SOBPA7XYQ1 873 aa9.5□□□□□ -0.89
SZRD1-208ENST00000476423 FLOT1O75955 427 aa9.5□□□□□ -0.89
SZRD1-208ENST00000476423 EYA4O95677 639 aa9.5□□□□□ -0.89
SZRD1-208ENST00000476423 GNAI3P08754 354 aa9.5□□□□□ -0.89
SZRD1-208ENST00000476423 STAT3P40763 770 aa9.5□□□□□ -0.89
SZRD1-208ENST00000476423 CLCN5P51795 746 aa9.5□□□□□ -0.89
SZRD1-208ENST00000476423 TNFAIP2Q03169 654 aa9.5□□□□□ -0.89
SZRD1-208ENST00000476423 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SZRD1-208ENST00000476423 PTPN21Q16825 1174 aa9.5□□□□□ -0.89
SZRD1-208ENST00000476423 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SZRD1-208ENST00000476423 ABCB5Q2M3G0 1257 aa9.5□□□□□ -0.89
SZRD1-208ENST00000476423 TATDN1Q6P1N9 297 aa9.5□□□□□ -0.89
SZRD1-208ENST00000476423 ZBTB33Q86T24 672 aa9.5□□□□□ -0.89
SZRD1-208ENST00000476423 CLEC10AQ8IUN9 316 aa9.5□□□□□ -0.89
SZRD1-208ENST00000476423 TMEM57Q8N5G2 664 aa9.5□□□□□ -0.89
SZRD1-208ENST00000476423 CCDC155Q8N6L0 562 aa9.5□□□□□ -0.89
SZRD1-208ENST00000476423 PPP2R3CQ969Q6 453 aa9.5□□□□□ -0.89
SZRD1-208ENST00000476423 LMAN2LQ9H0V9 348 aa9.5□□□□□ -0.89
SZRD1-208ENST00000476423 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SZRD1-208ENST00000476423 Q9Y3F1 56 aa9.5□□□□□ -0.89
SZRD1-208ENST00000476423 GRIN2DO15399 1336 aa9.5□□□□□ -0.89
SZRD1-208ENST00000476423 ATRXP46100 2492 aa9.49□□□□□ -0.89
SZRD1-208ENST00000476423 MYH8P13535 1937 aa9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms