RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476231.1

SYF2-204, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SYF2, Length 1,962 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-204ENST00000476231 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa21.61■■□□□ 1.05
SYF2-204ENST00000476231 C4orf32Q8N8J7 132 aa21.61■■□□□ 1.05
SYF2-204ENST00000476231 CCDC34Q96HJ3 373 aa21.61■■□□□ 1.05
SYF2-204ENST00000476231 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa21.61■■□□□ 1.05
SYF2-204ENST00000476231 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
SYF2-204ENST00000476231 SARSP49591 514 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
SYF2-204ENST00000476231 RASA3Q14644 834 aa21.6■■□□□ 1.05
SYF2-204ENST00000476231 CDAN1Q8IWY9 1227 aa21.6■■□□□ 1.05
SYF2-204ENST00000476231 HSD3B7Q9H2F3 369 aa21.6■■□□□ 1.05
SYF2-204ENST00000476231 DACH1Q9UI36 760 aa21.6■■□□□ 1.05
SYF2-204ENST00000476231 A0A1W2PRG0 241 aa21.59■■□□□ 1.05
SYF2-204ENST00000476231 LAD1O00515 517 aa21.59■■□□□ 1.05
SYF2-204ENST00000476231 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
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SYF2-204ENST00000476231 SMC2O95347 1197 aa21.59■■□□□ 1.05
SYF2-204ENST00000476231 BMP3P12645 472 aa21.59■■□□□ 1.05
SYF2-204ENST00000476231 TNNT1P13805 278 aa21.59■■□□□ 1.05
SYF2-204ENST00000476231 FANCCQ00597 558 aa21.59■■□□□ 1.05
SYF2-204ENST00000476231 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
SYF2-204ENST00000476231 RIC8AQ9NPQ8 531 aa21.59■■□□□ 1.05
SYF2-204ENST00000476231 TMX2Q9Y320 296 aa21.59■■□□□ 1.05
SYF2-204ENST00000476231 VWA3AA6NCI4 1184 aa21.59■■□□□ 1.05
SYF2-204ENST00000476231 NRDCO43847 1150 aa21.59■■□□□ 1.05
SYF2-204ENST00000476231 EGFRP00533 1210 aa21.59■■□□□ 1.05
SYF2-204ENST00000476231 CAP2P40123 477 aa21.59■■□□□ 1.05
SYF2-204ENST00000476231 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
SYF2-204ENST00000476231 POSTNQ15063 836 aa21.59■■□□□ 1.05
SYF2-204ENST00000476231 SYCP1Q15431 976 aa21.59■■□□□ 1.05
SYF2-204ENST00000476231 MIGA2Q7L4E1 593 aa21.59■■□□□ 1.05
SYF2-204ENST00000476231 MLKLQ8NB16 471 aa21.59■■□□□ 1.05
SYF2-204ENST00000476231 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
SYF2-204ENST00000476231 BTNL9Q6UXG8 535 aa21.58■■□□□ 1.05
SYF2-204ENST00000476231 USP49Q70CQ1 688 aa21.58■■□□□ 1.05
SYF2-204ENST00000476231 NEK8Q86SG6 692 aa21.58■■□□□ 1.05
SYF2-204ENST00000476231 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
SYF2-204ENST00000476231 GLT8D2Q9H1C3 349 aa21.58■■□□□ 1.05
SYF2-204ENST00000476231 GOPCQ9HD26 462 aa21.58■■□□□ 1.05
SYF2-204ENST00000476231 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
SYF2-204ENST00000476231 ZNF541Q9H0D2 1346 aa21.58■■□□□ 1.05
SYF2-204ENST00000476231 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
SYF2-204ENST00000476231 TUBB4AP04350 444 aa21.57■■□□□ 1.04
SYF2-204ENST00000476231 LONP1P36776 959 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
SYF2-204ENST00000476231 QRICH1Q2TAL8 776 aa21.57■■□□□ 1.04
SYF2-204ENST00000476231 SAMD7Q7Z3H4 446 aa21.57■■□□□ 1.04
SYF2-204ENST00000476231 SPATA20Q8TB22 786 aa21.57■■□□□ 1.04
SYF2-204ENST00000476231 CUL5Q93034 780 aa21.57■■□□□ 1.04
SYF2-204ENST00000476231 PRPHP41219 470 aa21.57■■□□□ 1.04
SYF2-204ENST00000476231 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
SYF2-204ENST00000476231 RBM10P98175 930 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
SYF2-204ENST00000476231 ARID5BQ14865 1188 aa21.57■■□□□ 1.04
SYF2-204ENST00000476231 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
SYF2-204ENST00000476231 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa21.57■■□□□ 1.04
SYF2-204ENST00000476231 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa21.57■■□□□ 1.04
SYF2-204ENST00000476231 NYAP1Q6ZVC0 841 aa21.57■■□□□ 1.04
SYF2-204ENST00000476231 EPSTI1Q96J88 318 aa21.57■■□□□ 1.04
SYF2-204ENST00000476231 TEPSINQ96N21 525 aa21.57■■□□□ 1.04
SYF2-204ENST00000476231 SH2D4AQ9H788 454 aa21.57■■□□□ 1.04
SYF2-204ENST00000476231 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
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SYF2-204ENST00000476231 ECE1P42892 770 aa21.56■■□□□ 1.04
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SYF2-204ENST00000476231 SYDE2Q5VT97 1194 aa21.56■■□□□ 1.04
SYF2-204ENST00000476231 TBCKQ8TEA7 893 aa21.56■■□□□ 1.04
SYF2-204ENST00000476231 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
SYF2-204ENST00000476231 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
SYF2-204ENST00000476231 SERTAD1Q9UHV2 236 aa21.56■■□□□ 1.04
SYF2-204ENST00000476231 TMEM232C9JQI7 657 aa21.56■■□□□ 1.04
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SYF2-204ENST00000476231 CLK2P49760 499 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
SYF2-204ENST00000476231 MORC3Q14149 939 aa21.56■■□□□ 1.04
SYF2-204ENST00000476231 IL17AQ16552 155 aa21.56■■□□□ 1.04
SYF2-204ENST00000476231 DTHD1Q6ZMT9 781 aa21.56■■□□□ 1.04
SYF2-204ENST00000476231 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa21.56■■□□□ 1.04
SYF2-204ENST00000476231 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
SYF2-204ENST00000476231 ACER1Q8TDN7 264 aa21.56■■□□□ 1.04
SYF2-204ENST00000476231 SMARCE1Q969G3 411 aa21.56■■□□□ 1.04
SYF2-204ENST00000476231 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
SYF2-204ENST00000476231 TMEM260Q9NX78 707 aa21.56■■□□□ 1.04
SYF2-204ENST00000476231 MAN1B1Q9UKM7 699 aa21.56■■□□□ 1.04
SYF2-204ENST00000476231 H7C1D1 291 aa21.55■■□□□ 1.04
SYF2-204ENST00000476231 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP21.55■■□□□ 1.04
SYF2-204ENST00000476231 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
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SYF2-204ENST00000476231 LETM2Q2VYF4 491 aa21.55■■□□□ 1.04
SYF2-204ENST00000476231 TMC6Q7Z403 805 aa21.55■■□□□ 1.04
SYF2-204ENST00000476231 PDILTQ8N807 584 aa21.55■■□□□ 1.04
SYF2-204ENST00000476231 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
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SYF2-204ENST00000476231 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
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SYF2-204ENST00000476231 PSTPIP2Q9H939 334 aa21.54■■□□□ 1.04
SYF2-204ENST00000476231 GINM1Q9NU53 330 aa21.54■■□□□ 1.04
SYF2-204ENST00000476231 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa21.54■■□□□ 1.04
SYF2-204ENST00000476231 PHF20L1A8MW92 1017 aa21.54■■□□□ 1.04
SYF2-204ENST00000476231 SLFN14P0C7P3 912 aa21.54■■□□□ 1.04
SYF2-204ENST00000476231 PTPN14Q15678 1187 aa21.54■■□□□ 1.04
SYF2-204ENST00000476231 CCDC112Q8NEF3 446 aa21.54■■□□□ 1.04
SYF2-204ENST00000476231 TMEM60Q9H2L4 133 aa21.54■■□□□ 1.04
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