RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 MT-CO1P00395 513 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 PDE6BP35913 854 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 LSSP48449 732 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 ERVK-21P61565 698 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 FAPQ12884 760 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 MINDY4Q4G0A6 757 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 DENND5AQ6IQ26 1287 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 KCNT2Q6UVM3 1135 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 RNF141Q8WVD5 230 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 IGF1RP08069 1367 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 CCDC189A1A4V9 331 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 VAMP4O75379 141 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 FOSP01100 380 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 PF4V1P10720 104 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 OCRLQ01968 901 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 CYP4F3Q08477 520 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 INAVAQ3KP66 663 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 RGL3Q3MIN7 710 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 NUTM2GQ5VZR2 741 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 DYMQ7RTS9 669 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 C11orf74Q86VG3 221 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP7.74□□□□□ -1.179e-34■□□□□ 10.3
RABGGTB-209ENST00000473406 IGSF22Q8N9C0 903 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 USP33Q8TEY7 942 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 TIFAQ96CG3 184 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 PRDM14Q9GZV8 571 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 SUGCTQ9HAC7 445 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 CYP4F12Q9HCS2 524 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 CABP5Q9NP86 173 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 EMC7Q9NPA0 242 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 PRR13Q9NZ81 148 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 MEGF11A6BM72 1044 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 ARVCFO00192 962 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 ITIH2P19823 946 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 ETV3P41162 512 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 SCRN1Q12765 414 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 DPY19L1Q2PZI1 675 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM240Q5SV17 173 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 LETMD1Q6P1Q0 360 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 PPIL6Q8IXY8 311 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 IFNL3Q8IZI9 196 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 CPA6Q8N4T0 437 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 CLIP3Q96DZ5 547 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 FBXL18Q96ME1 805 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 MIPEPQ99797 713 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 DSCC1Q9BVC3 393 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 PHF20Q9BVI0 1012 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 SARGQ9BW04 601 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 VTA1Q9NP79 307 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 GFOD1Q9NXC2 390 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 USP25Q9UHP3 1055 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 GIT1Q9Y2X7 761 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 KRBA1A5PL33 1030 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 WDR64B1ANS9 1081 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 FZD9O00144 591 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 TRAF5O00463 557 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 DLL1O00548 723 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 ASPAP45381 313 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 GPR85P60893 370 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 PICALMQ13492 652 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 MORC3Q14149 939 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 CHSY3Q70JA7 882 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 ILDR2Q71H61 639 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 CDH24Q86UP0 819 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 KREMEN2Q8NCW0 462 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 RNF208Q9H0X6 261 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 SPTLC3Q9NUV7 552 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 B4GALT6Q9UBX8 382 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 INTUQ9ULD6 942 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 WASHC2AQ641Q2 1341 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGGTB-209ENST00000473406 WISP1O95388 367 aa7.71□□□□□ -1.18
RABGGTB-209ENST00000473406 CYP2C19P33261 490 aa7.71□□□□□ -1.18
RABGGTB-209ENST00000473406 NEK3P51956 506 aa7.71□□□□□ -1.18
RABGGTB-209ENST00000473406 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP7.71□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.7 ms