RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470201.5

RABGGTB-207, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 848 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-207ENST00000470201 MCMBPQ9BTE3 642 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 PARNO95453 639 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 THBDP07204 575 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 SRFP11831 508 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 ADMP35318 185 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 NOP2P46087 812 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 NEK4P51957 841 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 EVA1CP58658 441 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 DHCR24Q15392 516 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 ODR4Q5SWX8 454 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 DENND5AQ6IQ26 1287 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 PKN3Q6P5Z2 889 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 ATL2Q8NHH9 583 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 NPLOC4Q8TAT6 608 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 C7orf69Q9H7B7 122 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 RAXQ9Y2V3 346 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 TRAF6Q9Y4K3 522 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 ASXL2Q76L83 1435 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 C2orf71A6NGG8 1288 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 KPNA6O60684 536 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 RASGRP1O95267 797 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 EYA4O95677 639 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 CRTAMO95727 393 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 JMJD7P0C870 316 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 CHRNA4P43681 627 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 RCSD1Q6JBY9 416 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 ANKLE2Q86XL3 938 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 KSR1Q8IVT5 923 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 FRS2Q8WU20 508 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 TCTN2Q96GX1 697 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 GPATCH2Q9NW75 528 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 HMX2A2RU54 273 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 IFNGR1P15260 489 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 SEPHS1P49903 392 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 GPR85P60893 370 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 KCNAB2Q13303 367 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 CFAP100Q494V2 611 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 CCDC181Q5TID7 509 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 KCNT2Q6UVM3 1135 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF765Q7L2R6 523 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 NECAB2Q7Z6G3 386 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 STRA8Q7Z7C7 330 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 CD163Q86VB7 1156 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 IFNL3Q8IZI9 196 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 JDP2Q8WYK2 163 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 PHF20Q9BVI0 1012 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC12A9Q9BXP2 914 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 MTFR1LQ9H019 292 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 MKNK2Q9HBH9 465 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 GPRC5CQ9NQ84 441 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 GPR27Q9NS67 375 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 STOML1Q9UBI4 398 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM170BA6NMN3 283 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF205O95201 554 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 FURINP09958 794 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 VAV1P15498 845 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 LTBRP36941 435 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 GUCY1A3Q02108 690 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 STRN3Q13033 797 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 EEF1DP3Q658K8 133 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 MFSD14AQ96MC6 490 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 ORAI3Q9BRQ5 295 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 CHPF2Q9P2E5 772 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 ARVCFO00192 962 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 BRINP1O60477 761 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 PLS3P13797 630 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 GUCY2FP51841 1108 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 OXCT1P55809 520 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 PIK3R6Q5UE93 754 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 DUSP27Q5VZP5 1158 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 IQCEQ6IPM2 695 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-207ENST00000470201 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa6.34□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.7 ms